More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_00010 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  100 
 
 		 506 aa  1054    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.993036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  51.08 
 
 		 501 aa  489  1e-137  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000175242  decreased coverage  0.000074483 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0002  chromosomal replication initiator protein DnaA  60.68 
 
 		 520 aa  433  1e-120  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000222997  hitchhiker  0.00000014852 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  30.56 
 
 		 509 aa  254  2.0000000000000002e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  32.27 
 
 		 454 aa  254  3e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00039195  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  31.05 
 
 		 458 aa  253  4.0000000000000004e-66  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5319  chromosomal replication initiation protein  32.06 
 
 		 446 aa  250  5e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.679479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0827  chromosomal replication initiation protein  31.84 
 
 		 492 aa  249  9e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0001  chromosomal replication initiation protein  32.06 
 
 		 446 aa  249  9e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000585905  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0001  chromosomal replication initiation protein  32.06 
 
 		 446 aa  248  1e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000594007  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0001  chromosomal replication initiation protein  32.06 
 
 		 446 aa  248  1e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000184902  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0001  chromosomal replication initiation protein  32.06 
 
 		 446 aa  248  2e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000244098  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0001  chromosomal replication initiation protein  32.06 
 
 		 446 aa  248  2e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000163866  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0001  chromosomal replication initiation protein  32.06 
 
 		 446 aa  248  2e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000459109  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0001  chromosomal replication initiation protein  32.06 
 
 		 446 aa  248  2e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000425777  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0001  chromosomal replication initiation protein  32.06 
 
 		 446 aa  248  2e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0001  chromosomal replication initiation protein  32.06 
 
 		 446 aa  247  4e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.562714  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0001  chromosomal replication initiation protein  31.46 
 
 		 450 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000447845  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0001  chromosomal replication initiation protein  31.1 
 
 		 446 aa  243  6e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000325337  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0001  chromosomal replication initiation protein  31.8 
 
 		 450 aa  242  1e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  30.69 
 
 		 453 aa  241  2e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000208022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0001  chromosomal replication initiation protein  31.26 
 
 		 495 aa  240  4e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0454037 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0001  chromosomal replication initiation protein  31.26 
 
 		 495 aa  240  4e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0009  chromosomal replication initiation protein  31.26 
 
 		 495 aa  240  4e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.166715  normal  0.0809665 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0001  chromosomal replication initiation protein  30.49 
 
 		 494 aa  239  9e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.124904  normal  0.26229 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0002  chromosomal replication initiation protein  29.75 
 
 		 442 aa  239  1e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0135977  hitchhiker  0.0000101386 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0001  chromosomal replication initiation protein  31.02 
 
 		 457 aa  238  2e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000597417  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0001  chromosomal replication initiation protein  38.11 
 
 		 457 aa  236  7e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000458864  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0001  chromosomal replication initiation protein  35.06 
 
 		 443 aa  236  8e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00172749  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  32.44 
 
 		 480 aa  236  9e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0001  chromosomal replication initiation protein  31.79 
 
 		 472 aa  235  1.0000000000000001e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000368077  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0001  chromosomal replication initiation protein  36.8 
 
 		 453 aa  234  3e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000795473  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0001  chromosomal replication initiation protein  36.8 
 
 		 453 aa  234  3e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.101414  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  32.13 
 
 		 447 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2553  chromosomal replication initiation protein  37.5 
 
 		 451 aa  233  4.0000000000000004e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000248403  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  39.27 
 
 		 528 aa  233  8.000000000000001e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.561876  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  31.72 
 
 		 527 aa  232  9e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0861644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10001  chromosomal replication initiation protein  30.3 
 
 		 507 aa  232  1e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  36.84 
 
 		 453 aa  231  2e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  30.17 
 
 		 503 aa  232  2e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  32.74 
 
 		 468 aa  231  2e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  37.39 
 
 		 591 aa  231  3e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.000633656  unclonable  0.0000000292755 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0198  chromosomal replication initiation protein  30.02 
 
 		 460 aa  230  4e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00733858  normal  0.0821352 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0001  chromosomal replication initiation protein  34.96 
 
 		 440 aa  230  4e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000118947  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0001  chromosomal replication initiation protein  29.8 
 
 		 453 aa  230  5e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2133  chromosomal replication initiation protein  30.58 
 
 		 489 aa  230  5e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.00000000845727  normal  0.662665 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  31.99 
 
 		 439 aa  229  8e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00780596  normal  0.982574 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  37.09 
 
 		 587 aa  229  1e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00000000718914  hitchhiker  0.000588843 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0001  initiation of chromosome replication  35.1 
 
 		 436 aa  229  1e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0391  chromosomal replication initiation protein  31.42 
 
 		 524 aa  229  1e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.246214  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  33.82 
 
 		 506 aa  228  2e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0001  chromosomal replication initiation protein  30.15 
 
 		 479 aa  228  3e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0301114  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0001  chromosomal replication initiation protein  30.51 
 
 		 475 aa  227  5.0000000000000005e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.738182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0003  chromosomal replication initiation protein  32.24 
 
 		 453 aa  226  6e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0001  chromosomal replication initiation protein  30.14 
 
 		 473 aa  226  9e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1100  chromosomal replication initiation protein  31.33 
 
 		 482 aa  226  9e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.018395 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4144  chromosomal replication initiation protein  30.14 
 
 		 473 aa  226  1e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.274258 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0001  chromosomal replication initiation protein  29.62 
 
 		 465 aa  225  1e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000010295  decreased coverage  0.002869 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0001  chromosomal replication initiation protein  30.12 
 
 		 492 aa  226  1e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.943807  normal  0.152297 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0001  chromosomal replication initiation protein  32.24 
 
 		 453 aa  225  1e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.755155  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  28.57 
 
 		 464 aa  224  2e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00240104  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  31.15 
 
 		 450 aa  225  2e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000842824  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0001  chromosomal replication initiation protein  29.26 
 
 		 492 aa  224  3e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.983579  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  30.02 
 
 		 470 aa  224  3e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000133107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0001  chromosomal replication initiation protein  37.14 
 
 		 454 aa  224  3e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0001  chromosomal replication initiation protein  30.14 
 
 		 483 aa  224  3e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  30.94 
 
 		 439 aa  224  3e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000109214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0001  chromosomal replication initiation protein  28.85 
 
 		 500 aa  223  6e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0001  chromosomal replication initiation protein  29.8 
 
 		 465 aa  223  8e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00156244  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0001  chromosomal replication initiation protein  29.45 
 
 		 468 aa  223  8e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0688864  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  30.24 
 
 		 534 aa  223  8e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  29.84 
 
 		 443 aa  223  8e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2371  chromosomal replication initiation protein  31.34 
 
 		 443 aa  223  9e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0166544  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0001  chromosomal replication initiation protein  36.31 
 
 		 460 aa  222  9.999999999999999e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.831436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1436  chromosomal replication initiation protein  30.22 
 
 		 500 aa  222  9.999999999999999e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.723228  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0001  chromosomal replication initiation protein  29.21 
 
 		 451 aa  222  9.999999999999999e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00187127  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0001  chromosomal replication initiation protein  31.09 
 
 		 456 aa  222  9.999999999999999e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0001  chromosomal replication initiation protein  29.21 
 
 		 451 aa  222  9.999999999999999e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.000000000123931  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0045  chromosomal replication initiator protein DnaA  37.61 
 
 		 539 aa  221  1.9999999999999999e-56  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  29.72 
 
 		 469 aa  221  1.9999999999999999e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.280164  normal  0.937405 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2357  chromosomal replication initiator protein DnaA  29.59 
 
 		 476 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.048166  normal  0.586326 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2833  chromosomal replication initiation protein  28.66 
 
 		 448 aa  221  1.9999999999999999e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0001  chromosomal replication initiation protein  29.45 
 
 		 467 aa  221  3e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000185056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4153  chromosomal replication initiation protein  28.54 
 
 		 462 aa  221  3e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  7.6269e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4177  chromosomal replication initiation protein  28.54 
 
 		 462 aa  221  3e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510804  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  28.77 
 
 		 480 aa  220  3.9999999999999997e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0206444  normal  0.0774659 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0001  chromosomal replication initiation protein  29.27 
 
 		 461 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000102323  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  29.94 
 
 		 474 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00208216  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03585  chromosomal replication initiation protein  29.45 
 
 		 467 aa  220  5e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0183504  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  29.45 
 
 		 467 aa  220  5e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000136922  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0003  chromosomal replication initiator protein DnaA  29.14 
 
 		 519 aa  220  5e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000118183  unclonable  1.2245600000000001e-24 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3915  chromosomal replication initiation protein  29.45 
 
 		 467 aa  220  5e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.000000126813  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4212  chromosomal replication initiation protein  29.45 
 
 		 467 aa  220  5e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000201887  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5130  chromosomal replication initiation protein  29.54 
 
 		 467 aa  220  5e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000558594  normal  0.0494414 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03529  hypothetical protein  29.45 
 
 		 467 aa  220  5e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00951486  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4067  chromosomal replication initiation protein  29.45 
 
 		 467 aa  220  5e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000102031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0001  chromosomal replication initiation protein  33 
 
 		 465 aa  219  6e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00429077  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  34.3 
 
 		 652 aa  220  6e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.00000505913  hitchhiker  0.00770539 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0002  chromosomal replication initiation protein  31.46 
 
 		 481 aa  220  6e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0480088  hitchhiker  0.0000132312 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  29.69 
 
 		 490 aa  219  8.999999999999998e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.428353  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>