More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_3318 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_3318  integrase family protein  100 
 
 
423 aa  877  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  1.885e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  28.47 
 
 
414 aa  152  1e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  2.30336e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  32.06 
 
 
400 aa  151  3e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  29.43 
 
 
369 aa  146  8e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  29.43 
 
 
369 aa  144  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  1.20563e-05 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  29.13 
 
 
369 aa  142  1e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  27.95 
 
 
390 aa  140  5e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  32.55 
 
 
325 aa  137  3e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  28.93 
 
 
391 aa  131  2e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  25.79 
 
 
477 aa  129  1e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3468  integrase family protein  28.17 
 
 
381 aa  127  4e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.459563  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3461  phage integrase  27.86 
 
 
381 aa  126  8e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  28.61 
 
 
392 aa  122  1e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  26.45 
 
 
435 aa  113  6e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6303  integrase family protein  24.81 
 
 
416 aa  112  1e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66477  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0493  phage integrase family protein  26.22 
 
 
383 aa  112  1e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  1.32895e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  26.84 
 
 
370 aa  112  2e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  27.38 
 
 
368 aa  110  4e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  28.04 
 
 
374 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  28.04 
 
 
374 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  27.3 
 
 
389 aa  106  7e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  26.36 
 
 
370 aa  106  8e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  27.37 
 
 
392 aa  105  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  3.97895e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2540  integrase family protein  29.57 
 
 
373 aa  104  4e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000519986  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3508  integrase family protein  25.21 
 
 
443 aa  103  4e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2783  phage integrase family protein  26.9 
 
 
367 aa  103  7e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00148084  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  25.89 
 
 
381 aa  102  9e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  1.65595e-05  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1474  phage integrase family site specific recombinase  24.78 
 
 
386 aa  102  1e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0051357  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1062  integrase family protein  26.06 
 
 
391 aa  101  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0018  phage integrase family protein  26.79 
 
 
388 aa  101  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2627  phage integrase family protein  28.52 
 
 
376 aa  101  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000511904  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  25.41 
 
 
377 aa  101  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0829  integrase  28.62 
 
 
388 aa  100  4e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.141939  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  23.31 
 
 
379 aa  100  5e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  25.25 
 
 
365 aa  97.4  4e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  28.45 
 
 
385 aa  96.3  9e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  1.19227e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  23.89 
 
 
363 aa  96.3  9e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  22.96 
 
 
378 aa  95.9  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2923  phage integrase  26.98 
 
 
379 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2967  phage integrase family protein  26.98 
 
 
379 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132884  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  26.25 
 
 
378 aa  96.3  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  27.62 
 
 
387 aa  95.5  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1956  Integrase  28.76 
 
 
312 aa  95.1  2e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  27.03 
 
 
383 aa  94.4  3e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1885  prophage LambdaSa2, site-specific recombinase phage integrase family protein  25.97 
 
 
356 aa  94.4  4e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2145  integrase  28.99 
 
 
393 aa  93.2  7e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.234907  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4036  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  27.11 
 
 
376 aa  93.2  7e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  1.92232e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2252  phage integrase  27.66 
 
 
305 aa  93.6  7e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.442177  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3836  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  26.5 
 
 
376 aa  92.4  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4448  phage integrase family protein  27.38 
 
 
424 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.322677  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4134  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  26.5 
 
 
376 aa  92.4  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.62629  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03170  site-specific recombinase XerD  26.49 
 
 
307 aa  91.7  3e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  2.20198e-09 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  24.92 
 
 
377 aa  90.9  4e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  25.23 
 
 
391 aa  90.5  5e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3068  phage integrase family protein  27.07 
 
 
407 aa  90.1  6e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  24.61 
 
 
357 aa  89.4  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3952  integrase family protein  29.25 
 
 
310 aa  88.2  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1096  integrase  24.52 
 
 
374 aa  89  2e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.077251  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1487  phage integrase  31.17 
 
 
376 aa  88.2  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.16076  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4726  integrase family protein  24 
 
 
404 aa  88.2  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4536  integrase family protein  24.37 
 
 
409 aa  88.2  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0959  Phage integrase  32.52 
 
 
392 aa  87.4  4e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
 
NC_008309  HS_0555  phage integrase  27.76 
 
 
308 aa  86.7  8e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0470289  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2723  integrase family protein  29.21 
 
 
313 aa  86.7  8e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2275  integrase  28.2 
 
 
393 aa  86.3  1e-15  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0926  phage integrase family site specific recombinase  26.65 
 
 
354 aa  85.9  1e-15  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  7.19898e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0301  integrase  26.27 
 
 
398 aa  85.1  2e-15  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0938  Phage integrase  31.91 
 
 
393 aa  85.5  2e-15  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.992929  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1133  phage integrase  25.44 
 
 
454 aa  84.3  3e-15  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00289406  hitchhiker  0.000832848 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1966  phage integrase family protein  25.28 
 
 
403 aa  84.3  4e-15  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00610288  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5534  integrase family protein  23.18 
 
 
426 aa  84  5e-15  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7037  hypothetical protein  24.69 
 
 
387 aa  82.8  9e-15  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.87328 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1239  integrase family protein  29.13 
 
 
390 aa  82  2e-14  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.120865  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0311  phage integrase family protein  34.1 
 
 
401 aa  82  2e-14  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0304  phage integrase family protein  34.1 
 
 
401 aa  82  2e-14  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09660  site-specific recombinase, integrase family  26.91 
 
 
396 aa  81.3  3e-14  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.458441  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3548  phage integrase family protein  31.11 
 
 
209 aa  81.3  3e-14  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.339654  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2060  phage integrase family protein  26.06 
 
 
345 aa  80.9  4e-14  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00257719  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2097  phage integrase family protein  26.06 
 
 
345 aa  80.9  4e-14  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0806496  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2665  integrase family protein  24.94 
 
 
407 aa  80.5  5e-14  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000119591  normal  0.757223 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0768  integrase family protein  26.35 
 
 
397 aa  80.5  6e-14  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1440  phage integrase family protein  23.33 
 
 
393 aa  78.6  2e-13  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2777  integrase family protein  25 
 
 
387 aa  78.6  2e-13  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.684948  normal  0.708845 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0709  phage integrase family protein  22.68 
 
 
386 aa  79  2e-13  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1422  phage integrase  23.33 
 
 
442 aa  78.6  2e-13  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0644  integrase family protein  22.62 
 
 
406 aa  78.6  2e-13  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1619  phage integrase family protein  30.81 
 
 
286 aa  77.8  3e-13  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1190  integrase family protein  23.51 
 
 
463 aa  77.4  4e-13  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15860  site-specific recombinase XerD  24.42 
 
 
398 aa  77.4  4e-13  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0008266  hitchhiker  7.33221e-05 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1574  integrase family protein  24.3 
 
 
385 aa  77.4  5e-13  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00294023  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1724  phage integrase family protein  24.28 
 
 
378 aa  77  5e-13  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1407  integrase family protein  25.4 
 
 
374 aa  77  6e-13  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0609363  normal  0.0878514 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0424  phage integrase  24.15 
 
 
374 aa  77  6e-13  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.743387  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1691  phage integrase family protein  25.67 
 
 
402 aa  77  7e-13  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.66436 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2020  LigA  22.9 
 
 
397 aa  76.6  8e-13  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0567  integrase family protein  29.41 
 
 
391 aa  76.6  8e-13  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.563798  hitchhiker  0.00485057 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0820  integrase family protein  25.94 
 
 
378 aa  76.3  9e-13  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14150  site-specific recombinase XerD  22.43 
 
 
451 aa  76.3  9e-13  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0234  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.03 
 
 
302 aa  76.3  1e-12  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23910  site-specific recombinase XerD  26.33 
 
 
402 aa  75.5  2e-12  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.075478  normal  0.15395 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>