More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_3351 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013203  Apar_0028  ABC transporter related  58.95 
 
 
615 aa  701    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2264  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  61.92 
 
 
596 aa  743    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.828033  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2528  ABC transporter related  69.03 
 
 
580 aa  842    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000757065  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3351  ABC transporter related  100 
 
 
579 aa  1185    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.773989  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1363  ABC transporter related  60.34 
 
 
636 aa  743    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000676834  normal  0.402453 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0337  ABC transporter related  53.93 
 
 
582 aa  653    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2580  ABC transporter, ATP-binding protein/permease protein  50.96 
 
 
566 aa  613  9.999999999999999e-175  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2282  putative ABC transporter ATP-binding protein  50.79 
 
 
566 aa  612  9.999999999999999e-175  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  47.81 
 
 
571 aa  565  1e-160  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5030  ABC transporter ATP-binding/permease  47.81 
 
 
571 aa  565  1e-160  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487117  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5411  ABC transporter permease/ATP-binding protein  47.81 
 
 
571 aa  565  1e-160  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  47.81 
 
 
571 aa  565  1e-160  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5658  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  47.99 
 
 
571 aa  567  1e-160  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  47.81 
 
 
571 aa  565  1.0000000000000001e-159  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  47.81 
 
 
571 aa  565  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  47.81 
 
 
571 aa  565  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  47.64 
 
 
571 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4974  ABC transporter related  47.46 
 
 
571 aa  558  1e-157  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3334  ABC transporter related  45.01 
 
 
584 aa  543  1e-153  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1954  ABC transporter related  45.1 
 
 
610 aa  542  1e-153  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4405  ABC transporter related  44.56 
 
 
568 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.292842 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2225  ABC transporter related  45.45 
 
 
612 aa  533  1e-150  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.164174  normal  0.618003 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2389  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  44.33 
 
 
572 aa  530  1e-149  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000145644  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2006  ABC transporter related  45.72 
 
 
575 aa  531  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.823185  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1674  ABC transporter permease/ATP-binding protein  44.33 
 
 
572 aa  529  1e-149  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0264422  normal  0.294375 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2487  ABC transporter related  44.33 
 
 
572 aa  529  1e-149  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.461616  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0981  ABC transporter related  45.5 
 
 
576 aa  527  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2001  ABC transporter related  44.06 
 
 
582 aa  522  1e-147  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.201401  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2278  ABC transporter related  44.06 
 
 
582 aa  522  1e-147  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.682256  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1306  ABC transporter related  44.35 
 
 
582 aa  518  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21520  ABC transporter related  54.55 
 
 
468 aa  517  1.0000000000000001e-145  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0552  ABC transporter related  45.14 
 
 
589 aa  511  1e-143  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1896  ABC transporter related  43.26 
 
 
572 aa  511  1e-143  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.332587  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3081  ABC multidrug efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  43.74 
 
 
567 aa  505  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3808  ABC transporter related  43.92 
 
 
567 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0584709  normal  0.445528 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2189  ABC transporter related protein  42.21 
 
 
572 aa  498  1e-139  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.480877  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1811  ABC transporter related  43.38 
 
 
572 aa  494  9.999999999999999e-139  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00064367  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3932  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.61 
 
 
567 aa  488  1e-137  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130383  normal  0.874644 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1143  ABC transporter related  41.95 
 
 
565 aa  474  1e-132  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.4551 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4200  ABC transporter related  41.06 
 
 
566 aa  475  1e-132  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.737412  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0235  ABC transporter related protein  43.87 
 
 
577 aa  462  1e-129  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  39.27 
 
 
575 aa  421  1e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0583  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  37.18 
 
 
586 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.18 
 
 
586 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0584  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.35 
 
 
586 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0444  ABC transporter related  36.83 
 
 
586 aa  399  1e-109  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  38.77 
 
 
598 aa  397  1e-109  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0496  ABC transporter ATP-binding/permease  36.66 
 
 
586 aa  393  1e-108  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.384636  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0439  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  36.83 
 
 
586 aa  395  1e-108  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0511  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.83 
 
 
586 aa  395  1e-108  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4793  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.83 
 
 
586 aa  395  1e-108  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.646278  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0528  ABC transporter permease/ATP-binding protein  36.66 
 
 
586 aa  393  1e-108  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.249641  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  39.42 
 
 
584 aa  394  1e-108  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  38.38 
 
 
578 aa  392  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0435  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  36.66 
 
 
586 aa  391  1e-107  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290198  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  38.38 
 
 
578 aa  392  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  35.49 
 
 
597 aa  383  1e-105  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  36.52 
 
 
598 aa  384  1e-105  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  39.21 
 
 
556 aa  379  1e-104  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0450  ABC transporter-related protein  35.8 
 
 
586 aa  379  1e-104  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0466  ABC transporter related  38.72 
 
 
588 aa  375  1e-103  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3231  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  35.49 
 
 
572 aa  377  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.659501  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0115  ABC transporter, transmembrane region  35.73 
 
 
625 aa  373  1e-102  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3398  ABC transporter related  37.8 
 
 
598 aa  373  1e-102  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273417  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2719  ABC transporter related  37.04 
 
 
606 aa  373  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2187  ABC transporter related  35.95 
 
 
595 aa  372  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1403  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.29 
 
 
578 aa  369  1e-101  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  35.63 
 
 
601 aa  371  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2499  ABC transporter transmembrane region  36.3 
 
 
601 aa  369  1e-101  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  35.14 
 
 
587 aa  365  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0247  ABC transporter related  37.76 
 
 
586 aa  365  1e-100  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.306695  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1216  ABC transporter related  37.56 
 
 
597 aa  364  2e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.791805  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0825  ABC transporter related  36.21 
 
 
575 aa  361  2e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4426  ABC transporter related  34.75 
 
 
603 aa  359  6e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.368028  normal  0.0987215 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0838  ABC transporter related  34.01 
 
 
640 aa  358  9.999999999999999e-98  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  37.6 
 
 
620 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0441  ABC transporter related protein  33.61 
 
 
650 aa  358  1.9999999999999998e-97  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3627  ABC transporter related  34.15 
 
 
617 aa  357  2.9999999999999997e-97  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3025  ABC transporter related  35.64 
 
 
582 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2159  ABC transporter related  35.41 
 
 
603 aa  356  5.999999999999999e-97  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.912689  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3174  ABC transporter related  35.31 
 
 
601 aa  354  2e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3555  ABC transporter related  33.68 
 
 
584 aa  353  2.9999999999999997e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.530108  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3415  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  35.53 
 
 
580 aa  353  4e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1520  ABC transporter related  35.77 
 
 
597 aa  353  5.9999999999999994e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.887648  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4432  ABC transporter related  35.91 
 
 
601 aa  353  7e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3017  ABC transporter, transmembrane region  35.26 
 
 
602 aa  352  8.999999999999999e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0138128  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2944  ABC transporter related  34.97 
 
 
601 aa  352  1e-95  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.631806 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2109  ATPase  33.9 
 
 
591 aa  351  2e-95  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265654  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1430  ABC transporter related  35.34 
 
 
592 aa  349  6e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0148  ABC transporter related  33.9 
 
 
628 aa  349  9e-95  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2086  ABC transporter related  35 
 
 
597 aa  348  1e-94  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1262  ABC transporter related  34.12 
 
 
644 aa  348  1e-94  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0133  ABC transporter, transmembrane region  33.73 
 
 
613 aa  347  2e-94  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.260657  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2733  ABC transporter related  33.73 
 
 
631 aa  348  2e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.021846  normal  0.190322 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0047  ABC transporter related  35.06 
 
 
580 aa  348  2e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00438981  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2921  ABC transporter related protein  35.32 
 
 
636 aa  347  2e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  33.73 
 
 
579 aa  347  3e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2815  ABC transporter related  38.27 
 
 
594 aa  347  4e-94  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.264488  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2349  ABC transporter-related protein  35.13 
 
 
571 aa  346  5e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0506  ABC transporter, ATP-binding protein/permease  35.11 
 
 
612 aa  346  7e-94  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.740474 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>