158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_3177 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  SAG1280  SNF2 family protein  37.77 
 
 		 2274 aa  750    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.459246  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9541  helicase SNF2 family  33.97 
 
 		 1701 aa  894    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.398827  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2221  helicase, C-terminal  39.46 
 
 		 1669 aa  1112    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.332048 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2546  helicase, C-terminal  39.04 
 
 		 1669 aa  1122    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.26749 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6722  Methyltransferase type 11  32.49 
 
 		 1674 aa  665    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4295  helicase-like  38.1 
 
 		 1726 aa  979    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4914  helicase  34.26 
 
 		 1706 aa  974    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4476  helicase-like  33.88 
 
 		 1703 aa  916    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4656  N-6 DNA methylase  34.02 
 
 		 1700 aa  907    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4316  methyltransferase type 11  34.23 
 
 		 1516 aa  833    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4540  helicase domain protein  33.38 
 
 		 1606 aa  795    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4173  helicase domain-containing protein  33.04 
 
 		 1575 aa  768    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4747  helicase domain-containing protein  32.36 
 
 		 1925 aa  655    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.099466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4259  helicase domain-containing protein  29.85 
 
 		 2570 aa  732    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3177  helicase domain protein  100 
 
 		 2077 aa  4286    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4301  helicase, C-terminal  34.6 
 
 		 1649 aa  934    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.182147 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1578  helicase domain-containing protein  38.5 
 
 		 1642 aa  1119    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.149983 
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0010  cpp14  34.72 
 
 		 1932 aa  823    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0437256  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0264  hypothetical protein  34.33 
 
 		 1748 aa  922    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4742  N-6 DNA methylase  33.84 
 
 		 1702 aa  903    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0160  Cpp14  31.31 
 
 		 2117 aa  677    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.296407  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4893  DEAD-like helicase  36.19 
 
 		 1417 aa  806    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4973  helicase domain-containing protein  33.86 
 
 		 1697 aa  895    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.664795 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2730  helicase domain protein  31.06 
 
 		 1722 aa  708    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.52816  normal  0.452434 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9162  helicase SNF2 family  34.13 
 
 		 1697 aa  912    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1824  helicase domain protein  48.03 
 
 		 2098 aa  1267    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a002  DNA methylase/helicase  35.89 
 
 		 1934 aa  836    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0978124  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3732  helicase domain-containing protein  33.27 
 
 		 1693 aa  874    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253895  normal  0.261793 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5280  methyltransferase type 11  29.4 
 
 		 1594 aa  597  1e-168  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00107926  unclonable  0.0024977 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8083  helicase  32.69 
 
 		 1211 aa  591  1e-167  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0239915  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0870  SNF2-related protein  38.74 
 
 		 2005 aa  576  1.0000000000000001e-162  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4933  helicase domain protein  30.68 
 
 		 1956 aa  461  9.999999999999999e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5796  helicase domain-containing protein  32.76 
 
 		 976 aa  446  1e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00607211  hitchhiker  2.23463e-19 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4475  helicase domain-containing protein  28.94 
 
 		 761 aa  261  1e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1500  hypothetical protein  29.97 
 
 		 763 aa  260  2e-67  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00538454 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0387  putative DNA methylase  32.8 
 
 		 766 aa  254  1e-65  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8079  helicase SNF2 family  36.18 
 
 		 470 aa  218  8e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.48311  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0847  hypothetical protein  33.66 
 
 		 526 aa  165  8.000000000000001e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000203105 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1826  hypothetical protein  38.76 
 
 		 442 aa  155  5.9999999999999996e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6184  helicase domain protein  34.29 
 
 		 284 aa  118  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0111751 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3075  DEAD-like helicase  23.1 
 
 		 1328 aa  98.2  1e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3018  helicase domain-containing protein  24.86 
 
 		 678 aa  98.2  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1466  SNF2 family helicase  24.24 
 
 		 1379 aa  86.7  0.000000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.942792  normal  0.0166873 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2349  hypothetical protein  25.43 
 
 		 341 aa  70.5  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0743518  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1570  hypothetical protein  24.24 
 
 		 341 aa  69.3  0.0000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.447914  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0796  hypothetical protein  25.85 
 
 		 339 aa  66.2  0.000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4314  adenine-specific DNA methylase-like protein  34.82 
 
 		 246 aa  62.4  0.00000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.1972  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3003  hypothetical protein  42.37 
 
 		 282 aa  61.6  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000551864  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1123  helicase domain protein  26.25 
 
 		 1169 aa  62  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5353  helicase domain protein  28.57 
 
 		 894 aa  61.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.157102 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3539  SNF2-related protein  21.83 
 
 		 872 aa  60.8  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0202  helicase domain protein  27.15 
 
 		 1170 aa  60.5  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0567319 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0633  helicase domain-containing protein  26.25 
 
 		 1169 aa  60.8  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0610  SNF2 family helicase  22.16 
 
 		 1175 aa  59.7  0.0000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0240  helicase domain-containing protein  35.65 
 
 		 1116 aa  59.3  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956133  hitchhiker  0.00192271 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0664  SNF2-related protein  20.44 
 
 		 1125 aa  57.8  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1345  helicase domain protein  25.6 
 
 		 953 aa  58.2  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2539  helicase domain-containing protein  27.21 
 
 		 969 aa  58.2  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000371025  decreased coverage  0.000313651 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1544  helicase-like protein  25.81 
 
 		 933 aa  57.4  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1468  adenine-specific DNA methylase  28.78 
 
 		 254 aa  56.6  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00771536 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3216  Non-specific serine/threonine protein kinase  22.73 
 
 		 925 aa  56.2  0.000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.456162  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3354  SNF2-related protein  23.72 
 
 		 924 aa  55.8  0.000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2766  helicase domain-containing protein  26.97 
 
 		 906 aa  54.7  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.388883  hitchhiker  0.00506204 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2671  helicase domain protein  25.47 
 
 		 949 aa  54.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.672635 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1331  Non-specific serine/threonine protein kinase  23.96 
 
 		 933 aa  54.3  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0072  RecQ helicase, putative  24.09 
 
 		 468 aa  53.9  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1148  putative helicase  22.46 
 
 		 1069 aa  53.9  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0135217  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1303  helicase domain-containing protein  32.17 
 
 		 669 aa  53.9  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5797  methyltransferase type 11  25.71 
 
 		 577 aa  53.1  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.295406  hitchhiker  4.23938e-17 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1846  helicase domain-containing protein  23.35 
 
 		 1170 aa  53.5  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1234  helicase domain protein  22.94 
 
 		 1170 aa  52.8  0.00006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0795356  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1920  helicase domain protein  26.39 
 
 		 971 aa  52.8  0.00007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2988  helicase domain-containing protein  23.23 
 
 		 1167 aa  52.8  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.249556  normal  0.0303963 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3005  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  25.34 
 
 		 1212 aa  52.4  0.00009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3468  DNA primase catalytic core domain protein  37.21 
 
 		 555 aa  52.4  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0196475  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0233  Type III restriction enzyme, res subunit  26.84 
 
 		 900 aa  51.6  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179652  decreased coverage  0.00064314 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0986  DNA/RNA helicase, SNF2  21.62 
 
 		 1069 aa  50.8  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2016  helicase domain-containing protein  22.69 
 
 		 948 aa  50.8  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3352  hypothetical protein  28.43 
 
 		 919 aa  51.6  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.14559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2198  helicase domain-containing protein  31.96 
 
 		 1046 aa  51.2  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.33194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2451  SNF2-related protein  21.89 
 
 		 1087 aa  51.2  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3247  N-6 DNA methylase  30.7 
 
 		 748 aa  51.2  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3297  helicase domain protein  24.62 
 
 		 946 aa  50.8  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1877  helicase domain-containing protein  25.69 
 
 		 1172 aa  50.4  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.464999  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1422  helicase domain protein  25.56 
 
 		 958 aa  50.8  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2408  SNF2-related  23.92 
 
 		 1163 aa  50.1  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.644608  normal  0.0402994 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3677  helicase, C-terminal:dead/deah box helicase, n-terminal  27.54 
 
 		 1043 aa  50.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0680  helicase domain-containing protein  24.84 
 
 		 1167 aa  50.1  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.272356 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13470  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  22.06 
 
 		 1102 aa  50.4  0.0004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0637  helicase domain protein  27.43 
 
 		 1168 aa  50.1  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3098  helicase domain protein  21.04 
 
 		 922 aa  50.1  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.348218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1706  helicase domain protein  29.09 
 
 		 952 aa  49.7  0.0006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.703418  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18000  DEAD box and SNF-like helicase domain-containing protein  27.09 
 
 		 1357 aa  49.7  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.153374  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1301  helicase domain-containing protein  26.32 
 
 		 958 aa  49.7  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2134  helicase domain protein  26.83 
 
 		 927 aa  49.7  0.0006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1597  Snf2/Rad54 family helicase  22.31 
 
 		 1084 aa  49.3  0.0007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.154649  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5521  LtrC-like protein  32.89 
 
 		 347 aa  49.3  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.466039  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2682  prophage LambdaMc01, SNF2 family helicase  28.93 
 
 		 925 aa  49.3  0.0008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.354251  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2833  SNF2-related protein  22.76 
 
 		 991 aa  49.3  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3187  helicase domain protein  25.41 
 
 		 969 aa  49.3  0.0009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>