More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_3317 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_3317  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 281 aa  573  1.0000000000000001e-162  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000786405  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1503  LexA repressor  39.2 
 
 		 239 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.106376 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1572  SOS-response transcriptional repressor, LexA  38.28 
 
 		 217 aa  79.7  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1409  LexA family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 258 aa  77.4  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0567372  decreased coverage  0.00000225039 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0041  LexA repressor  32.74 
 
 		 201 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1479  LexA repressor  34.59 
 
 		 275 aa  78.2  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0381882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1451  LexA repressor  36.72 
 
 		 261 aa  75.9  0.0000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.440028  normal  0.764251 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1054  SOS-response transcriptional repressor, LexA  33.99 
 
 		 241 aa  76.3  0.0000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.675228 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1236  LexA repressor  30.92 
 
 		 207 aa  76.3  0.0000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000635507  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1142  SOS-response transcriptional repressor, LexA  34.25 
 
 		 201 aa  75.9  0.0000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00201645  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2221  LexA repressor  39.84 
 
 		 233 aa  75.5  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0110096  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27590  SOS-response transcriptional repressor, LexA  38.58 
 
 		 235 aa  75.1  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2118  LexA repressor  31.58 
 
 		 207 aa  75.5  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4562  SOS-response transcriptional repressor, LexA  37.8 
 
 		 227 aa  75.1  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.547089  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2427  SOS-response transcriptional repressor LexA  37.8 
 
 		 238 aa  75.1  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.639374 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0234  LexA family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 210 aa  74.7  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1617  LexA repressor  33.33 
 
 		 203 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11470  SOS-response transcriptional repressor, LexA  35.66 
 
 		 207 aa  74.3  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.7722e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2084  SOS-response transcriptional repressor, LexA  38.93 
 
 		 231 aa  73.6  0.000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0507519 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0757  SOS-response transcriptional repressor, LexA  33.95 
 
 		 196 aa  72.8  0.000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0696  putative prophage repressor  30.2 
 
 		 157 aa  72.8  0.000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00336277  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3817  LexA repressor  36.81 
 
 		 246 aa  72.8  0.000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.18019  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10620  SOS-response transcriptional repressor, LexA  38.89 
 
 		 234 aa  72.4  0.000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.445804  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3510  LexA repressor  35.43 
 
 		 256 aa  72.4  0.000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0771524 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1258  SOS-response transcriptional repressor, LexA  38.89 
 
 		 243 aa  72.4  0.000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1932  LexA repressor  36.8 
 
 		 207 aa  72.4  0.000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.424325  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2719  SOS-response transcriptional repressor, LexA  31.25 
 
 		 204 aa  72  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000100121  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23040  SOS-response transcriptional repressor, LexA  37.8 
 
 		 258 aa  71.6  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.620289  normal  0.0692962 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1434  SOS-response transcriptional repressor, LexA  39.53 
 
 		 235 aa  71.6  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.298134  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1693  SOS-response transcriptional repressor, LexA  38.69 
 
 		 215 aa  72  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.026271  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3095  XRE family transcriptional regulator  56.9 
 
 		 152 aa  71.2  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3618  XRE family transcriptional regulator  55.74 
 
 		 123 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3779  SOS-response transcriptional repressor, LexA  36.8 
 
 		 207 aa  71.2  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1583  SOS-response transcriptional repressor, LexA  35.94 
 
 		 229 aa  70.1  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.4567  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2157  LexA repressor  32.28 
 
 		 230 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.564667  hitchhiker  0.00513762 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2168  LexA repressor  32.28 
 
 		 230 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.264168  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1758  transcriptional repressor, LexA family  30.56 
 
 		 201 aa  70.1  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000113097  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2214  LexA repressor  32.28 
 
 		 230 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132228  normal  0.149598 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1579  transcriptional repressor, LexA family  30.38 
 
 		 202 aa  69.3  0.00000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3902  transcriptional repressor, LexA family  33.86 
 
 		 263 aa  69.3  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1504  SOS-response transcriptional repressor, LexA  36.15 
 
 		 222 aa  69.3  0.00000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000188226 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3377  LexA repressor  28.93 
 
 		 204 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.32678  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07330  SOS-response transcriptional repressor, LexA  34.07 
 
 		 238 aa  68.6  0.0000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.140562  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1873  SOS-response transcriptional repressor, LexA  35.62 
 
 		 214 aa  68.6  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.164237  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0893  SOS-response transcriptional repressor, LexA  32.69 
 
 		 207 aa  68.6  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2954  transcriptional regulator, XRE family  28.06 
 
 		 223 aa  68.6  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.00000000000401895  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1662  SOS-response transcriptional repressor, LexA  34.65 
 
 		 197 aa  68.6  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0793  LexA repressor  33.61 
 
 		 207 aa  68.6  0.0000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000163757  hitchhiker  8.744270000000001e-24 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2134  SOS-response transcriptional repressor, LexA  33.73 
 
 		 206 aa  68.2  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.017177 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2490  SOS-response transcriptional repressor, LexA  30.56 
 
 		 201 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3956  LexA repressor  36.22 
 
 		 232 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.175272  normal  0.995266 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1516  LexA repressor  29.19 
 
 		 223 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.142022 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1901  SOS-response transcriptional repressor, LexA  36.54 
 
 		 200 aa  68.2  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2441  LexA repressor  36.22 
 
 		 232 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.628301  normal  0.115914 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2543  LexA family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 204 aa  67  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0539699  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3799  LexA repressor  28.57 
 
 		 223 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0677  LexA repressor  32.1 
 
 		 208 aa  67  0.0000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000451027  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1234  putative prophage repressor  40 
 
 		 153 aa  67  0.0000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000530915  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3750  LexA repressor  28.57 
 
 		 223 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.596492  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1814  SOS-response transcriptional repressor, LexA  35.94 
 
 		 228 aa  67  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.105168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0797  transcriptional regulator, XRE family  34.62 
 
 		 206 aa  67  0.0000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.028007  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1803  LexA repressor  31.16 
 
 		 231 aa  66.6  0.0000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00193546  normal  0.136628 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3727  LexA repressor  28.57 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3479  LexA repressor  28.57 
 
 		 269 aa  67  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3444  LexA repressor  28.57 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3395  LexA repressor  28.57 
 
 		 269 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3754  LexA repressor  28.57 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1735  LexA family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 197 aa  66.6  0.0000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0020  SOS-response transcriptional repressor, LexA  32.5 
 
 		 199 aa  66.6  0.0000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000309012  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3708  LexA repressor  28.57 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000011007 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1439  SOS-response transcriptional repressor, LexA  30.59 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2344  LexA repressor  30.06 
 
 		 206 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.53254  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1566  transcriptional repressor, LexA family  36.07 
 
 		 252 aa  66.2  0.0000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000959525 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17230  SOS-response transcriptional repressor, LexA  37.5 
 
 		 233 aa  65.9  0.0000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.302677 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3979  SOS-response transcriptional repressor, LexA  34.65 
 
 		 252 aa  65.5  0.0000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.712673  normal  0.0708135 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1183  putative prophage repressor  32.26 
 
 		 210 aa  65.1  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00355534  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12734  LexA repressor  34.38 
 
 		 217 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1364  LexA repressor  29.55 
 
 		 203 aa  65.5  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000105475  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1177  LexA repressor  29.55 
 
 		 203 aa  65.1  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000269483  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1120  SOS-response transcriptional repressor, LexA  30.86 
 
 		 205 aa  64.3  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.430548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1232  LexA repressor  32.28 
 
 		 250 aa  63.9  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0475766  normal  0.0166325 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2142  LexA repressor  28.67 
 
 		 232 aa  64.7  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.196477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7132  Repressor lexA  33.07 
 
 		 236 aa  64.3  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0773  SOS-response transcriptional repressor, LexA  33.83 
 
 		 213 aa  64.3  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000913387  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1604  DNA-binding protein  49.18 
 
 		 114 aa  63.9  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00115974  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1912  putative prophage repressor  28.93 
 
 		 196 aa  63.9  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4471  transcriptional repressor, LexA family  38.52 
 
 		 204 aa  63.9  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2243  LexA repressor  36 
 
 		 198 aa  63.5  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1543  transcriptional repressor, LexA family  31.65 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00734536 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1868  LexA repressor  31.65 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1715  XRE family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 152 aa  63.2  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000119777  normal  0.864438 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1808  transcriptional repressor, LexA family  35.16 
 
 		 236 aa  63.2  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.2542  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0803  hypothetical protein  26.15 
 
 		 255 aa  62.8  0.000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0115457  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1008  repressor lexA  34.45 
 
 		 204 aa  62.8  0.000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000183008  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1470  LexA repressor  33.33 
 
 		 249 aa  62.4  0.000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000034906 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2152  peptidase S24, LexA repressor  36.09 
 
 		 252 aa  62  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0120342  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2054  putative phage repressor  25.72 
 
 		 238 aa  61.6  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000034182  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1400  LexA repressor  30.06 
 
 		 207 aa  61.6  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00035573  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1427  LexA repressor  30.06 
 
 		 207 aa  61.6  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000910352  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1468  LexA repressor  35.71 
 
 		 288 aa  62  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.097089  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>