More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_00120 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_01550  16S ribosomal RNA  90.32 
 
 		 1505 bp  1786    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00120  16S ribosomal RNA  100 
 
 		 1504 bp  2981    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0247514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0028  16S ribosomal RNA  85.45 
 
 		 1501 bp  674    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00232778 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0022  16S ribosomal RNA  85.45 
 
 		 1501 bp  674    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00263982 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0015  16S ribosomal RNA  85.45 
 
 		 1501 bp  674    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.484535 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08380  16S ribosomal RNA  90.38 
 
 		 1505 bp  1794    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.793427 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02350  16S ribosomal RNA  100 
 
 		 1504 bp  2981    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.52295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08960  16S ribosomal RNA  99.93 
 
 		 1504 bp  2974    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.272562 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0044  16S ribosomal RNA  84.91 
 
 		 1498 bp  656    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0040  16S ribosomal RNA  85.57 
 
 		 1512 bp  692    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.618682  normal  0.154867 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0048  16S ribosomal RNA  85.57 
 
 		 1512 bp  692    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.089973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0039  16S ribosomal RNA  91.29 
 
 		 1497 bp  1647    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000419568  normal  0.996544 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0036  16S ribosomal RNA  85.68 
 
 		 1509 bp  708    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.18027 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0012  16S ribosomal RNA  91.29 
 
 		 1497 bp  1647    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000389659  normal  0.664476 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0056  16S ribosomal RNA  91.29 
 
 		 1497 bp  1647    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000319256  normal  0.0498462 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0023  16S ribosomal RNA  84.91 
 
 		 1498 bp  656    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.582465  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0046  16S ribosomal RNA  89.13 
 
 		 1500 bp  1306    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.473893 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0046  16S ribosomal RNA  86.04 
 
 		 1505 bp  620  1e-175  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000115462  hitchhiker  0.000268456 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0049  16S ribosomal RNA  86.04 
 
 		 1505 bp  620  1e-175  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000269121  hitchhiker  0.000017659 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0044  16S ribosomal RNA  84 
 
 		 1511 bp  587  1.0000000000000001e-165  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0032  16S ribosomal RNA  84 
 
 		 1511 bp  587  1.0000000000000001e-165  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0004  16S ribosomal RNA  84 
 
 		 1511 bp  587  1.0000000000000001e-165  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.738852  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0015  16S ribosomal RNA  85.79 
 
 		 1508 bp  585  1e-164  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.414604  normal  0.187473 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0025  16S ribosomal RNA  85.52 
 
 		 1508 bp  569  1e-160  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.529637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0005  16S ribosomal RNA  85.23 
 
 		 1512 bp  557  1e-156  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.564871  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0027  16S ribosomal RNA  85.23 
 
 		 1512 bp  557  1e-156  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.931505  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0050  16S ribosomal RNA  85.23 
 
 		 1512 bp  557  1e-156  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.27302  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0018  16S ribosomal RNA  84.89 
 
 		 1517 bp  547  1e-153  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.298469  normal  0.903608 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0039  16S ribosomal RNA  84.89 
 
 		 1517 bp  547  1e-153  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0163381  hitchhiker  0.00923101 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0029  16S ribosomal RNA  84.3 
 
 		 1507 bp  511  9.999999999999999e-143  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.000204422  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0011  16S ribosomal RNA  84.3 
 
 		 1507 bp  511  9.999999999999999e-143  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0991443  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0024  16S ribosomal RNA  81.58 
 
 		 1641 bp  428  1e-117  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000839716  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0012  16S ribosomal RNA  81.58 
 
 		 1641 bp  428  1e-117  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00349266  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0018  16S ribosomal RNA  81.58 
 
 		 1641 bp  428  1e-117  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0132922  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0036  16S ribosomal RNA  81.58 
 
 		 1639 bp  428  1e-117  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15333  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0059  16S ribosomal RNA  81.58 
 
 		 1641 bp  428  1e-117  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.132182  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0084  16S ribosomal RNA  81.58 
 
 		 1641 bp  428  1e-117  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.19208  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0088  16S ribosomal RNA  81.58 
 
 		 1641 bp  428  1e-117  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00218417  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0007  16S ribosomal RNA  81.47 
 
 		 1641 bp  420  9.999999999999999e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000632051  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0024  16S ribosomal RNA  85.71 
 
 		 1536 bp  414  1e-113  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0022  16S ribosomal RNA  89.25 
 
 		 1513 bp  412  1.0000000000000001e-112  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00120724  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0029  16S ribosomal RNA  82.75 
 
 		 1486 bp  406  1e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0035  16S ribosomal RNA  82.75 
 
 		 1486 bp  406  1e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0064  16S ribosomal RNA  82.75 
 
 		 1486 bp  406  1e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00897748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0015  16S ribosomal RNA  82.75 
 
 		 1486 bp  406  1e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.857028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0015  16S ribosomal RNA  90.55 
 
 		 1510 bp  400  1e-109  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0026  16S ribosomal RNA  88.65 
 
 		 1546 bp  400  1e-109  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0007  16S ribosomal RNA  88.65 
 
 		 1546 bp  400  1e-109  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0001  16S ribosomal RNA  88.65 
 
 		 1546 bp  400  1e-109  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03860  16S ribosomal RNA  90.58 
 
 		 1632 bp  402  1e-109  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0341976  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14290    90.58 
 
 		 2926 bp  402  1e-109  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.1458  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0016  16S ribosomal RNA  90.55 
 
 		 1517 bp  400  1e-109  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.672174  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0021  16S ribosomal RNA  90.55 
 
 		 1517 bp  400  1e-109  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0029  16S ribosomal RNA  90.55 
 
 		 1517 bp  400  1e-109  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0064  16S ribosomal RNA  90.55 
 
 		 1517 bp  400  1e-109  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0067  16S ribosomal RNA  90.55 
 
 		 1517 bp  400  1e-109  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0036  16S ribosomal RNA  88.65 
 
 		 1546 bp  400  1e-109  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0020  16S ribosomal RNA  90.55 
 
 		 1510 bp  400  1e-109  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0069  16S ribosomal RNA  88.65 
 
 		 1546 bp  400  1e-109  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0053  16S ribosomal RNA  85.25 
 
 		 1545 bp  402  1e-109  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.271159  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0058  16S ribosomal RNA  85.25 
 
 		 1545 bp  402  1e-109  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0023  16S ribosomal RNA  88.65 
 
 		 1546 bp  400  1e-109  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0114  16S ribosomal RNA  88.65 
 
 		 1546 bp  400  1e-109  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0027  16S ribosomal RNA  90.55 
 
 		 1510 bp  400  1e-109  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000781199 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0065  16S ribosomal RNA  90.55 
 
 		 1510 bp  400  1e-109  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0062  16S ribosomal RNA  90.55 
 
 		 1510 bp  400  1e-109  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_16SA  16S ribosomal RNA  82.35 
 
 		 1518 bp  396  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00652559  hitchhiker  0.0000964592 
 
 
-
 
NC_002947  PP_16SB  16S ribosomal RNA  82.35 
 
 		 1518 bp  396  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109729  hitchhiker  0.000075441 
 
 
-
 
NC_002947  PP_16SC  16S ribosomal RNA  82.35 
 
 		 1518 bp  396  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0265668  normal  0.0523023 
 
 
-
 
NC_002947  PP_16SD  16S ribosomal RNA  82.35 
 
 		 1518 bp  396  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0245595  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_16SE  16S ribosomal RNA  82.35 
 
 		 1518 bp  396  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0197165  normal  0.135243 
 
 
-
 
NC_002947  PP_16SF  16S ribosomal RNA  82.35 
 
 		 1518 bp  396  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.229046  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_16SG  16S ribosomal RNA  82.35 
 
 		 1518 bp  396  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0126603 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0006  16S ribosomal RNA  82.35 
 
 		 1529 bp  396  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000203235  hitchhiker  0.00005391 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0099  16S ribosomal RNA  82.35 
 
 		 1529 bp  396  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000444541  normal  0.0479849 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0058  16S ribosomal RNA  82.35 
 
 		 1529 bp  396  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000207326  normal  0.764569 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0013  16S ribosomal RNA  82.35 
 
 		 1529 bp  396  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000882287  hitchhiker  0.00137418 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0014  16S ribosomal RNA  82.35 
 
 		 1529 bp  396  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000281309  normal  0.538779 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0089  16S ribosomal RNA  82.35 
 
 		 1529 bp  396  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000457884  normal  0.584695 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0056  16S ribosomal RNA  82.35 
 
 		 1529 bp  396  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000107545  normal  0.412337 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0001  16S ribosomal RNA  82.35 
 
 		 1529 bp  396  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000166692  normal  0.414119 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0080  16S ribosomal RNA  82.35 
 
 		 1529 bp  396  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00000320741  normal  0.041938 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0095  16S ribosomal RNA  82.35 
 
 		 1529 bp  396  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000226987  hitchhiker  0.00000501486 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0004  16S ribosomal RNA  82.35 
 
 		 1529 bp  396  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000534371  normal  0.567436 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0021  16S ribosomal RNA  82.35 
 
 		 1529 bp  396  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000142158  hitchhiker  0.000111868 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0090  16S ribosomal RNA  82.35 
 
 		 1529 bp  396  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0102  16S ribosomal RNA  82.35 
 
 		 1529 bp  396  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00000475362  normal  0.0274728 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0019  16S ribosomal RNA  90.52 
 
 		 1526 bp  396  1e-108  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.247582 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0061  16S ribosomal RNA  85.28 
 
 		 1546 bp  396  1e-108  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0011  16S ribosomal RNA  90.52 
 
 		 1525 bp  396  1e-108  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.202873  normal  0.511019 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0001  16S ribosomal RNA  82.35 
 
 		 1549 bp  396  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000584792  normal  0.761928 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0009  16S ribosomal RNA  82.35 
 
 		 1549 bp  396  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000805602  hitchhiker  0.000585754 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0018  16S ribosomal RNA  82.35 
 
 		 1549 bp  396  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000771769  normal  0.359976 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0031  16S ribosomal RNA  82.35 
 
 		 1549 bp  396  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000143019  normal  0.620108 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0064  16S ribosomal RNA  82.35 
 
 		 1538 bp  396  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000160038  normal  0.787377 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0093  16S ribosomal RNA  82.35 
 
 		 1538 bp  396  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000812377  hitchhiker  0.0037636 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0001  16S ribosomal RNA  85.05 
 
 		 1546 bp  394  1e-107  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000785651  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0015  16S ribosomal RNA  85.05 
 
 		 1545 bp  394  1e-107  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0298212  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0026  16S ribosomal RNA  85.05 
 
 		 1545 bp  394  1e-107  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.241508  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0119  16S ribosomal RNA  85.05 
 
 		 1545 bp  394  1e-107  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.570145  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>