More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_3007 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_3007  ferric uptake regulator, Fur family  100 
 
 		 143 aa  298  2e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0515  ferric uptake regulator, Fur family  43.7 
 
 		 142 aa  130  6.999999999999999e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0546  ferric uptake regulator family protein  43.55 
 
 		 139 aa  113  7.999999999999999e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1373  ferric uptake regulator, Fur family  40.62 
 
 		 135 aa  99  2e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000536701  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1713  FUR family transcriptional regulator  39.69 
 
 		 136 aa  89.7  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0366911  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1445  FUR family transcriptional regulator  38.17 
 
 		 136 aa  85.5  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0423256  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1892  Fur family transcriptional regulator  37.9 
 
 		 141 aa  85.1  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0939  ferric uptake regulator family protein  32.56 
 
 		 158 aa  84.3  6e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2189  ferric uptake regulator, Fur family  34.35 
 
 		 140 aa  82.4  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000532241  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2982  ferric uptake regulator, Fur family  35.61 
 
 		 154 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000154751  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1493  ferric uptake regulator family protein  34.92 
 
 		 146 aa  82  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000138692  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2612  ferric uptake regulator, Fur family  35.11 
 
 		 146 aa  80.9  0.000000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.539435  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0045  ferric uptake regulator, Fur family  34.65 
 
 		 137 aa  80.9  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.4921e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_571  transcriptional regulator, Fur family  33.09 
 
 		 143 aa  80.5  0.000000000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3944  ferric uptake regulator, Fur family  29.01 
 
 		 151 aa  80.5  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.701643  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4057  ferric uptake regulator, Fur family  29.01 
 
 		 151 aa  80.5  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3272  ferric uptake regulator, Fur family  33.33 
 
 		 138 aa  80.1  0.000000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.710175  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0603  ferric uptake regulator family protein  34.35 
 
 		 143 aa  80.5  0.000000000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0630  FUR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 143 aa  80.1  0.000000000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0223  transcriptional regulator  33.59 
 
 		 145 aa  80.1  0.000000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3924  ferric uptake regulator family protein  33.33 
 
 		 149 aa  80.1  0.000000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2644  ferric uptake regulator family protein  39.23 
 
 		 146 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0817  ferric uptake regulator family protein  33.85 
 
 		 130 aa  80.1  0.00000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0247  ferric uptake transcriptional (FUR)-like transcription regulator protein  28.47 
 
 		 151 aa  79.3  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.406535  normal  0.140515 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4383  ferric uptake regulator, Fur family  33.08 
 
 		 132 aa  79.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.134348 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1147  ferric uptake regulator family protein  38.41 
 
 		 155 aa  79  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3002  ferric uptake regulator family protein  34.81 
 
 		 153 aa  79  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000499535  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1481  ferric uptake regulator family protein  31.88 
 
 		 140 aa  78.6  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.268678  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1722  ferric uptake regulator family protein  37.59 
 
 		 146 aa  79  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.907916 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6009  ferric uptake regulator family protein  32.86 
 
 		 155 aa  79  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.964976 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4555  ferric uptake regulator family protein  31.11 
 
 		 145 aa  79  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0934  ferric uptake regulator family protein  32.84 
 
 		 147 aa  77.8  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.634788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1953  ferric uptake regulator family protein  31.71 
 
 		 131 aa  78.2  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00726041 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2468  ferric uptake regulator, Fur family  30.4 
 
 		 146 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0653957  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0405  ferric uptake regulator family protein  33.86 
 
 		 134 aa  77.4  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.165057 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1048  ferric uptake regulator family protein  33.09 
 
 		 152 aa  76.3  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000518354  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0519  ferric uptake regulator family protein  30.83 
 
 		 135 aa  76.6  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.639512  normal  0.494415 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1064  ferric uptake regulator family protein  33.33 
 
 		 152 aa  75.5  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193805  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1562  ferric uptake regulator, Fur family  33.07 
 
 		 147 aa  75.9  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2513  ferric uptake regulator, Fur family  39.2 
 
 		 137 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.275348  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0772  ferric uptake regulator family protein  32.8 
 
 		 147 aa  75.5  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.230128  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1806  ferric uptake regulator family protein  34.13 
 
 		 141 aa  75.1  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.696064  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05900  ferric uptake regulator, Fur family  37.04 
 
 		 145 aa  75.1  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000248432  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0432  ferric uptake regulator family protein  38.79 
 
 		 123 aa  75.1  0.0000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.089656  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1364  ferric uptake regulator, Fur family  31.45 
 
 		 152 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4078  ferric uptake regulator, Fur family  37.21 
 
 		 144 aa  75.5  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000739269  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1143  ferric uptake regulation protein  28.68 
 
 		 154 aa  75.1  0.0000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0587945  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2859  ferric-uptake regulator  31.82 
 
 		 140 aa  74.7  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0644498  normal  0.141734 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0406  ferric uptake regulator, Fur family  29.46 
 
 		 139 aa  74.7  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3535  ferric uptake regulator, Fur family  31.3 
 
 		 144 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4185  ferric uptake regulator, Fur family  32.31 
 
 		 139 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.421488  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3508  ferric uptake regulator  32.03 
 
 		 134 aa  74.3  0.0000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1301  ferric uptake regulator family protein  34.88 
 
 		 166 aa  74.3  0.0000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0281675  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2717  ferric uptake regulator family protein  32.26 
 
 		 134 aa  73.9  0.0000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.519221 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3601  ferric uptake regulator, Fur family  31.3 
 
 		 144 aa  73.9  0.0000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0592  FUR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 142 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.311415  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0505  FUR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 144 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.316228  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0448  ferric uptake regulator  32.58 
 
 		 144 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0520  transcriptional regulator, Fur family  32.58 
 
 		 142 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000515951 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0444  ferric uptake regulator  32.58 
 
 		 144 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0603  ferric uptake regulator family protein  28.24 
 
 		 138 aa  73.2  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.401566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0537  FUR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 144 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00799734  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0542  transcriptional regulator, Fur family  32.58 
 
 		 142 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0487  ferric uptake regulation protein  32.12 
 
 		 151 aa  72.8  0.000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11800  zinc uptake regulator, Fur family  32 
 
 		 129 aa  73.2  0.000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00894406  normal  0.765019 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1460  ferric uptake regulator, Fur family  29.01 
 
 		 161 aa  73.2  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1138  ferric uptake regulator, Fur family  37.4 
 
 		 143 aa  72.8  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.716078  normal  0.825565 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1599  ferric uptake regulator, Fur family  33.06 
 
 		 135 aa  72.8  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.4089  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1379  ferric uptake regulation protein Fur  30.95 
 
 		 143 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.404925  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0990  ferric uptake regulator family protein  30.08 
 
 		 133 aa  72.8  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0459  ferric uptake regulator family protein  32.58 
 
 		 143 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00576361  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7202  ferric uptake regulator, Fur family  31.82 
 
 		 128 aa  72  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0825  ferric uptake regulator family protein  33.06 
 
 		 121 aa  72.4  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0458  ferric uptake regulator, Fur family  32.82 
 
 		 158 aa  72  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000485327 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0282  ferric uptake regulation protein  32.82 
 
 		 158 aa  72  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0802  ferric uptake regulator family protein  33.06 
 
 		 121 aa  72.4  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3820  ferric uptake regulator family protein  30.65 
 
 		 131 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.396621  normal  0.536437 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0224  putative iron-regulated membrane protein  29.71 
 
 		 155 aa  72.4  0.000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0593  transcriptional regulator, Fur family  31.82 
 
 		 142 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000040057  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2902  ferric uptake regulator  29.92 
 
 		 148 aa  72  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  2.30182e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1952  negative regulator of ferric uptake  32.8 
 
 		 143 aa  71.6  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1389  ferric uptake regulation protein  29.86 
 
 		 145 aa  71.6  0.000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000000498211  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2986  ferric uptake regulator, Fur family  32.56 
 
 		 143 aa  72  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.105319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4784  transcriptional regulator, Fur family  31.82 
 
 		 142 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000324074  hitchhiker  0.00000172777 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2991  ferric uptake regulator  29.92 
 
 		 148 aa  72  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00139405  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0453  ferric uptake regulator family protein  31.82 
 
 		 142 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.964373  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2976  ferric uptake regulator family protein  29.69 
 
 		 143 aa  72  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2147  ferric uptake regulation protein  28.99 
 
 		 155 aa  72  0.000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000154091  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2576  ferric uptake regulator, Fur family  32.56 
 
 		 143 aa  72  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.710249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1451  ferric uptake regulation protein  29.86 
 
 		 155 aa  71.6  0.000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000060196  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2626  ferric uptake regulator, Fur family  32.54 
 
 		 143 aa  71.6  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4538  ferric uptake regulator family protein  31.2 
 
 		 134 aa  71.2  0.000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0148082  normal  0.344615 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2043  ferric uptake regulator family protein  29.1 
 
 		 144 aa  71.2  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0570  ferric uptake regulator family protein  30.16 
 
 		 142 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.233033 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1885  ferric uptake regulator family protein  29.92 
 
 		 143 aa  71.2  0.000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2837  ferric uptake regulator family protein  29.69 
 
 		 143 aa  71.2  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3735  ferric uptake regulator family protein  30.16 
 
 		 142 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.345676 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2152  ferric uptake regulator  31.82 
 
 		 140 aa  71.2  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0544  ferric uptake regulator family protein  30.16 
 
 		 142 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0596927  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2737  ferric uptake regulator family protein  30.16 
 
 		 142 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.348547  normal  0.830954 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>