127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_3243 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_3243  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  100 
 
 
749 aa  1563    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00420  Kojibiose phosphorylase  35.82 
 
 
780 aa  451  1e-125  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2202  Kojibiose phosphorylase  34.23 
 
 
775 aa  422  1e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.387396  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3917  Kojibiose phosphorylase  33.16 
 
 
748 aa  406  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.057945 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0214  beta-phosphoglucomutase  33.82 
 
 
965 aa  402  9.999999999999999e-111  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.387733  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3752  HAD family hydrolase  32.58 
 
 
978 aa  390  1e-107  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.625857  normal  0.249828 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1530  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  31.76 
 
 
759 aa  378  1e-103  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14560  Kojibiose phosphorylase  31.61 
 
 
778 aa  377  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000528962  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0398  Kojibiose phosphorylase  32.5 
 
 
755 aa  377  1e-103  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00143976  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0140  Kojibiose phosphorylase  33.07 
 
 
763 aa  376  1e-102  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2193  Kojibiose phosphorylase  30.89 
 
 
780 aa  366  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2279  glycoside hydrolase family protein  31.2 
 
 
759 aa  363  7.0000000000000005e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.7939 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0403  Kojibiose phosphorylase  29.83 
 
 
781 aa  356  7.999999999999999e-97  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.10881  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02160  trehalose/maltose hydrolase or phosphorylase  30.74 
 
 
825 aa  348  2e-94  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2264  Kojibiose phosphorylase  31.17 
 
 
720 aa  348  2e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.170179  hitchhiker  0.00000128676 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8722  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  30.36 
 
 
762 aa  348  2e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.909698  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0919  Kojibiose phosphorylase  31.23 
 
 
794 aa  346  8.999999999999999e-94  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.570777 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2869  Kojibiose phosphorylase  29.05 
 
 
760 aa  342  2e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.173251  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2158  Kojibiose phosphorylase  30.4 
 
 
757 aa  340  7e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.848315 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0036  Kojibiose phosphorylase  30.64 
 
 
790 aa  339  9.999999999999999e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0720168  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3421  Kojibiose phosphorylase  30.52 
 
 
858 aa  338  1.9999999999999998e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1279  Kojibiose phosphorylase  30.52 
 
 
790 aa  335  2e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.192796  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6156  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  28.78 
 
 
777 aa  335  2e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1550  Kojibiose phosphorylase  31.14 
 
 
789 aa  334  4e-90  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0811  Kojibiose phosphorylase  30.16 
 
 
787 aa  332  2e-89  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.427192  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1264  glycosy hydrolase family protein  29.23 
 
 
781 aa  331  3e-89  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.353218  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05085  Trehalose/maltose hydrolase (phosphorylase)  30.05 
 
 
768 aa  328  3e-88  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20570  trehalose/maltose hydrolase or phosphorylase  29.84 
 
 
843 aa  327  3e-88  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.414924 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20830  Kojibiose phosphorylase  30.76 
 
 
769 aa  327  3e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0216  maltose phosphorylase  30.35 
 
 
758 aa  324  4e-87  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000286832  hitchhiker  0.00000374663 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2116  Kojibiose phosphorylase  28.4 
 
 
834 aa  324  4e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1281  Kojibiose phosphorylase  31.29 
 
 
761 aa  323  5e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0038  Kojibiose phosphorylase  31.03 
 
 
761 aa  322  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0562  Kojibiose phosphorylase  29.56 
 
 
795 aa  320  5e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1194  Kojibiose phosphorylase  30.67 
 
 
787 aa  320  7e-86  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09380  trehalose/maltose hydrolase or phosphorylase  29.2 
 
 
848 aa  319  1e-85  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1203  Kojibiose phosphorylase  30.07 
 
 
807 aa  318  2e-85  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.204393  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0497  Kojibiose phosphorylase  29.56 
 
 
795 aa  317  6e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1527  glycosy hydrolase family protein  29.05 
 
 
755 aa  316  9e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1961  glycosyl hydrolase, family 65  28.04 
 
 
755 aa  316  9e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.756125  normal  0.752383 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01293  predicted hydrolase  28.55 
 
 
755 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.940342  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01304  hypothetical protein  28.55 
 
 
755 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.95805  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2330  Kojibiose phosphorylase  28.42 
 
 
755 aa  315  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.21539  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1431  glycosy hydrolase family protein  28.42 
 
 
755 aa  315  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2309  Kojibiose phosphorylase  28.42 
 
 
755 aa  315  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1806  glycosy hydrolase family protein  28.91 
 
 
755 aa  314  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.769957  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0533  Kojibiose phosphorylase  30.28 
 
 
795 aa  314  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.704179 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3033  Kojibiose phosphorylase  27.07 
 
 
780 aa  311  2.9999999999999997e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.10218  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1117  glycosy hydrolase family protein  30.5 
 
 
780 aa  310  5e-83  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.158926  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0190  maltose phosphorylase  31.41 
 
 
765 aa  309  1.0000000000000001e-82  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0054  maltose phosphorylase  29.45 
 
 
750 aa  309  1.0000000000000001e-82  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000286879  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2756  maltose phosphorylase  28.4 
 
 
771 aa  304  4.0000000000000003e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.264043 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1747  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  28.67 
 
 
778 aa  304  5.000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2817  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  28.25 
 
 
810 aa  303  1e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0216244  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1401  maltose phosphorylase  29.33 
 
 
767 aa  299  1e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.900484  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0089  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  27.07 
 
 
777 aa  296  9e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.472584  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5087  maltose phosphorylase  28.74 
 
 
774 aa  291  3e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.076109  normal  0.646973 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0525  Kojibiose phosphorylase  27.76 
 
 
791 aa  291  3e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.659551  normal  0.0300138 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6405  Kojibiose phosphorylase  27.64 
 
 
784 aa  288  2e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.338097  normal  0.788674 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1847  maltose phosphorylase  29.44 
 
 
751 aa  286  7e-76  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27210  trehalose/maltose hydrolase or phosphorylase  27.38 
 
 
807 aa  285  2.0000000000000002e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0585996  normal  0.801027 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2716  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  28.42 
 
 
787 aa  283  6.000000000000001e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1874  Kojibiose phosphorylase  27.49 
 
 
753 aa  283  7.000000000000001e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3314  Kojibiose phosphorylase  35.62 
 
 
805 aa  283  1e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0438  Kojibiose phosphorylase  27.3 
 
 
791 aa  280  5e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4269  Kojibiose phosphorylase  28.33 
 
 
767 aa  280  6e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4347  glycoside hydrolase family protein  27.18 
 
 
804 aa  280  8e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.138652  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2887  family 65 glycoside hydrolase  27.58 
 
 
824 aa  279  2e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1073  Kojibiose phosphorylase  27.5 
 
 
789 aa  278  2e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.15759 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0894  maltose phosphorylase  28.86 
 
 
752 aa  277  6e-73  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0995  maltose phosphorylase  28.3 
 
 
752 aa  275  3e-72  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3313  Kojibiose phosphorylase  28.31 
 
 
748 aa  273  1e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5750  Kojibiose phosphorylase  27.33 
 
 
794 aa  270  5e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.06218  normal  0.0760433 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2513  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  26.73 
 
 
786 aa  270  5e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0839  maltose phosphorylase  27.12 
 
 
710 aa  270  5.9999999999999995e-71  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0771265  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13436  hypothetical protein  27.23 
 
 
786 aa  270  7e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0422368  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2962  Kojibiose phosphorylase  27.38 
 
 
778 aa  270  1e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000307404  normal  0.340362 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1019  Kojibiose phosphorylase  29.12 
 
 
756 aa  269  2e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1437  Kojibiose phosphorylase  29.92 
 
 
788 aa  268  2.9999999999999995e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.217423  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0258  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  26.85 
 
 
782 aa  266  8e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1171  glycoside hydrolase family protein  26.98 
 
 
787 aa  266  1e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1188  Kojibiose phosphorylase  26.98 
 
 
787 aa  266  1e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.399982  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1198  Kojibiose phosphorylase  26.98 
 
 
787 aa  266  1e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.51521  normal  0.0335974 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1640  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  25.66 
 
 
1051 aa  264  4.999999999999999e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0980  glycosy hydrolase family protein  28.59 
 
 
789 aa  263  8e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.966041  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1472  Kojibiose phosphorylase  25.62 
 
 
790 aa  263  1e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.299549 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1462  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  27.06 
 
 
1050 aa  262  1e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1809  Kojibiose phosphorylase  27.24 
 
 
784 aa  263  1e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1027  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  26.42 
 
 
1051 aa  260  8e-68  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0927  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  25.99 
 
 
1055 aa  259  1e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0241  Kojibiose phosphorylase  26.17 
 
 
800 aa  259  1e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1493  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  26.95 
 
 
786 aa  259  2e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.310066  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1512  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  26.62 
 
 
1053 aa  257  7e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1016  Kojibiose phosphorylase  28.77 
 
 
776 aa  255  2.0000000000000002e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.313972 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1613  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  24.57 
 
 
1052 aa  253  9.000000000000001e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.885412  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0308  Kojibiose phosphorylase  26.99 
 
 
786 aa  248  4e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1312  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  25.37 
 
 
1053 aa  243  1e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0531  Kojibiose phosphorylase  27.44 
 
 
781 aa  242  2e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3531  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  26.9 
 
 
794 aa  239  1e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.607347  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1775  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  25.41 
 
 
1314 aa  233  1e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.563736  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>