More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_3486 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_3486  tRNA modification GTPase TrmE  100 
 
 
460 aa  914    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2365  tRNA modification GTPase TrmE  62.99 
 
 
459 aa  577  1.0000000000000001e-163  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3429  tRNA modification GTPase TrmE  49.67 
 
 
461 aa  468  1.0000000000000001e-131  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000224644  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0003  tRNA modification GTPase TrmE  46.83 
 
 
459 aa  453  1.0000000000000001e-126  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000387737  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3557  tRNA modification GTPase TrmE  49.02 
 
 
462 aa  449  1e-125  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5635  tRNA modification GTPase TrmE  48.36 
 
 
458 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5337  tRNA modification GTPase TrmE  48.36 
 
 
458 aa  438  9.999999999999999e-123  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5165  tRNA modification GTPase TrmE  48.36 
 
 
458 aa  438  9.999999999999999e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5181  tRNA modification GTPase TrmE  48.36 
 
 
458 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0853003  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4024  tRNA modification GTPase TrmE  47.92 
 
 
458 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2734  tRNA modification GTPase TrmE  47.05 
 
 
459 aa  439  9.999999999999999e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5734  tRNA modification GTPase TrmE  48.36 
 
 
458 aa  438  9.999999999999999e-123  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2791  tRNA modification GTPase TrmE  47.05 
 
 
459 aa  439  9.999999999999999e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5671  tRNA modification GTPase TrmE  48.58 
 
 
458 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5594  tRNA modification GTPase TrmE  48.36 
 
 
458 aa  438  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0320926 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2409  tRNA modification GTPase TrmE  48.47 
 
 
460 aa  435  1e-121  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.605137  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5324  tRNA modification GTPase TrmE  48.14 
 
 
458 aa  436  1e-121  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0322996 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5277  tRNA modification GTPase TrmE  47.92 
 
 
458 aa  437  1e-121  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5611  tRNA modification GTPase TrmE  48.14 
 
 
458 aa  436  1e-121  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.292564  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1940  tRNA modification GTPase TrmE  47.16 
 
 
462 aa  429  1e-119  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000114309  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23560  tRNA modification GTPase TrmE  46.62 
 
 
463 aa  429  1e-119  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.690968  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4365  tRNA modification GTPase TrmE  46.9 
 
 
461 aa  424  1e-117  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2930  tRNA modification GTPase TrmE  47.05 
 
 
458 aa  424  1e-117  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.137366  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1895  tRNA modification GTPase TrmE  46.49 
 
 
461 aa  424  1e-117  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  1.51566e-21 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0876  tRNA modification GTPase TrmE  46.51 
 
 
458 aa  418  9.999999999999999e-116  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000254143  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3324  tRNA modification GTPase TrmE  46.78 
 
 
461 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2547  tRNA modification GTPase TrmE  45.08 
 
 
455 aa  414  1e-114  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0992  tRNA modification GTPase TrmE  46.72 
 
 
456 aa  414  1e-114  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00719085  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2758  tRNA modification GTPase TrmE  46.41 
 
 
455 aa  392  1e-108  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.294935  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2992  tRNA modification GTPase TrmE  46.67 
 
 
458 aa  391  1e-107  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2669  tRNA modification GTPase TrmE  46.67 
 
 
458 aa  391  1e-107  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4058  tRNA modification GTPase TrmE  44.37 
 
 
455 aa  391  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.239105  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4148  tRNA modification GTPase TrmE  44.06 
 
 
455 aa  387  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0569  tRNA modification GTPase TrmE  42.27 
 
 
458 aa  379  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2519  tRNA modification GTPase TrmE  41.88 
 
 
462 aa  375  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190608 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3941  tRNA modification GTPase TrmE  44.88 
 
 
458 aa  378  1e-103  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4428  tRNA modification GTPase TrmE  44.03 
 
 
455 aa  378  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1989  tRNA modification GTPase TrmE  42.12 
 
 
463 aa  374  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.858955 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3465  tRNA modification GTPase TrmE  42.73 
 
 
456 aa  370  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3560  tRNA modification GTPase TrmE  43.6 
 
 
457 aa  371  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2233  tRNA modification GTPase TrmE  44.25 
 
 
461 aa  371  1e-101  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4203  tRNA modification GTPase TrmE  41.48 
 
 
460 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4164  tRNA modification GTPase TrmE  41.27 
 
 
460 aa  365  1e-99  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1908  tRNA modification GTPase TrmE  41.21 
 
 
464 aa  363  3e-99  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.991823  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0097  tRNA modification GTPase TrmE  43.14 
 
 
455 aa  362  9e-99  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3142  tRNA modification GTPase TrmE  42.42 
 
 
461 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.108144  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4774  tRNA modification GTPase TrmE  41.85 
 
 
467 aa  356  5e-97  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.149576 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1733  tRNA modification GTPase TrmE  41.3 
 
 
452 aa  354  2e-96  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000059641  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1582  tRNA modification GTPase TrmE  40.61 
 
 
462 aa  354  2e-96  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2945  tRNA modification GTPase TrmE  40.74 
 
 
465 aa  352  8e-96  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0139032  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3641  tRNA modification GTPase TrmE  39.01 
 
 
460 aa  347  3e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2572  GTPase  42.33 
 
 
459 aa  343  5e-93  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.329632  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3656  tRNA modification GTPase TrmE  40.3 
 
 
460 aa  340  2e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0657  tRNA modification GTPase TrmE  43.6 
 
 
450 aa  340  4e-92  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4133  tRNA modification GTPase TrmE  44.44 
 
 
456 aa  339  5.9999999999999996e-92  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4957  tRNA modification GTPase TrmE  40.26 
 
 
459 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000028541  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3441  tRNA modification GTPase TrmE  38.91 
 
 
454 aa  335  7e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0681  tRNA modification GTPase TrmE  42.73 
 
 
450 aa  335  1e-90  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.570227  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2889  tRNA modification GTPase TrmE  39.57 
 
 
464 aa  327  2.0000000000000001e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4729  tRNA modification GTPase TrmE  38.53 
 
 
454 aa  326  5e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622363  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3622  tRNA modification GTPase TrmE  42.55 
 
 
456 aa  325  7e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2453  tRNA modification GTPase TrmE  40.62 
 
 
450 aa  324  2e-87  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02641  tRNA modification GTPase TrmE  40.04 
 
 
464 aa  321  1.9999999999999998e-86  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3161  tRNA modification GTPase TrmE  40.04 
 
 
471 aa  321  1.9999999999999998e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.258894  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1556  tRNA modification GTPase TrmE  39.83 
 
 
464 aa  320  3e-86  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2136  tRNA modification GTPase TrmE  39.51 
 
 
451 aa  317  2e-85  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0977  tRNA modification GTPase TrmE  42.17 
 
 
447 aa  313  2.9999999999999996e-84  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000239803  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2137  tRNA modification GTPase TrmE  35.95 
 
 
461 aa  311  1e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.075642 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2025  tRNA modification GTPase TrmE  37.66 
 
 
473 aa  310  5e-83  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.208875 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2373  tRNA modification GTPase TrmE  37.61 
 
 
473 aa  309  6.999999999999999e-83  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2030  tRNA modification GTPase TrmE  38.95 
 
 
460 aa  308  2.0000000000000002e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.312338  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02071  tRNA modification GTPase TrmE  38.95 
 
 
460 aa  307  3e-82  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.214831  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02091  tRNA modification GTPase TrmE  38.73 
 
 
460 aa  306  5.0000000000000004e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.146144  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2599  tRNA modification GTPase TrmE  37.58 
 
 
470 aa  306  5.0000000000000004e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.652843  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02071  tRNA modification GTPase TrmE  39.91 
 
 
455 aa  306  7e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.828373  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0248  tRNA modification GTPase TrmE  37.2 
 
 
473 aa  305  8.000000000000001e-82  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0217  tRNA modification GTPase TrmE  36.7 
 
 
476 aa  303  3.0000000000000004e-81  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0500389  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3159  tRNA modification GTPase TrmE  36.72 
 
 
457 aa  304  3.0000000000000004e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2124  tRNA modification GTPase TrmE  39.83 
 
 
452 aa  304  3.0000000000000004e-81  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0199  tRNA modification GTPase TrmE  39.83 
 
 
473 aa  303  4.0000000000000003e-81  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2707  tRNA modification GTPase TrmE  38.81 
 
 
466 aa  302  8.000000000000001e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.622975  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0070  tRNA modification GTPase TrmE  38.36 
 
 
444 aa  300  2e-80  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.868206  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02181  tRNA modification GTPase TrmE  38.61 
 
 
461 aa  301  2e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1430  tRNA modification GTPase TrmE  36.3 
 
 
461 aa  300  3e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.299442  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0643  tRNA modification GTPase TrmE  42.05 
 
 
452 aa  300  5e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.461676 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3279  tRNA modification GTPase TrmE  36.07 
 
 
458 aa  298  1e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.768989 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12578  putative tRNA modification GTPase  36.71 
 
 
469 aa  297  2e-79  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0153  tRNA modification GTPase TrmE  36.91 
 
 
475 aa  297  2e-79  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0191  tRNA modification GTPase TrmE  38.07 
 
 
460 aa  296  4e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.377202  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2195  tRNA modification GTPase TrmE  36.74 
 
 
475 aa  295  1e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1409  tRNA modification GTPase TrmE  40.22 
 
 
452 aa  295  1e-78  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1336  tRNA modification GTPase TrmE  39.87 
 
 
441 aa  295  1e-78  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27541  tRNA modification GTPase TrmE  39.02 
 
 
465 aa  293  3e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0886  tRNA modification GTPase TrmE  35.62 
 
 
478 aa  293  4e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00940326 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1734  tRNA modification GTPase TrmE  35.37 
 
 
437 aa  292  1e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2392  tRNA modification GTPase TrmE  34.62 
 
 
468 aa  291  2e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0118764  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1915  tRNA modification GTPase TrmE  37.58 
 
 
457 aa  289  7e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.410866  normal  0.314403 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0018  tRNA modification GTPase TrmE  37.64 
 
 
438 aa  288  1e-76  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4200  tRNA modification GTPase TrmE  38.79 
 
 
448 aa  287  2e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0153583 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2779  tRNA modification GTPase TrmE  36.4 
 
 
473 aa  288  2e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>