165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_3231 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_3231  BioY protein  100 
 
 
184 aa  356  9e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  2.66759e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3677  BioY protein  43.86 
 
 
182 aa  148  5e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  9.40294e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2725  BioY protein  39.88 
 
 
184 aa  122  4e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.401651  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07160  hypothetical protein  34.83 
 
 
205 aa  112  3e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.635094  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2139  BioY protein  37.01 
 
 
192 aa  102  4e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.990413  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1588  BioY protein  37.13 
 
 
167 aa  100  8e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  1.11141e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0129  BioY protein  35.93 
 
 
169 aa  100  1e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0127  BioY protein  35.93 
 
 
169 aa  100  1e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.12372  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3685  BioY protein  36.9 
 
 
189 aa  97.8  9e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05160  BioY protein  37.5 
 
 
184 aa  96.7  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0283  BioY protein  35.23 
 
 
179 aa  95.9  3e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0357  hypothetical protein  28.81 
 
 
182 aa  95.5  4e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0144  BioY protein  36.31 
 
 
189 aa  94  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.964994 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1156  BioY protein  36.54 
 
 
199 aa  94  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0586  biotin synthesis BioY protein  35.8 
 
 
187 aa  93.6  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2725  BioY protein  31.76 
 
 
195 aa  92.4  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.318668  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0018  BioY protein  34.87 
 
 
205 aa  90.1  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000199845 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4523  BioY protein  36.05 
 
 
206 aa  90.1  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0539  BioY protein  37.32 
 
 
203 aa  88.2  6e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.203446  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2689  BioY protein  35.21 
 
 
197 aa  87.8  7e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3185  BioY protein  35.17 
 
 
178 aa  87.8  8e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3011  BioY protein  34.34 
 
 
187 aa  86.7  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.131178  normal  0.563491 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0581  BioY protein  33.52 
 
 
187 aa  86.7  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.981929  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1671  BioY protein  32.89 
 
 
207 aa  86.3  3e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000998664 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0233  BioY protein  32.07 
 
 
197 aa  85.5  4e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3648  bioY family protein  32.18 
 
 
191 aa  85.1  5e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1318  BioY protein  35.1 
 
 
189 aa  85.1  5e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00324631 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0991  BioY protein  39.73 
 
 
199 aa  85.1  6e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1014  BioY protein  34.15 
 
 
169 aa  84.7  6e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.842683  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1953  hypothetical protein  31.11 
 
 
189 aa  84.7  6e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.327178  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0230  BioY protein  35 
 
 
204 aa  84  1e-15  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.949273  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1749  BioY protein  35.83 
 
 
182 aa  83.6  1e-15  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.969315  normal  0.0325978 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0622  BioY protein  32.4 
 
 
187 aa  84  1e-15  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.560526  normal  0.0354097 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8405  BioY family protein  38.18 
 
 
189 aa  83.2  2e-15  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0996  BioY protein  36.43 
 
 
191 aa  83.2  2e-15  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02210  hypothetical protein  29.24 
 
 
194 aa  82.8  3e-15  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1961  BioY protein  33.53 
 
 
187 aa  82  4e-15  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4131  BioY protein  32.32 
 
 
189 aa  81.6  6e-15  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.777139  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1580  bioY family protein  30.86 
 
 
191 aa  81.6  6e-15  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  7.0307e-10  normal  0.0383655 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0659  BioY protein  34.86 
 
 
171 aa  81.3  8e-15  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.728186  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1193  biotin transport protein BioY  30.86 
 
 
184 aa  80.1  1e-14  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21300  hypothetical protein  27.95 
 
 
197 aa  80.9  1e-14  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.380414 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0132  hypothetical protein  33.33 
 
 
176 aa  80.5  1e-14  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3315  BioY protein  31.03 
 
 
191 aa  80.1  2e-14  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  1.66456e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0504  BioY protein  30.43 
 
 
210 aa  79.7  2e-14  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0539  BioY protein  34.1 
 
 
193 aa  79.3  3e-14  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.252714  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5281  BioY protein  34.97 
 
 
202 aa  77.8  8e-14  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.170405  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5370  BioY protein  34.97 
 
 
202 aa  77.8  8e-14  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5660  BioY protein  34.97 
 
 
202 aa  77.8  8e-14  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0398  BioY family protein  31.43 
 
 
179 aa  77.4  1e-13  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  9.49175e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0610  BioY protein  31.4 
 
 
174 aa  77.4  1e-13  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  7.75885e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3464  BioY protein  29.71 
 
 
205 aa  76.6  2e-13  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.454353 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2213  BioY protein  30.17 
 
 
182 aa  76.6  2e-13  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  1.2911e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2307  BioY protein  32.53 
 
 
184 aa  76.3  3e-13  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.366824  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2314  hypothetical protein  37.09 
 
 
222 aa  75.9  3e-13  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.462217  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2349  BioY protein  32.53 
 
 
184 aa  76.3  3e-13  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1864  BioY family protein  32.95 
 
 
182 aa  75.5  4e-13  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3228  BioY protein  31.25 
 
 
201 aa  75.5  4e-13  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1647  BioY protein  36.3 
 
 
169 aa  74.3  9e-13  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0776  BioY protein  34.62 
 
 
200 aa  73.6  1e-12  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.656127  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0733  BioY protein  30.69 
 
 
190 aa  73.6  1e-12  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.307469  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1515  bioY family protein  34.29 
 
 
184 aa  73.6  1e-12  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00248245  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0476  BioY protein  33.33 
 
 
182 aa  73.2  2e-12  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.014299 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0568  BioY protein  35.26 
 
 
193 aa  73.2  2e-12  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.936427  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1198  BioY protein  29.17 
 
 
191 aa  72.8  3e-12  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3097  BioY protein  33.7 
 
 
187 aa  72.4  3e-12  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3005  BioY protein  37.32 
 
 
200 aa  72.4  3e-12  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.312874  normal  0.884214 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2875  BioY protein  32.26 
 
 
202 aa  72.4  3e-12  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  9.12957e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1206  bioY family protein  34 
 
 
175 aa  72  4e-12  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0726  biotin synthase  29.86 
 
 
179 aa  70.5  1e-11  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  1.4315e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3659  bioY family protein  31.03 
 
 
191 aa  70.5  1e-11  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00282906  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1681  BioY protein  34.59 
 
 
225 aa  70.5  1e-11  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3020  BioY protein  31.65 
 
 
201 aa  70.9  1e-11  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1200  BioY family protein  29.51 
 
 
216 aa  70.5  1e-11  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.3254e-06 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0575  BioY protein  33.78 
 
 
185 aa  70.5  1e-11  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1732  BioY protein  31.03 
 
 
208 aa  70.5  1e-11  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4329  BioY protein  33.33 
 
 
212 aa  69.7  2e-11  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.794239  normal  0.373185 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3737  bioY family protein  30.46 
 
 
191 aa  70.1  2e-11  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.776545  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1855  BioY protein  34.69 
 
 
216 aa  70.1  2e-11  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000505992 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3659  BioY protein  34.64 
 
 
179 aa  70.1  2e-11  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4601  BioY protein  26.97 
 
 
197 aa  69.3  3e-11  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.440698  normal  0.800249 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_967  biotin biosynthesis protein BioY  32 
 
 
215 aa  69.3  3e-11  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  8.44147e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2889  BioY protein  29.35 
 
 
197 aa  68.6  4e-11  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0995  BioY protein  31.33 
 
 
215 aa  68.9  4e-11  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0571  BioY protein  35.26 
 
 
193 aa  68.9  4e-11  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1788  BioY protein  29.87 
 
 
169 aa  68.9  4e-11  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.385852  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2544  BioY protein  33.15 
 
 
192 aa  68.6  5e-11  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  2.69732e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1432  BioY protein  35 
 
 
185 aa  68.2  6e-11  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.776822 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0061  BioY protein  27.93 
 
 
182 aa  68.2  7e-11  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  3.03529e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1924  BioY family protein  32.59 
 
 
145 aa  67.4  1e-10  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.930651  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3331  bioY family protein  29.89 
 
 
191 aa  67.4  1e-10  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  4.23922e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3640  bioY family protein  29.89 
 
 
191 aa  67.4  1e-10  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3107  Na+/H+ antiporter  30.72 
 
 
192 aa  67.4  1e-10  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.468263  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1004  biotin synthesis BioY protein  30.36 
 
 
187 aa  67.4  1e-10  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1068  BioY protein  31.9 
 
 
192 aa  66.2  2e-10  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1159  BioY protein  28.42 
 
 
231 aa  66.6  2e-10  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.934928  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3745  BioY protein  31.48 
 
 
190 aa  66.2  2e-10  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  4.21582e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2901  BioY protein  36.17 
 
 
208 aa  66.6  2e-10  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  3.26686e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2954  BioY family protein  38.24 
 
 
180 aa  65.9  3e-10  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.716157  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3689  bioY family protein  29.31 
 
 
191 aa  65.5  4e-10  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  5.93466e-10  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>