116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_3421 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_3421  peptidase M14 carboxypeptidase A  100 
 
 
406 aa  831  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  1.58618e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2387  gamma-D-glutamyl-{L}-meso-diaminopimelate peptidase I. metallo peptidase. MEROPS family M14C  33.21 
 
 
423 aa  147  2e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0658  peptidase M14 carboxypeptidase A  30.59 
 
 
379 aa  141  2e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.481628  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2377  Gamma-D-glutamyl-meso-diaminopimelate peptidase  28.28 
 
 
388 aa  102  8e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0196  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.89 
 
 
386 aa  102  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2507  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.19 
 
 
378 aa  80.5  5e-14  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21250  predicted carboxypeptidase  25.62 
 
 
403 aa  79  1e-13  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.39208  normal  0.631814 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1701  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.7 
 
 
1034 aa  71.6  2e-11  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00157811 
 
 
-
 
NC_002950  PG0232  zinc carboxypeptidase, putative  28.82 
 
 
821 aa  70.1  6e-11  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1703  peptidase M14, carboxypeptidase A  25.24 
 
 
1034 aa  69.3  1e-10  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.504762 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3105  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.38 
 
 
632 aa  67.8  3e-10  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000214938  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2664  peptidase M14 carboxypeptidase A  30.53 
 
 
365 aa  65.9  1e-09  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00317155  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4082  peptidase M14, carboxypeptidase A  24.36 
 
 
626 aa  61.6  2e-08  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.221076  normal  0.0678076 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4502  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.09 
 
 
628 aa  61.2  3e-08  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.040263 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1204  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.8 
 
 
262 aa  60.1  7e-08  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.670707  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2489  peptidase M14 carboxypeptidase A  23.71 
 
 
1074 aa  60.1  7e-08  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5723  peptidase M14 carboxypeptidase A  21.99 
 
 
439 aa  59.7  8e-08  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3329  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.23 
 
 
453 aa  58.5  2e-07  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2457  peptidase M14, carboxypeptidase A  27.57 
 
 
889 aa  58.5  2e-07  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0889296  normal  0.334441 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42459  predicted protein  24.67 
 
 
356 aa  58.9  2e-07  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2914  carboxypeptidase A  27.49 
 
 
429 aa  57.4  5e-07  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0180927  decreased coverage  4.27177e-05 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2953  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.12 
 
 
773 aa  57  6e-07  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1183  peptidase M14 carboxypeptidase A  24.74 
 
 
1061 aa  56.2  1e-06  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2614  murein peptide amidase A  27.38 
 
 
235 aa  55.1  2e-06  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.964461  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2367  peptidase M14 carboxypeptidase A  22.14 
 
 
428 aa  55.5  2e-06  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00127032  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4236  peptidase M14 carboxypeptidase A  30.07 
 
 
497 aa  54.7  3e-06  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0580382  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0391  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.71 
 
 
446 aa  54.3  4e-06  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1610  peptidase M14, carboxypeptidase A  27.5 
 
 
384 aa  53.1  8e-06  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2222  peptidase M14, carboxypeptidase A  27.5 
 
 
384 aa  53.1  8e-06  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2589  hypothetical protein  25.6 
 
 
392 aa  53.1  8e-06  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0393538  normal  0.0858047 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2139  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.78 
 
 
384 aa  53.1  9e-06  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.187915  normal  0.791166 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4249  peptidase M14 carboxypeptidase A  31.19 
 
 
557 aa  52.8  1e-05  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2246  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.88 
 
 
384 aa  52.8  1e-05  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.222943  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2315  peptidase M14, carboxypeptidase A  35.19 
 
 
375 aa  52.8  1e-05  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  5.68724e-06  hitchhiker  0.00110139 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2260  peptidase M14, carboxypeptidase A  27.78 
 
 
384 aa  52.8  1e-05  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5550  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.88 
 
 
384 aa  51.6  2e-05  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.400192  normal  0.189635 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1797  murein peptide amidase A  28.57 
 
 
242 aa  52  2e-05  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3979  peptidase M14, carboxypeptidase A  22.67 
 
 
500 aa  51.6  2e-05  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.946753 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1905  murein peptide amidase A  26.95 
 
 
256 aa  51.2  3e-05  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1641  peptidase M14, carboxypeptidase A  30.26 
 
 
375 aa  51.2  3e-05  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.447328  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0268  peptidase M14, carboxypeptidase A  36.14 
 
 
375 aa  51.2  3e-05  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1797  murein peptide amidase A  26.95 
 
 
256 aa  51.2  3e-05  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.594625  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2320  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.57 
 
 
262 aa  50.8  4e-05  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.250489  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01303  murein peptide amidase A  28.57 
 
 
262 aa  50.8  4e-05  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.131141  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2257  peptidase M14 carboxypeptidase A  36.14 
 
 
375 aa  50.8  4e-05  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  3.28738e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1970  murein peptide amidase A  28.57 
 
 
242 aa  50.8  4e-05  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.996708  normal  0.386863 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01314  hypothetical protein  28.57 
 
 
262 aa  50.8  4e-05  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.107648  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1442  murein peptide amidase A  28.57 
 
 
262 aa  50.8  4e-05  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1558  murein peptide amidase A  28.57 
 
 
262 aa  50.8  4e-05  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1937  peptidase M14, carboxypeptidase A  30.83 
 
 
375 aa  50.8  5e-05  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.568911  normal  0.0124059 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1769  murein peptide amidase A  26.51 
 
 
243 aa  50.1  6e-05  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3024  peptidase M14, carboxypeptidase A  32.22 
 
 
378 aa  50.4  6e-05  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0863993  normal  0.0499845 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32238  predicted protein  27.11 
 
 
502 aa  49.7  8e-05  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.237691  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2558  zinc carboxypeptidase family protein  34.94 
 
 
380 aa  49.7  9e-05  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2299  murein peptide amidase A  27.92 
 
 
242 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.771923  normal 
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0006  bacteriocin  33.33 
 
 
1067 aa  49.3  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2047  peptidase M14 carboxypeptidase A  33.73 
 
 
375 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.131097  hitchhiker  7.23635e-11 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2415  peptidase M14 carboxypeptidase A  33.73 
 
 
375 aa  48.9  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.258482  hitchhiker  0.000158665 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1839  peptidase M14 carboxypeptidase A  25 
 
 
381 aa  48.9  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.419157  normal  0.0171769 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8143  hypothetical protein  26.52 
 
 
815 aa  48.5  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.797388 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2163  peptidase M14 carboxypeptidase A  25 
 
 
381 aa  48.5  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.304741  normal  0.191747 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1934  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.74 
 
 
563 aa  48.9  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0111552  hitchhiker  1.96465e-06 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1091  zinc carboxypeptidase family protein  25.62 
 
 
384 aa  48.1  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0175299  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0707  zinc carboxypeptidase family protein  25.41 
 
 
384 aa  48.9  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000200577  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1322  zinc carboxypeptidase family protein  25.41 
 
 
384 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.111007  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1331  zinc carboxypeptidase family protein  25.41 
 
 
384 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0445  zinc carboxypeptidase family protein  25.41 
 
 
384 aa  48.9  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.884358  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1162  zinc carboxypeptidase family protein  25.41 
 
 
384 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000370841  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2051  peptidase M14 carboxypeptidase A  33.73 
 
 
375 aa  48.9  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.888658  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3662  peptidase M14, carboxypeptidase A  33.33 
 
 
383 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  1.73445e-07  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1798  hypothetical protein  25.41 
 
 
384 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.117776  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2008  hypothetical protein  27.71 
 
 
381 aa  48.1  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0949497 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2300  peptidase M14 carboxypeptidase A  33.73 
 
 
375 aa  48.9  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000207192  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1468  peptidase  25.41 
 
 
384 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000305268  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5494  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.34 
 
 
218 aa  48.1  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.136631  normal  0.114762 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2149  peptidase M14, carboxypeptidase A  36.14 
 
 
374 aa  47.8  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.385121  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2149  murein peptide amidase A  25.97 
 
 
237 aa  48.1  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1536  murein peptide amidase A  27.74 
 
 
242 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008264  CPR_B0001  bacteriocin  25.5 
 
 
879 aa  47.4  0.0005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1866  murein peptide amidase A  28.78 
 
 
242 aa  47.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.295718 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2073  peptidase M14, carboxypeptidase A  32.53 
 
 
375 aa  47.4  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0474309  hitchhiker  0.00159664 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04891  zinc-carboxypeptidase  24.57 
 
 
400 aa  47.4  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1964  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.41 
 
 
382 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0593717 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1905  peptidase M14, carboxypeptidase A  32.53 
 
 
375 aa  47  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00901911  hitchhiker  1.23678e-05 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1960  peptidase M14, carboxypeptidase A  32.53 
 
 
375 aa  47  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.240759  normal  0.0797641 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1582  peptidase M14 carboxypeptidase A  29.46 
 
 
405 aa  47  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00197244  normal  0.432396 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1470  murein peptide amidase A  28.06 
 
 
242 aa  46.6  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2364  hypothetical protein  28.41 
 
 
382 aa  47  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0816102  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1942  peptidase M14, carboxypeptidase A  33.73 
 
 
375 aa  46.6  0.0007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1804  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.41 
 
 
382 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0544452  normal  0.0731495 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1804  murein peptide amidase A  28.06 
 
 
242 aa  46.6  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000928134 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3331  peptidase M14, carboxypeptidase A  27.27 
 
 
382 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.7125 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1652  murein peptide amidase A  28.06 
 
 
242 aa  46.6  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.609177  normal  0.0125995 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1805  murein peptide amidase A  28.06 
 
 
242 aa  46.6  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.561164  normal  0.438296 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5441  hypothetical protein  26 
 
 
490 aa  45.8  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.228309  normal  0.756779 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1338  peptidase M14, carboxypeptidase A  28.41 
 
 
375 aa  45.8  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.412426  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1719  zinc carboxypeptidase domain-containing protein  30.28 
 
 
375 aa  45.8  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.127578  normal  0.0560142 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1643  peptidase M14 carboxypeptidase A  30.5 
 
 
440 aa  45.8  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.428898 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2295  peptidase M14 carboxypeptidase A  33.73 
 
 
375 aa  46.2  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00080179  normal  0.434754 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5245  peptidase M14 carboxypeptidase A  21.57 
 
 
432 aa  45.8  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.510355 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>