153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_3426 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_0769  glycoside hydrolase family protein  71.88 
 
 
440 aa  686    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3426  glycoside hydrolase family 4  100 
 
 
441 aa  919    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3103  glycoside hydrolase family protein  67.27 
 
 
435 aa  619  1e-176  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.199701 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23300  glycoside hydrolase family 4  66.89 
 
 
432 aa  616  1e-175  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0797  glycoside hydrolase family 4  61.82 
 
 
432 aa  569  1e-161  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.482234  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0137  glycoside hydrolase family 4  53.35 
 
 
439 aa  451  1.0000000000000001e-126  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1937  glycoside hydrolase family protein  51.89 
 
 
437 aa  441  9.999999999999999e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.204989 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3180  glycoside hydrolase family 4  52.24 
 
 
449 aa  441  9.999999999999999e-123  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.744727  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1884  glycoside hydrolase family protein  48.42 
 
 
468 aa  429  1e-119  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0104687 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2891  glycoside hydrolase family protein  48.52 
 
 
468 aa  423  1e-117  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51420  alpha-galactosidase  50.56 
 
 
441 aa  423  1e-117  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4144  glycoside hydrolase family protein  48.78 
 
 
457 aa  421  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.663959 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4673  alpha-galactosidase  49.22 
 
 
451 aa  415  9.999999999999999e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3908  glycoside hydrolase family protein  49.22 
 
 
451 aa  415  9.999999999999999e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03990  alpha-galactosidase, NAD(P)-binding  49.11 
 
 
451 aa  415  1e-114  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3873  glycoside hydrolase family 4  49 
 
 
451 aa  412  1e-114  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03951  hypothetical protein  49.11 
 
 
451 aa  415  1e-114  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4360  alpha-galactosidase  49.22 
 
 
451 aa  414  1e-114  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6873  glycoside hydrolase family 4  47.99 
 
 
456 aa  413  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4585  alpha-galactosidase  49.11 
 
 
451 aa  414  1e-114  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4644  alpha-galactosidase  48.67 
 
 
451 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4553  alpha-galactosidase  48.67 
 
 
451 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226909  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4562  alpha-galactosidase  48.44 
 
 
451 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4693  alpha-galactosidase  48.44 
 
 
451 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.44607  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5633  alpha-galactosidase  49.11 
 
 
451 aa  413  1e-114  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5368  glycoside hydrolase family 4  49.55 
 
 
438 aa  409  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.265798 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4644  alpha-galactosidase  48.22 
 
 
451 aa  411  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5903  glycoside hydrolase family 4  47.54 
 
 
456 aa  410  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.670067 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4755  glycoside hydrolase family 4  49.44 
 
 
438 aa  410  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5115  alpha-galactosidase  45.98 
 
 
453 aa  402  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1245  glycoside hydrolase family 4  46.53 
 
 
446 aa  404  1e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.778162 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3239  glycoside hydrolase family protein  45.67 
 
 
474 aa  384  1e-105  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5795  glycoside hydrolase family 4  43.64 
 
 
430 aa  357  1.9999999999999998e-97  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4649  glycoside hydrolase family 4  42.32 
 
 
435 aa  340  2.9999999999999998e-92  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1104  glycoside hydrolase family 4  43.18 
 
 
438 aa  333  3e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3958  glycoside hydrolase family 4  41.5 
 
 
439 aa  326  6e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0384  glycoside hydrolase family 4  40.18 
 
 
441 aa  324  2e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01850  family 4 glycosyl hydrolase, alpha-galactosidase/6-phospho-beta-glucosidase  40.86 
 
 
435 aa  314  1.9999999999999998e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4885  glycoside hydrolase family 4  41.57 
 
 
430 aa  313  5.999999999999999e-84  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4484  glycoside hydrolase family 4  39.07 
 
 
439 aa  309  6.999999999999999e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0542529  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0216  glycoside hydrolase family 4  38.36 
 
 
441 aa  304  3.0000000000000004e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05010  family 4 glycosyl hydrolase, alpha-galactosidase/6-phospho-beta-glucosidase  37.88 
 
 
462 aa  298  1e-79  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4693  glycoside hydrolase family 4  38.6 
 
 
443 aa  268  1e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0209787  normal  0.517895 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2617  glycoside hydrolase family 4  32.82 
 
 
447 aa  236  6e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0255431  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1002  glycoside hydrolase family 4  35.82 
 
 
489 aa  236  8e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6878  glycoside hydrolase family 4  32.66 
 
 
488 aa  221  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.036749  normal  0.397906 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5908  glycoside hydrolase family 4  32.89 
 
 
488 aa  220  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5121  alpha-galactosidase  32.66 
 
 
490 aa  212  1e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.642601  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4139  glycoside hydrolase family protein  33.63 
 
 
490 aa  211  3e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0382  glycoside hydrolase family 4  32.87 
 
 
426 aa  196  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.126645  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0445  glycoside hydrolase family protein  29.7 
 
 
426 aa  189  1e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.482345  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0440  glycoside hydrolase family 4  29.26 
 
 
460 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.41841  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0811  glycoside hydrolase family 4  29.45 
 
 
452 aa  173  5e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000139039  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2523  glycoside hydrolase family protein  28.48 
 
 
453 aa  171  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3895  glycoside hydrolase family 4  28.21 
 
 
475 aa  165  2.0000000000000002e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.206792  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3396  glycoside hydrolase family protein  28.04 
 
 
466 aa  157  3e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00346279  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4787  glycoside hydrolase family 4  27.37 
 
 
476 aa  157  3e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0488645  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2028  glycoside hydrolase family 4  28.82 
 
 
463 aa  155  1e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2848  glycoside hydrolase family protein  26.9 
 
 
487 aa  153  5.9999999999999996e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0159  glycoside hydrolase family 4  26.83 
 
 
474 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.075998  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0695  glycoside hydrolase family 4  27.69 
 
 
452 aa  141  3e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1458  glycoside hydrolase family 4  28.82 
 
 
410 aa  133  6.999999999999999e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.453391  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4591  glycoside hydrolase family protein  26.91 
 
 
435 aa  132  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0863  glycoside hydrolase family 4  26.27 
 
 
485 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.686198  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4045  maltose-6'-phosphate glucosidase  25.97 
 
 
440 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4901  6-phospho-beta-glucosidase  28.1 
 
 
441 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4886  6-phospho-beta-glucosidase  28.1 
 
 
441 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3871  glycoside hydrolase family 4  26.59 
 
 
436 aa  129  8.000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3751  glycoside hydrolase family protein  28.32 
 
 
441 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03565  predicted 6-phospho-beta-glucosidase  25.32 
 
 
440 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5056  6-phospho-beta-glucosidase  27.53 
 
 
441 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5441  6-phospho-beta-glucosidase  27.53 
 
 
441 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03508  hypothetical protein  25.32 
 
 
440 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5328  6-phospho-beta-glucosidase  27.53 
 
 
441 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5297  6-phospho-beta-glucosidase  27.88 
 
 
441 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000744026 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3893  maltose-6'-phosphate glucosidase  25.75 
 
 
440 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0021  glycoside hydrolase family protein  25.6 
 
 
440 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5112  maltose-6'-phosphate glucosidase  25.75 
 
 
440 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.694911 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5318  6-phospho-beta-glucosidase  27.53 
 
 
441 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0903  6-phospho-beta-glucosidase  27.55 
 
 
440 aa  127  5e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.851589  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5001  6-phospho-beta-glucosidase  27.53 
 
 
441 aa  127  5e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5373  6-phospho-beta-glucosidase  27.53 
 
 
441 aa  127  5e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3310  glycoside hydrolase family 4  28.23 
 
 
447 aa  125  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5631  6-phospho-beta-glucosidase  27.09 
 
 
441 aa  125  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000180851 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2132  glycoside hydrolase family 4  24.61 
 
 
432 aa  123  5e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1511  Alpha-galactosidase  24.32 
 
 
460 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.408355  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3951  6-phospho-beta-glucosidase  25.22 
 
 
437 aa  121  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0241  glycoside hydrolase family protein  25.22 
 
 
437 aa  121  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1024  putative 6-phospho-beta-glucosidase  27.41 
 
 
440 aa  122  1.9999999999999998e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3322  Maltose-6'-phosphate glucosidase  27.72 
 
 
442 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03622  6-phospho-beta-glucosidase  26.75 
 
 
440 aa  119  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0018  glycoside hydrolase family protein  26.24 
 
 
440 aa  118  1.9999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0472  glycoside hydrolase family 4  26.96 
 
 
468 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.507113  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3345  glycoside hydrolase family 4  26.68 
 
 
441 aa  117  6e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3661  glycoside hydrolase family 4  28.08 
 
 
446 aa  117  6e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1677  glycoside hydrolase family 4  27.17 
 
 
416 aa  116  6.9999999999999995e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002438  6-phospho-beta-glucosidase  26.54 
 
 
440 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00830  family 4 glycosyl hydrolase, alpha-galactosidase/6-phospho-beta-glucosidase  24.09 
 
 
485 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1857  glycoside hydrolase family protein  24.73 
 
 
433 aa  114  3e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01703  cryptic phospho-beta-glucosidase, NAD(P)-binding  25.11 
 
 
450 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.657115  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>