19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_R0049 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_R0049  tRNA-Pro  100 
 
 		 78 bp  155  2e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0013  tRNA-Pro  88.46 
 
 		 78 bp  83.8  0.000000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.293207  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0045  tRNA-Pro  88.46 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000857544  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0067  tRNA-Pro  86.67 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.588797  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0038  tRNA-Pro  88.46 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000000418206  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0031  tRNA-Pro  90.7 
 
 		 79 bp  54  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0027  tRNA-Pro  100 
 
 		 78 bp  52  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000000011857  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0055  tRNA-Pro  85.96 
 
 		 78 bp  50.1  0.00007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000146939  hitchhiker  0.0000109613 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0033  tRNA-Pro  85.96 
 
 		 78 bp  50.1  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0048  tRNA-Pro  87.23 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0039  tRNA-Pro  88.24 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0035  tRNA-Pro  86.96 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124879  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0058  tRNA-Pro  86.96 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000210923  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0042  tRNA-Pro  96.15 
 
 		 78 bp  44.1  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.354382  normal  0.128638 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0030  tRNA-Pro  96.15 
 
 		 78 bp  44.1  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.249196  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0035  tRNA-Pro  86.96 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000012695  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0029  tRNA-Pro  82.05 
 
 		 78 bp  44.1  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0029  tRNA-Pro  86.96 
 
 		 78 bp  44.1  0.005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0050  tRNA-Pro  96.15 
 
 		 78 bp  44.1  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0166899  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>