119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2997 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_2997  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 
462 aa  936  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  3.66828e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3719  extracellular solute-binding protein family 1  38.11 
 
 
441 aa  308  1e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.707833  normal  0.0540576 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1759  extracellular solute-binding protein family 1  39.95 
 
 
436 aa  306  5e-82  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.071409  normal  0.0857732 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1478  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  35.62 
 
 
439 aa  266  4e-70  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000417686  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1651  extracellular solute-binding protein  25.34 
 
 
427 aa  68.6  3e-10  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.660801  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1025  extracellular solute-binding protein family 1  26.03 
 
 
444 aa  68.2  3e-10  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  3.99953e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1485  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  24.62 
 
 
429 aa  67.8  4e-10  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0238  extracellular solute-binding protein family 1  24.46 
 
 
423 aa  66.6  8e-10  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3350  extracellular solute-binding protein family 1  29.68 
 
 
461 aa  66.6  9e-10  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0614  extracellular solute-binding protein family 1  23.83 
 
 
435 aa  65.5  2e-09  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0145  extracellular solute-binding protein family 1  23.3 
 
 
442 aa  65.9  2e-09  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3613  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 
429 aa  64.7  3e-09  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.249837  normal  0.747368 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4586  extracellular solute-binding protein family 1  29.95 
 
 
417 aa  65.1  3e-09  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.947174 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  26.92 
 
 
495 aa  64.7  3e-09  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2657  extracellular solute-binding protein family 1  24.76 
 
 
422 aa  64.3  4e-09  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  1.00934e-05  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4419  extracellular solute-binding protein family 1  22.59 
 
 
456 aa  63.2  1e-08  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6024  extracellular solute-binding protein  22.78 
 
 
412 aa  62.4  2e-08  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09490  extracellular solute-binding protein family 1  24.29 
 
 
424 aa  62  2e-08  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.48456e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1010  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.31 
 
 
380 aa  62  2e-08  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.283496  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4880  extracellular solute-binding protein  23.1 
 
 
412 aa  62.4  2e-08  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3285  extracellular solute-binding protein  23.1 
 
 
412 aa  62.4  2e-08  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6324  extracellular solute-binding protein  22.47 
 
 
412 aa  60.8  5e-08  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1301  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  26.3 
 
 
441 aa  60.8  5e-08  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4038  extracellular solute-binding protein family 1  25.75 
 
 
405 aa  59.3  1e-07  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2351  extracellular solute-binding protein  28.43 
 
 
421 aa  59.3  1e-07  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.576024  normal  0.167209 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3196  extracellular solute-binding protein  26.88 
 
 
419 aa  58.9  2e-07  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.461238  normal  0.154514 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4577  extracellular solute-binding protein  27.56 
 
 
419 aa  58.5  2e-07  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00216886 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5487  extracellular solute-binding protein  27.17 
 
 
419 aa  58.9  2e-07  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  decreased coverage  8.66815e-05 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5201  extracellular solute-binding protein  27.56 
 
 
420 aa  58.2  3e-07  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2706  extracellular solute-binding protein  25.25 
 
 
422 aa  58.2  3e-07  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.5087  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0477  extracellular solute-binding protein family 1  22.79 
 
 
432 aa  58.5  3e-07  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838392  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5658  extracellular solute-binding protein  27.56 
 
 
420 aa  58.2  3e-07  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0866592  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4932  extracellular solute-binding protein  27.17 
 
 
419 aa  58.2  3e-07  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0556288 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2646  extracellular solute-binding protein family 1  25.57 
 
 
419 aa  57.8  4e-07  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0628324  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4648  extracellular solute-binding protein family 1  23.77 
 
 
448 aa  57.8  4e-07  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000260895 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2696  extracellular solute-binding protein  28.3 
 
 
420 aa  57.8  5e-07  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.240659  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2906  extracellular solute-binding protein family 1  25.57 
 
 
419 aa  57.4  6e-07  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.194008  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  27.62 
 
 
429 aa  56.6  8e-07  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0516  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  25 
 
 
419 aa  55.8  1e-06  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.367443  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3405  extracellular solute-binding protein  23.84 
 
 
419 aa  56.6  1e-06  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1874  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  25.96 
 
 
427 aa  56.2  1e-06  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0756635  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2472  extracellular solute-binding protein  24.67 
 
 
419 aa  56.2  1e-06  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.250047 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3587  extracellular solute-binding protein family 1  22.35 
 
 
441 aa  55.8  2e-06  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.935518  normal  0.988969 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3041  extracellular solute-binding protein  21.1 
 
 
429 aa  54.7  4e-06  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.887996  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1999  extracellular solute-binding protein family 1  23.1 
 
 
468 aa  54.3  5e-06  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0449  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  25 
 
 
419 aa  54.3  5e-06  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3712  extracellular solute-binding protein family 1  25.29 
 
 
421 aa  54.3  5e-06  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.411366 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  25.9 
 
 
420 aa  53.9  6e-06  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0923  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  23.28 
 
 
450 aa  52.8  1e-05  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.293658  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1133  extracellular solute-binding protein family 1  24.6 
 
 
451 aa  52.8  1e-05  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3251  extracellular solute-binding protein family 1  24.27 
 
 
427 aa  53.1  1e-05  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1529  extracellular solute-binding protein  24.82 
 
 
439 aa  52.8  1e-05  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4751  extracellular solute-binding protein family 1  28.02 
 
 
417 aa  52  2e-05  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.137656  normal  0.378465 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5673  extracellular solute-binding protein family 1  24.77 
 
 
435 aa  52  2e-05  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0285739  normal  0.0925972 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2526  extracellular solute-binding protein family 1  27.22 
 
 
520 aa  52.4  2e-05  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  4.30481e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16660  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.44 
 
 
406 aa  51.6  3e-05  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.613471  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0529  extracellular solute-binding protein  22.94 
 
 
464 aa  51.6  3e-05  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.361956  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3587  extracellular solute-binding protein  26.29 
 
 
447 aa  51.6  3e-05  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.69287  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8236  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  25.79 
 
 
434 aa  51.6  3e-05  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.953199  normal  0.764848 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3546  extracellular solute-binding protein  24.5 
 
 
419 aa  51.6  3e-05  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  4.21461e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7695  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  24.65 
 
 
435 aa  51.2  4e-05  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.397837  normal  0.53163 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3153  extracellular solute-binding protein  25.12 
 
 
417 aa  50.8  5e-05  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000182033  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0803  extracellular solute-binding protein  23.66 
 
 
435 aa  50.8  5e-05  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3052  extracellular solute-binding protein family 1  23.84 
 
 
427 aa  50.4  7e-05  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.854825  normal  0.208902 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0208  putative extracellular solute-binding protein  23.93 
 
 
458 aa  50.1  9e-05  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0085185  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0996  extracellular solute-binding protein family 1  23.18 
 
 
455 aa  49.3  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4662  extracellular solute-binding protein family 1  27.05 
 
 
417 aa  49.7  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.917353 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7218  extracellular solute-binding protein  22.68 
 
 
412 aa  49.7  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3494  extracellular solute-binding protein  25.77 
 
 
414 aa  48.5  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0194042 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3054  extracellular solute-binding protein family 1  21.63 
 
 
429 aa  48.9  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0183103 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0803  extracellular solute-binding protein  21.7 
 
 
433 aa  48.9  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.437157  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0589  extracellular solute-binding protein  34.85 
 
 
414 aa  48.5  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4033  extracellular solute-binding protein  21.63 
 
 
429 aa  48.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0291  extracellular solute-binding protein  21.67 
 
 
449 aa  48.1  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1356  extracellular solute-binding protein  23.55 
 
 
418 aa  47.8  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0142784  normal  0.791743 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3779  extracellular solute-binding protein family 1  31.2 
 
 
430 aa  47.4  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.292836  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3304  extracellular solute-binding protein family 1  25.86 
 
 
431 aa  47.4  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3155  extracellular solute-binding protein family 1  28 
 
 
434 aa  47.4  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0626  extracellular solute-binding protein  22.86 
 
 
408 aa  47.4  0.0006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  8.92518e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1634  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  25.16 
 
 
416 aa  47  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1899  extracellular solute-binding protein, putative  25.16 
 
 
416 aa  47  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.41529  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1068  sugar ABC transporter periplasmic sugar-binding protein  34.85 
 
 
390 aa  47  0.0008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.238718 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0528  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  34.85 
 
 
414 aa  47  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1126  extracellular solute-binding protein family 1  23.7 
 
 
433 aa  46.2  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.162135  hitchhiker  0.000581091 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0913  extracellular solute-binding protein family 1  23.96 
 
 
421 aa  46.6  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5736  ABC transporter, substrate-binding protein  24.12 
 
 
410 aa  46.2  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.214535  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5137  extracellular solute-binding protein  24.86 
 
 
433 aa  46.6  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.319423  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0115  extracellular solute-binding protein family 1  28.57 
 
 
478 aa  46.2  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.132691  normal  0.193469 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2049  extracellular solute-binding protein  23.93 
 
 
435 aa  46.6  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0434  extracellular solute-binding protein  24.07 
 
 
452 aa  45.8  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.396307 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2477  periplasmic phosphate binding protein  26.04 
 
 
393 aa  45.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1174  extracellular solute-binding protein  23.92 
 
 
455 aa  45.8  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273661  normal  0.401546 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7939  ABC transporter (substrate-binding protein)  29.37 
 
 
428 aa  45.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.50295  normal  0.560439 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0434  extracellular solute-binding protein family 1  25.11 
 
 
444 aa  45.4  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.205913  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3264  extracellular solute-binding protein  25.97 
 
 
416 aa  45.8  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.591163 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5435  extracellular solute-binding protein  29.76 
 
 
414 aa  45.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.207139 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  24.22 
 
 
430 aa  44.7  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4051  extracellular solute-binding protein family 1  25.32 
 
 
434 aa  44.7  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3394  ABC-type sugar transport systems permease component  26.85 
 
 
411 aa  44.7  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.498756  normal  0.24931 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4241  extracellular solute-binding protein family 1  22.29 
 
 
422 aa  44.3  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>