More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_3189 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_3189  biotin synthase  100 
 
 
345 aa  710  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  3.10414e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2083  biotin synthase  67.64 
 
 
372 aa  500  1e-140  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1839  biotin synthase  68.12 
 
 
353 aa  498  1e-140  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0814889  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16510  iron-only hydrogenase maturation protein HydE  56.14 
 
 
351 aa  421  1e-116  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0271  Radical SAM domain protein  61.34 
 
 
347 aa  414  1e-114  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.195415  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2639  Radical SAM domain protein  60.91 
 
 
374 aa  394  1e-108  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2647  biotin synthase  46.92 
 
 
351 aa  330  2e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  3.6845e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0563  biotin synthase  47.51 
 
 
345 aa  311  8e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.295179  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2462  biotin synthase  46.25 
 
 
347 aa  303  4e-81  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2775  biotin synthase  45.95 
 
 
347 aa  300  2e-80  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19160  biotin synthase  44.87 
 
 
350 aa  293  2e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0257647  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2151  biotin synthase  42.07 
 
 
354 aa  286  4e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0240  biotin synthase  43.58 
 
 
349 aa  278  8e-74  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1551  biotin synthase  43.27 
 
 
348 aa  276  5e-73  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1597  biotin synthase  49.29 
 
 
341 aa  275  8e-73  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0181  Radical SAM domain protein  41.42 
 
 
349 aa  275  1e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1735  biotin synthase  43.65 
 
 
350 aa  274  2e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00262623  normal  0.855022 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1329  radical SAM domain-containing protein  41.94 
 
 
346 aa  274  2e-72  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  1.7523e-07 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1502  biotin synthase  42.57 
 
 
348 aa  271  2e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  2.09115e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0841  biotin synthase  40.49 
 
 
344 aa  268  1e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1722  biotin synthase  40.94 
 
 
348 aa  267  2e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000337366  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1130  biotin synthase  43.59 
 
 
352 aa  263  3e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000236268  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1244  Radical SAM domain protein  40.59 
 
 
360 aa  260  3e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0144  Radical SAM domain protein  39.42 
 
 
352 aa  248  2e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  4.7373e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0166  radical SAM domain-containing protein  40.59 
 
 
370 aa  246  3e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.372295  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1100  Radical SAM domain protein  39.13 
 
 
364 aa  241  1e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00787041  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1863  radical SAM domain-containing protein  39.62 
 
 
380 aa  238  1e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.176912  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1607  biotin synthase  39.58 
 
 
337 aa  236  4e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.18444  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1388  biotin synthase  38.58 
 
 
323 aa  235  1e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00378301  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1632  biotin synthase  38.63 
 
 
356 aa  235  1e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.34633e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1491  biotin synthase  37.13 
 
 
357 aa  231  1e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1020  biotin synthase  42.75 
 
 
311 aa  229  6e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2277  biotin synthase  35.62 
 
 
337 aa  221  1e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3925  biotin synthase  37.7 
 
 
359 aa  221  2e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1504  biotin synthase  41.16 
 
 
331 aa  218  1e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3255  biotin synthase  37.06 
 
 
359 aa  215  7e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.464529  hitchhiker  1.4228e-05 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0706  biotin synthase  37.7 
 
 
359 aa  214  2e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.997344  hitchhiker  0.000263623 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1844  biotin synthase  32.84 
 
 
360 aa  193  5e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0838  biotin synthase  31.63 
 
 
350 aa  110  2e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4857  Radical SAM domain protein  27.16 
 
 
365 aa  108  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0028  Radical SAM domain protein  27.3 
 
 
368 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2085  biotin synthase  29.01 
 
 
350 aa  97.4  3e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000297943  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0169  thiamine biosynthesis protein ThiH  30.34 
 
 
477 aa  82  1e-14  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000784524  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0145  biotin and thiamin synthesis associated  27.2 
 
 
475 aa  81.3  2e-14  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000404218  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0530  thiamine biosynthesis protein ThiH  28.25 
 
 
466 aa  79.3  1e-13  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2637  biotin and thiamin synthesis associated  29.44 
 
 
474 aa  74.7  2e-12  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0455456  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0106  thiamine biosynthesis protein ThiH  24.31 
 
 
473 aa  72.4  9e-12  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0238  thiamine biosynthesis protein ThiH  26.97 
 
 
469 aa  72  1e-11  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0108  thiamine biosynthesis protein ThiH  23.92 
 
 
473 aa  71.6  2e-11  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2499  biotin synthase  22.19 
 
 
335 aa  70.9  3e-11  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2451  biotin synthase  22.19 
 
 
335 aa  70.9  3e-11  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1631  thiamine biosynthesis protein ThiH  25.63 
 
 
474 aa  70.1  6e-11  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.08196e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3104  thiamine biosynthesis protein ThiH  25.44 
 
 
470 aa  69.7  7e-11  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1552  biotin synthase  24.53 
 
 
341 aa  68.9  1e-10  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0107  biotin synthase  27.42 
 
 
344 aa  67.8  2e-10  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.156568  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1864  thiamine biosynthesis protein ThiH  27.53 
 
 
471 aa  68.6  2e-10  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.804214  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2150  thiamine biosynthesis protein ThiH  26.67 
 
 
489 aa  67.4  3e-10  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2347  biotin synthase  22.93 
 
 
321 aa  67.4  3e-10  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0208  Radical SAM domain protein  25.67 
 
 
333 aa  67.8  3e-10  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.819308  hitchhiker  0.00109807 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19320  thiamine biosynthesis protein ThiH  26.94 
 
 
481 aa  67  4e-10  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.604255  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1853  thiamine biosynthesis protein ThiH  28.75 
 
 
367 aa  67  4e-10  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.287617  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0163  thiamine biosynthesis protein ThiH  23.9 
 
 
491 aa  66.2  7e-10  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1492  thiamine biosynthesis protein ThiH  24.73 
 
 
473 aa  66.2  8e-10  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0263  hypothetical protein  24.61 
 
 
380 aa  65.9  9e-10  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1504  thiamine biosynthesis protein ThiH  24.82 
 
 
473 aa  65.9  9e-10  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0434134  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1451  hypothetical protein  22.99 
 
 
335 aa  65.9  1e-09  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  8.57119e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1570  thiamine biosynthesis protein ThiH  28.75 
 
 
367 aa  65.5  1e-09  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.25811  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2082  thiamine biosynthesis protein ThiH  26.11 
 
 
472 aa  65.5  1e-09  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.388177  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1553  thiamine biosynthesis protein ThiH  25.28 
 
 
471 aa  65.9  1e-09  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0182  thiamine biosynthesis protein ThiH  28.65 
 
 
469 aa  64.3  3e-09  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1241  thiamine biosynthesis protein ThiH  23.72 
 
 
492 aa  64.3  3e-09  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.721049  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1599  thiamine biosynthesis protein ThiH  25.28 
 
 
471 aa  63.9  3e-09  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0826  biotin synthase  24.15 
 
 
341 aa  63.2  6e-09  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.247996  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0370  thiamine biosynthesis protein ThiH  26.19 
 
 
369 aa  63.2  7e-09  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  3.04803e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4068  radical SAM domain-containing protein  26.07 
 
 
394 aa  63.2  7e-09  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.18733 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0340  thiamine biosynthesis protein ThiH  23.98 
 
 
374 aa  63.2  7e-09  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4489  thiamine biosynthesis protein ThiH  24.04 
 
 
377 aa  62.8  8e-09  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00456857 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4369  thiamine biosynthesis protein ThiH  25.25 
 
 
377 aa  62.4  1e-08  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1841  thiamine biosynthesis protein ThiH  23 
 
 
490 aa  62  1e-08  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0513393  normal  0.233409 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1734  thiamine biosynthesis protein ThiH  24.73 
 
 
467 aa  62  1e-08  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.908145  normal  0.683505 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4467  radical SAM domain-containing protein  25.91 
 
 
396 aa  61.2  2e-08  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.82006  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4491  thiamine biosynthesis protein ThiH  25.13 
 
 
377 aa  61.6  2e-08  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.721357  hitchhiker  3.87053e-06 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4402  thiamine biosynthesis protein ThiH  24.52 
 
 
377 aa  62  2e-08  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2278  thiamine biosynthesis protein ThiH  23.58 
 
 
469 aa  61.6  2e-08  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.751586  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0608  thiamine biosynthesis protein ThiH  23.98 
 
 
370 aa  61.2  3e-08  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.499964  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0273  thiamine biosynthesis protein ThiH  26.26 
 
 
472 aa  60.5  4e-08  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3875  thiamine biosynthesis protein ThiH  25.47 
 
 
381 aa  60.5  4e-08  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3720  thiamine biosynthesis protein ThiH  26.18 
 
 
377 aa  60.5  4e-08  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.526508  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1607  biotin and thiamin synthesis associated  23.76 
 
 
472 aa  60.1  6e-08  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0259922  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2458  Biotin synthase  23.59 
 
 
339 aa  60.1  6e-08  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4565  thiamine biosynthesis protein ThiH  23.56 
 
 
377 aa  59.7  7e-08  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000453457 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0315  Radical SAM domain protein  26.9 
 
 
360 aa  59.7  8e-08  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0946  FO synthase  28.57 
 
 
860 aa  59.7  8e-08  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1125  biotin synthase  24.15 
 
 
341 aa  59.3  9e-08  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.259042  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1738  biotin synthase  27.33 
 
 
349 aa  59.3  9e-08  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2167  thiazole biosynthesis protein ThiH  22.86 
 
 
374 aa  58.9  1e-07  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0799  thiamine biosynthesis protein ThiH  24.42 
 
 
414 aa  58.9  1e-07  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0199  Radical SAM domain protein  24.1 
 
 
333 aa  58.9  1e-07  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0842  thiamine biosynthesis protein ThiH  23.16 
 
 
468 aa  58.9  1e-07  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2107  thiamine biosynthesis protein ThiH  23.19 
 
 
370 aa  58.9  1e-07  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>