44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_3117 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_3117  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  100 
 
 		 430 aa  859    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2125  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  73.09 
 
 		 431 aa  643    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.145856  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1311  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  28.37 
 
 		 443 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.766434  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14600  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  30.77 
 
 		 445 aa  77  0.0000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000227922  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1492  accessory gene regulator protein C  27.01 
 
 		 429 aa  68.6  0.0000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.108947  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2401  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  25.38 
 
 		 456 aa  58.5  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.283788  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1749  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  23.56 
 
 		 534 aa  57  0.0000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000244457  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2021  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  24.61 
 
 		 534 aa  56.6  0.0000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.769355  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4311  sensory histidine kinase DcuS  25.13 
 
 		 533 aa  55.8  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000412968  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2224  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  23.56 
 
 		 541 aa  55.1  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.691075  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1870  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  26.77 
 
 		 470 aa  55.5  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000031179  normal  0.169965 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2325  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  23.56 
 
 		 531 aa  55.1  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.18048  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3731  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  25.41 
 
 		 532 aa  53.1  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.95506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0401  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  24.3 
 
 		 479 aa  52  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1570  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  26.06 
 
 		 278 aa  51.6  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000677983 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3688  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  29.75 
 
 		 280 aa  50.1  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0032  histidine kinase-related ATPase, putative  29.57 
 
 		 248 aa  49.7  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000737644  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0385  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  22.91 
 
 		 280 aa  49.7  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01630  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  26.85 
 
 		 325 aa  48.9  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0496  sensory histidine kinase DcuS  27.65 
 
 		 528 aa  48.5  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2269  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  29.25 
 
 		 442 aa  48.1  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0058  sensor kinase DpiB  25.34 
 
 		 552 aa  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.390736  normal  0.361929 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0060  sensor kinase DpiB  25.34 
 
 		 552 aa  47.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1650  signal transduction protein  25.23 
 
 		 446 aa  47.4  0.0005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.660835  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0057  sensor kinase DpiB  25.34 
 
 		 552 aa  47.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0425242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0058  sensor kinase DpiB  25.34 
 
 		 552 aa  47.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.736152  normal  0.965676 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1622  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  20.47 
 
 		 275 aa  47  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2790  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  32.38 
 
 		 547 aa  47  0.0007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000273411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0059  sensor kinase DpiB  25.34 
 
 		 552 aa  46.6  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3378  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  26.17 
 
 		 545 aa  46.6  0.0009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.960766  normal  0.505448 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0614  sensory histidine kinase DcuS  28.14 
 
 		 534 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0639  sensory histidine kinase DcuS  28.57 
 
 		 534 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0745  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  20.81 
 
 		 460 aa  45.1  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0576  sensory histidine kinase DcuS  27.88 
 
 		 534 aa  44.7  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.391584  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0545  sensory histidine kinase DcuS  27.88 
 
 		 534 aa  44.7  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.847766  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5600  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  21.51 
 
 		 549 aa  44.3  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0363476  normal  0.371514 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0700  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  22.87 
 
 		 543 aa  44.7  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4725  sensory histidine kinase DcuS  27.88 
 
 		 534 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.678206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0975  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  25.12 
 
 		 242 aa  44.7  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0490  sensory histidine kinase DcuS  27.88 
 
 		 534 aa  43.9  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2789  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  24.49 
 
 		 536 aa  44.3  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2769  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  26.37 
 
 		 303 aa  43.5  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3005  histidine kinase domain protein  24.88 
 
 		 406 aa  43.1  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000219029 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0811  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  22.7 
 
 		 529 aa  43.1  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>