45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2958 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_2958  phage prohead protease, HK97 family  100 
 
 
203 aa  415  9.999999999999999e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0672  HK97 family phage major capsid protein  34.18 
 
 
506 aa  92.4  3e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0952  HK97 family phage prohead protease  34.97 
 
 
186 aa  91.7  7e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1585  HK97 family phage prohead protease  34.83 
 
 
201 aa  90.9  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00257234  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1285  HK97 family phage prohead protease  37.14 
 
 
177 aa  90.5  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.140437  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3429  HK97 family phage prohead protease  35.56 
 
 
194 aa  85.1  6e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5838  hypothetical protein  35.71 
 
 
194 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3508  prophage LambdaBa01, prohead protease  35.67 
 
 
194 aa  82.4  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.677368  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3425  prohead protease  35.67 
 
 
194 aa  82.4  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3785  prophage lambdaba01, prohead protease  35.67 
 
 
194 aa  82.4  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4383  prohead protease  35.1 
 
 
239 aa  81.6  0.000000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0467  prophage lambdaba04, prohead protease  31.79 
 
 
196 aa  78.2  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0445  prophage LambdaBa04, prohead protease  31.79 
 
 
196 aa  78.2  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3313  phage major capsid protein, HK97 family  31.06 
 
 
562 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000533544 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2636  HK97 family phage prohead protease  30.37 
 
 
183 aa  73.9  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00090927  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0209  prophage Lp3 protein 18  28.15 
 
 
184 aa  72.8  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5151  HK97 family phage prohead protease  34.27 
 
 
169 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.369538  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2150  peptidase U35, phage prohead HK97  34.33 
 
 
233 aa  68.9  0.00000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2594  HK97 family phage prohead protease  29.32 
 
 
190 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4980  prophage LambdaBa03, prohead protease  32.1 
 
 
165 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5359  prophage LambdaBa03, prohead protease  32.1 
 
 
165 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1458  phage prohead protease, HK97 family  32.29 
 
 
197 aa  65.1  0.0000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0569  phage major capsid protein, HK97 family  30.6 
 
 
514 aa  64.7  0.0000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.361307  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1969  prohead protease protein  31.58 
 
 
198 aa  63.9  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.839969  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1679  phage prohead protease, HK97 family  32.19 
 
 
189 aa  58.2  0.00000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000321389  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08240  phage prohead protease, HK97 family  28.32 
 
 
190 aa  57.8  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00758613  hitchhiker  0.00429473 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2272  phage prohead protease, HK97 family  29.82 
 
 
220 aa  54.3  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1696  phage prohead protease, HK97 family  29.82 
 
 
220 aa  54.3  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2599  HK97 family phage prohead protease  27.78 
 
 
199 aa  53.1  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00442603 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2474  phage prohead protease, HK97 family  30.63 
 
 
172 aa  52.8  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00511228 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0032  HK97 family phage prohead protease  28.97 
 
 
177 aa  50.8  0.00001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.378426  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0012  prohead peptidase  29.2 
 
 
177 aa  49.3  0.00004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1428  phage prohead protease, HK97 family  26.97 
 
 
157 aa  48.5  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.84162  normal  0.230633 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1804  peptidase U35, phage prohead HK97  27.27 
 
 
220 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.409036  normal  0.116646 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1432  HK97 family phage prohead protease  26 
 
 
156 aa  47  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.392518 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0921  HK97 family phage prohead protease  25.76 
 
 
144 aa  45.8  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.340053 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1706  phage prohead protease, HK97 family  25.33 
 
 
156 aa  45.1  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.614169  normal  0.0428753 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1969  peptidase U35, phage prohead HK97  30.36 
 
 
235 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.150043  normal  0.71487 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1601  phage prohead protease, HK97 family  21.52 
 
 
240 aa  43.9  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3484  peptidase U35, phage prohead HK97  25.83 
 
 
240 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2095  phage prohead protease, HK97 family  28.83 
 
 
248 aa  42.4  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.407254  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0588  protease, putative  24.48 
 
 
222 aa  42  0.006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.688885  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5507  peptidase U35 phage prohead HK97  25.15 
 
 
196 aa  42  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0589  prohead protease  24.48 
 
 
222 aa  42  0.006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0462  prohead peptidase  23.97 
 
 
248 aa  41.6  0.008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.523107 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>