More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_3186 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_3186  cysteine synthase A  100 
 
 		 310 aa  615  1e-175  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000213805  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0011  cysteine synthase A  82.74 
 
 		 310 aa  502  1e-141  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.857978  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2014  cysteine synthase A  73.94 
 
 		 309 aa  454  1e-127  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0113  normal  0.0387372 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  72.9 
 
 		 311 aa  451  1e-125  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04800  cysteine synthase A  72.31 
 
 		 309 aa  438  9.999999999999999e-123  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000597368  normal  0.814351 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2286  cysteine synthase A  72.79 
 
 		 309 aa  422  1e-117  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1149  cysteine synthase A  71.61 
 
 		 311 aa  414  1e-114  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000025777  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0549  cysteine synthase A  66.13 
 
 		 310 aa  412  1e-114  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000133483 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1551  cysteine synthase K/M/A  68.61 
 
 		 317 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1301  cysteine synthase A  66.45 
 
 		 309 aa  403  1e-111  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.568697 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2000  cysteine synthase A  69.26 
 
 		 317 aa  401  1e-111  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.982832  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1258  cysteine synthase K/M/A  68.61 
 
 		 327 aa  393  1e-108  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.198511  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3859  cysteine synthase A  69.58 
 
 		 309 aa  391  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000825635  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1971  cysteine synthase  66.13 
 
 		 308 aa  389  1e-107  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000186941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2021  cysteine synthase A  67.52 
 
 		 309 aa  387  1e-106  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0166882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1558  cysteine synthase  67.1 
 
 		 309 aa  387  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1615  cysteine synthase A  65.69 
 
 		 308 aa  382  1e-105  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0921  cysteine synthase A  63.43 
 
 		 317 aa  380  1e-104  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2871  cysteine synthase A  64.5 
 
 		 318 aa  380  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12358  cysteine synthase A cysK1  62.66 
 
 		 310 aa  375  1e-103  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0413  cysteine synthase  63.19 
 
 		 309 aa  372  1e-102  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1718  cysteine synthase A  62.58 
 
 		 308 aa  368  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000370956  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0889  cysteine synthase A  59.02 
 
 		 304 aa  370  1e-101  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1022  cysteine synthase A  62.87 
 
 		 310 aa  367  1e-100  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0422971  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2067  cysteine synthase A  61.94 
 
 		 327 aa  365  1e-100  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.197318 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3364  cysteine synthase A  60.78 
 
 		 304 aa  363  3e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000830673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05340  cysteine synthase  60.54 
 
 		 304 aa  362  6e-99  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1506  cysteine synthase A  64.4 
 
 		 309 aa  361  9e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000603625  normal  0.533317 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3334  cysteine synthase A  65.05 
 
 		 309 aa  360  2e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.229416  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2487  cysteine synthase A  61.17 
 
 		 309 aa  358  5e-98  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.074698 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0420  cysteine synthase A  62.06 
 
 		 311 aa  358  6e-98  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.858609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2657  cysteine synthase A  64.4 
 
 		 309 aa  358  9e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.249918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2427  cysteine synthase  60.91 
 
 		 309 aa  357  9.999999999999999e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00952791  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4128  cysteine synthase  62.21 
 
 		 310 aa  356  1.9999999999999998e-97  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0364  cysteine synthase  63.64 
 
 		 322 aa  356  2.9999999999999997e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3067  cysteine synthase  60.39 
 
 		 316 aa  356  2.9999999999999997e-97  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0922  cysteine synthase A  58.03 
 
 		 304 aa  356  2.9999999999999997e-97  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.107998  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  59.28 
 
 		 312 aa  353  2e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2003  cysteine synthase A  60.84 
 
 		 308 aa  353  2e-96  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.537357 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2233  cysteine synthase A  60.91 
 
 		 308 aa  353  2e-96  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24430  cysteine synthase  60.65 
 
 		 311 aa  353  2e-96  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.653671  normal  0.574826 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1235  cysteine synthase  60.65 
 
 		 320 aa  352  2.9999999999999997e-96  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.779914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4407  cysteine synthase A  60.32 
 
 		 328 aa  351  8.999999999999999e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.119856 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2364  cysteine synthase  60.91 
 
 		 310 aa  351  1e-95  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.174971  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0152  cysteine synthase  59.74 
 
 		 310 aa  350  2e-95  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1983  cysteine synthase A  58.9 
 
 		 309 aa  350  3e-95  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.722669  normal  0.957709 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  58.96 
 
 		 312 aa  348  5e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2422  cysteine synthase  60.32 
 
 		 308 aa  347  1e-94  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0516344 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2677  cysteine synthase A  59.55 
 
 		 309 aa  347  1e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.601381  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1280  cysteine synthase  58.9 
 
 		 309 aa  347  1e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0485567  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3549  cysteine synthase A  60.26 
 
 		 322 aa  347  1e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2195  cysteine synthase A  59.03 
 
 		 311 aa  347  1e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000876073 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0452  cysteine synthase  58.58 
 
 		 319 aa  347  2e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.118838 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2176  cysteine synthase A  60.06 
 
 		 309 aa  347  2e-94  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.265161  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0154  cysteine synthase K/M/A  55.74 
 
 		 307 aa  347  2e-94  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000000054726  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0548  cysteine synthase A  58.88 
 
 		 310 aa  346  3e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0535  cysteine synthase A  58.88 
 
 		 310 aa  346  3e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.775182  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2581  cysteine synthase A  59.22 
 
 		 309 aa  345  4e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2297  cysteine synthases  58.31 
 
 		 308 aa  346  4e-94  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2853  cysteine synthase A  58.96 
 
 		 320 aa  345  6e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1332  cysteine synthase A  59.74 
 
 		 309 aa  345  8e-94  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000281475  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4757  cysteine synthase A  58.17 
 
 		 328 aa  344  1e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.157844 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2681  cysteine synthase A  58.58 
 
 		 308 aa  343  1e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0782138 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2237  cysteine synthase A  59.12 
 
 		 317 aa  344  1e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.425208 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1219  cysteine synthase A  60.65 
 
 		 309 aa  343  2e-93  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.913066  normal  0.187801 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3416  cysteine synthase  55.52 
 
 		 311 aa  343  2e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1476  cysteine synthase A  59.55 
 
 		 324 aa  342  2.9999999999999997e-93  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0030  cysteine synthase A  60.19 
 
 		 311 aa  343  2.9999999999999997e-93  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0433  cysteine synthase K/M/A  57 
 
 		 307 aa  342  4e-93  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.818582  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2853  cysteine synthase A  60.84 
 
 		 311 aa  341  7e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000434249  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3400  cysteine synthase  58.9 
 
 		 313 aa  341  8e-93  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3794  cysteine synthase  56.68 
 
 		 339 aa  341  1e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2446  cysteine synthase  57.74 
 
 		 311 aa  340  1e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00671922  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2759  cysteine synthase A  60.52 
 
 		 311 aa  340  2e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4605  cysteine synthase A  60.91 
 
 		 320 aa  340  2e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1390  cysteine synthase  59.81 
 
 		 311 aa  340  2e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.173456  normal  0.100727 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0559  cysteine synthase A  62.09 
 
 		 332 aa  340  2e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.770107  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23060  cysteine synthase A  62.62 
 
 		 305 aa  339  2.9999999999999998e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000228532  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1671  cysteine synthase A  58.39 
 
 		 311 aa  339  2.9999999999999998e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.422965  normal  0.494898 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2096  cysteine synthase  62.01 
 
 		 323 aa  339  2.9999999999999998e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.553585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5019  cysteine synthase  56.17 
 
 		 320 aa  339  4e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0961303  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3782  cysteine synthase  55.34 
 
 		 320 aa  338  5e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00462193  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3068  cysteine synthase A  57.55 
 
 		 316 aa  338  5.9999999999999996e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0145676  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0234  cysteine synthase K/M/A  59.09 
 
 		 314 aa  338  5.9999999999999996e-92  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0178  cysteine synthase A  61.24 
 
 		 331 aa  338  5.9999999999999996e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3256  cysteine synthase A  60.46 
 
 		 309 aa  338  5.9999999999999996e-92  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0076  cysteine synthase A  61.56 
 
 		 307 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00534286 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2508  cysteine synthase  57.28 
 
 		 320 aa  336  2.9999999999999997e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000293117  normal  0.173804 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1336  cysteine synthase A  59.22 
 
 		 311 aa  336  2.9999999999999997e-91  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0535  cysteine synthase A  60.07 
 
 		 307 aa  335  5e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0678503  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0213  cysteine synthase  58.96 
 
 		 329 aa  335  5e-91  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0914276  normal  0.144885 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4307  cysteine synthase  58.96 
 
 		 309 aa  335  5e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.782932  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1638  cysteine synthase A  55.88 
 
 		 309 aa  335  7e-91  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.444809  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4340  cysteine synthase A  60.59 
 
 		 320 aa  335  7.999999999999999e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.238175  normal  0.899822 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2560  cysteine synthase A  60.46 
 
 		 310 aa  334  9e-91  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12320  cysteine synthase  57.65 
 
 		 309 aa  333  2e-90  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.154234  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1790  cysteine synthase  57.91 
 
 		 323 aa  333  2e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.475157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1385  cysteine synthase  53.25 
 
 		 311 aa  333  2e-90  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.9014  normal  0.484311 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2658  cysteine synthase  58.63 
 
 		 310 aa  333  2e-90  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.556672 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0452  cysteine synthases  59.55 
 
 		 308 aa  333  2e-90  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>