More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_3431 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  100 
 
 		 509 aa  1047    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  64.2 
 
 		 502 aa  650    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  53.68 
 
 		 500 aa  555  1e-157  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0722  xylulokinase  54.03 
 
 		 511 aa  549  1e-155  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  52.76 
 
 		 518 aa  551  1e-155  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  52.28 
 
 		 509 aa  538  9.999999999999999e-153  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  53.54 
 
 		 512 aa  534  1e-150  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  49.6 
 
 		 515 aa  529  1e-149  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  49.61 
 
 		 501 aa  522  1e-147  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2620  xylulokinase  48.62 
 
 		 506 aa  514  1e-144  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  49.31 
 
 		 496 aa  509  1e-143  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  49.41 
 
 		 498 aa  511  1e-143  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2886  xylulokinase  48.81 
 
 		 504 aa  508  1e-143  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0904  xylulokinase  51.1 
 
 		 505 aa  481  1e-134  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.130402 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3052  xylulokinase  43.98 
 
 		 511 aa  446  1.0000000000000001e-124  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  43.22 
 
 		 509 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  42.41 
 
 		 500 aa  443  1e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1763  xylulokinase  45.26 
 
 		 499 aa  434  1e-120  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  40.55 
 
 		 499 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  40.84 
 
 		 492 aa  409  1e-113  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  40.84 
 
 		 492 aa  409  1e-113  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3419  xylulokinase  41.14 
 
 		 488 aa  398  1e-109  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000613693  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0131  xylulokinase  41.58 
 
 		 503 aa  398  1e-109  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.435122  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  40.56 
 
 		 489 aa  394  1e-108  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1517  carbohydrate kinase  38.57 
 
 		 517 aa  379  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.128905 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2770  xylulokinase  39.41 
 
 		 511 aa  379  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2691  carbohydrate kinase  38.57 
 
 		 517 aa  379  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2099  D-xylulose kinase  38.1 
 
 		 496 aa  371  1e-101  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2819  xylulokinase  41.53 
 
 		 484 aa  369  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.416999  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0224  xylulokinase  40.6 
 
 		 483 aa  363  6e-99  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1732  xylulose kinase  37.55 
 
 		 494 aa  360  2e-98  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0224  xylulokinase  40.35 
 
 		 490 aa  358  9e-98  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0097  xylulokinase  40.4 
 
 		 483 aa  357  1.9999999999999998e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0703  xylulokinase  40.04 
 
 		 487 aa  357  1.9999999999999998e-97  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.872008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1006  carbohydrate kinase FGGY  37.25 
 
 		 503 aa  351  1e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00908398  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0157  xylulokinase  43.21 
 
 		 484 aa  351  2e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0588  xylulokinase (xylulose kinase)  39.19 
 
 		 486 aa  351  2e-95  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0697  xylulokinase  39.45 
 
 		 499 aa  350  3e-95  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0014259 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4438  xylulokinase  42.76 
 
 		 485 aa  350  4e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0150  xylulokinase  39.88 
 
 		 484 aa  350  4e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03416  xylulokinase  39.88 
 
 		 484 aa  349  8e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03367  hypothetical protein  39.88 
 
 		 484 aa  349  8e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3767  xylulokinase  39.88 
 
 		 484 aa  349  8e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4156  xylulokinase  40.28 
 
 		 485 aa  348  1e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0055  xylulokinase  39.56 
 
 		 484 aa  348  1e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0146  xylulokinase  39.68 
 
 		 484 aa  348  2e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4940  xylulokinase  39.88 
 
 		 484 aa  347  2e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0856501 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3887  xylulokinase  39.47 
 
 		 484 aa  347  3e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4162  xylulose kinase  39.68 
 
 		 484 aa  346  6e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618416  normal  0.0143871 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4103  xylulokinase  39.68 
 
 		 484 aa  345  1e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6659  xylulokinase  38.61 
 
 		 486 aa  345  2e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4060  xylulokinase  39.68 
 
 		 484 aa  343  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3725  xylulokinase  38.2 
 
 		 492 aa  342  7e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1868  xylulokinase  41.57 
 
 		 482 aa  340  2.9999999999999998e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.933233  normal  0.588405 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3710  xylulokinase  39.19 
 
 		 484 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.917033  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0077  xylulokinase  39.52 
 
 		 486 aa  338  9.999999999999999e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0132  xylulokinase  37.62 
 
 		 496 aa  337  1.9999999999999998e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.162788 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3239  xylulokinase  37.27 
 
 		 493 aa  336  5e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0711  xylulokinase  37.07 
 
 		 493 aa  334  2e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133304  normal  0.321935 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0059  xylulokinase  39.36 
 
 		 486 aa  334  2e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2128  putative D-arabinitol kinase protein  37.75 
 
 		 491 aa  332  1e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.449223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3983  xylulokinase  37.95 
 
 		 484 aa  330  3e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.308981  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2391  carbohydrate kinase FGGY  34.91 
 
 		 497 aa  330  4e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3874  xylulokinase  37.95 
 
 		 484 aa  330  4e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1976  xylulokinase  36.49 
 
 		 493 aa  330  4e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.775645  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2586  xylulokinase  36.49 
 
 		 493 aa  330  4e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220049  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5917  xylulokinase  36.6 
 
 		 493 aa  330  5.0000000000000004e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2791  xylulokinase  37.17 
 
 		 484 aa  329  6e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.504033  normal  0.565277 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2610  xylulokinase  36.49 
 
 		 493 aa  329  7e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.246925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3833  xylulokinase  38.38 
 
 		 489 aa  328  1.0000000000000001e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.967873  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3938  xylulokinase  37.75 
 
 		 484 aa  328  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.856967 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4043  xylulokinase  37.55 
 
 		 484 aa  327  3e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.145832  normal  0.120116 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3412  xylulokinase  37.37 
 
 		 485 aa  327  4.0000000000000003e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2634  xylulokinase  36.42 
 
 		 493 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0550  xylulokinase  37.78 
 
 		 483 aa  326  5e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0548  xylulokinase  37.78 
 
 		 483 aa  326  5e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.560227  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6328  xylulokinase  40.43 
 
 		 492 aa  326  6e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1198  xylulokinase  36.17 
 
 		 488 aa  326  7e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.64875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0497  xylulokinase  36.33 
 
 		 494 aa  325  1e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71509  normal  0.01013 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6505  xylulokinase  40.24 
 
 		 492 aa  325  1e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6739  xylulokinase  40.24 
 
 		 492 aa  325  1e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0801458  normal  0.563999 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3412  xylulokinase  37.58 
 
 		 484 aa  323  3e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.636398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2505  xylulokinase  36.02 
 
 		 493 aa  323  3e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0356237  normal  0.488907 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0729  xylulokinase  36.47 
 
 		 493 aa  323  5e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0502  xylulokinase  35.76 
 
 		 496 aa  320  3e-86  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0394254  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2713  xylulose kinase  35.93 
 
 		 485 aa  320  3e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0237  xylulokinase  38.25 
 
 		 486 aa  319  7e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1656  xylulokinase  38.25 
 
 		 486 aa  319  7.999999999999999e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.889036  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2464  xylulokinase  37.78 
 
 		 484 aa  318  1e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.542449 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2691  xylulokinase  36.62 
 
 		 501 aa  318  1e-85  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3807  xylulokinase  36.97 
 
 		 481 aa  318  2e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.702656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0702  xylulokinase  36.93 
 
 		 493 aa  317  2e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4208  xylulokinase  39.72 
 
 		 492 aa  318  2e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0365818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6333  xylulokinase  39.44 
 
 		 492 aa  318  2e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1173  xylulokinase  37.79 
 
 		 486 aa  317  3e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000934305  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5066  xylulokinase  37.79 
 
 		 488 aa  317  3e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.442874  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5794  xylulokinase  37.79 
 
 		 488 aa  317  3e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1088  xylulokinase  39.92 
 
 		 495 aa  317  3e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000712825 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6033  xylulokinase  39.96 
 
 		 492 aa  317  4e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.629819  normal  0.638126 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1117  xylulokinase  36.18 
 
 		 491 aa  315  9.999999999999999e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>