45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_3076 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_3076  helix-turn-helix domain protein  100 
 
 		 116 aa  236  5.999999999999999e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3545  hypothetical protein  45.65 
 
 		 140 aa  84.3  5e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3829  hypothetical protein  45.65 
 
 		 137 aa  84.3  5e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0853  XRE family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 110 aa  78.2  0.00000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0869  helix-turn-helix domain-containing protein  33.01 
 
 		 110 aa  78.2  0.00000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2969  helix-turn-helix domain-containing protein  41 
 
 		 140 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000418472  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4801  helix-turn-helix domain protein  39.58 
 
 		 261 aa  68.6  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0652  XRE family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 115 aa  64.3  0.0000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3075  transcriptional regulator, XRE family  46.55 
 
 		 105 aa  64.7  0.0000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5811  helix-turn-helix domain-containing protein  33.61 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1099  XRE family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 115 aa  58.5  0.00000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2269  XRE family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 127 aa  55.1  0.0000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0575  XRE family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 115 aa  50.4  0.000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000142648  normal  0.969931 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0637  XRE family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 115 aa  50.4  0.000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000152617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1715  XRE family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 152 aa  48.9  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000119777  normal  0.864438 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1983  XRE family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 224 aa  49.3  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.675652  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07480  helix-turn-helix domain protein  41.54 
 
 		 301 aa  47.8  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.961759  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2436  transcriptional regulator, XRE family  35.71 
 
 		 104 aa  47.4  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3618  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 123 aa  47  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0801  XRE family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 111 aa  47  0.00009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000260527  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2792  XRE family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 124 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2730  putative DNA-binding protein  29.66 
 
 		 117 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000010572  hitchhiker  0.0000267972 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2429  transcriptional regulator, XRE family  24.19 
 
 		 127 aa  45.4  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00159098 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1687  XRE family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 111 aa  44.7  0.0004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00137686  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0916  XRE family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 115 aa  44.3  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0157  XRE family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 104 aa  44.7  0.0005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1027  transcriptional regulator, XRE family  32.65 
 
 		 321 aa  43.9  0.0007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0468  transcriptional regulator, XRE family  33.82 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000157698  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1067  transcriptional regulator, XRE family  33.82 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0145003  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2431  transcriptional regulator, XRE family  34.72 
 
 		 125 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000620136 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1536  XRE family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000192841  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1882  prophage LambdaSa2, repressor protein, putative  33.82 
 
 		 120 aa  43.1  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.124676  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3317  transcriptional regulator, XRE family  41.94 
 
 		 281 aa  42  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000786405  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20950  putative prophage repressor  38.1 
 
 		 200 aa  42.4  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000578065  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0218  Cro/CI family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 158 aa  42  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.631577  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2146  transcriptional regulator, XRE family  34.72 
 
 		 206 aa  41.6  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0483341  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1344  XRE family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 110 aa  41.6  0.004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.043914  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4126  prophage LambdaBa02, repressor protein  31.88 
 
 		 122 aa  41.2  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.158818  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3459  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 145 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3831  prophage LambdaBa02, repressor protein  31.88 
 
 		 122 aa  41.2  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0071415  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3465  XRE family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 142 aa  40.8  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2209  putative DNA-binding protein  28.04 
 
 		 117 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.706329  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3352  putative phage repressor  33.33 
 
 		 240 aa  40  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.140887  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0471  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  27.94 
 
 		 72 aa  40.4  0.009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000142015  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1628  XRE family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 133 aa  40  0.01  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>