13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_3398 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_3398  hypothetical protein  100 
 
 
974 aa  1907  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  3.54514e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3399  hypothetical protein  43.63 
 
 
947 aa  593  1e-168  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  2.80168e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2348  Ig-related protein  27.78 
 
 
1036 aa  157  1e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0040576  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0438  S-layer domain protein  23.28 
 
 
1157 aa  88.6  5e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3397  S-layer domain protein  26.64 
 
 
760 aa  78.6  5e-13  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  5.416e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0789  S-layer protein  24.84 
 
 
880 aa  69.7  3e-10  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.229168  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2303  S-layer domain protein  28.76 
 
 
1018 aa  54.3  1e-05  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3283  hypothetical protein  32.2 
 
 
1182 aa  47  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0056  Ig-like, group 2  30.23 
 
 
4630 aa  47  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3099  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.89 
 
 
1016 aa  45.8  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1064  crystal protein  31.07 
 
 
822 aa  45.4  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  5.77462e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0160  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  38.71 
 
 
2156 aa  45.1  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1368  S-layer-like domain-containing protein  30.68 
 
 
710 aa  44.7  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  4.86639e-05  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>