More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2940 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  100 
 
 
265 aa  528  1e-149  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  1.04581e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  61.83 
 
 
257 aa  167  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.11899e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  53.45 
 
 
391 aa  150  3e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  51.47 
 
 
476 aa  149  3e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3043  NLP/P60 protein  55.74 
 
 
274 aa  148  8e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.166608  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2739  NLP/P60 protein  41.99 
 
 
216 aa  148  9e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.232039  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3133  NLP/P60 protein  53.6 
 
 
454 aa  142  5e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  2.96935e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3121  NLP/P60 protein  54.7 
 
 
333 aa  140  2e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  44.51 
 
 
232 aa  140  2e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3286  NLP/P60 protein  49.61 
 
 
450 aa  140  2e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1908  NLP/P60 protein  48.98 
 
 
298 aa  140  3e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0480  NLP/P60 protein  40.25 
 
 
285 aa  137  1e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0218691  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3368  NLP/P60 protein  51.3 
 
 
246 aa  138  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.776928  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0173  NlpC/P60 family protein  50.4 
 
 
458 aa  137  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  3.88548e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  47.79 
 
 
217 aa  136  3e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0878  NLP/P60 protein  50.88 
 
 
246 aa  135  5e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00112829 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2964  NLP/P60 protein  54.92 
 
 
208 aa  133  3e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0396  NLP/P60 protein  51.52 
 
 
150 aa  133  3e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2639  NLP/P60 protein  35.15 
 
 
349 aa  133  3e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1279  NLP/P60 protein  51.15 
 
 
150 aa  132  5e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3648  NLP/P60 protein  53.78 
 
 
391 aa  131  1e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0605  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  48.23 
 
 
370 aa  130  3e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000243263  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0433  NLP/P60 protein  50 
 
 
245 aa  130  3e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.895953  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2736  NLP/P60 protein  43.66 
 
 
307 aa  129  6e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1003  NLP/P60 protein  34.39 
 
 
269 aa  128  9e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  1.66415e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1787  NLP/P60 protein  36.07 
 
 
278 aa  128  1e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  1.49372e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0896  NLP/P60 protein  50.46 
 
 
342 aa  128  1e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  1.3444e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  51.69 
 
 
424 aa  127  2e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  3.25506e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3365  NLP/P60 protein  50.46 
 
 
342 aa  127  2e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1169  NLP/P60:peptidoglycan-binding LysM  49.56 
 
 
341 aa  127  2e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  1.54936e-13  normal  0.0379935 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0869  LysM domain/NLP/P60 family protein  50.44 
 
 
342 aa  127  2e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2789  NLP/P60 family protein  51.16 
 
 
181 aa  126  4e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.142626  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5367  NLP/P60 family protein  38.02 
 
 
224 aa  126  5e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174254  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1247  putative cell-wall associated endopeptidase  48.31 
 
 
257 aa  125  6e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0230  NLP/P60 protein  45.38 
 
 
188 aa  125  6e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.382299 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3257  NLP/P60 protein  33.7 
 
 
269 aa  125  7e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3056  NLP/P60 protein  36.27 
 
 
347 aa  125  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  6.88808e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1960  NLP/P60 protein  37.5 
 
 
223 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0530532  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2321  NLP/P60 protein  47.41 
 
 
266 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6019  NLP/P60  37.5 
 
 
223 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377627  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1368  NLP/P60 protein  48.62 
 
 
346 aa  124  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00025517  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2090  NLP/P60 protein  37.5 
 
 
223 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226051  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1218  NLP/P60 protein  37.5 
 
 
224 aa  123  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00850028  normal  0.283839 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2058  NLP/P60 protein  37.5 
 
 
223 aa  123  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  5.24971e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2077  NLP/P60 protein  36.98 
 
 
223 aa  122  6e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010952  normal  0.957052 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4200  NLP/P60 protein  47.33 
 
 
156 aa  122  7e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2128  NLP/P60 protein  42.36 
 
 
235 aa  122  7e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00187925  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2277  NLP/P60 family lipoprotein  33.76 
 
 
267 aa  121  1e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0791  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)-like  39.88 
 
 
221 aa  120  2e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1344  NLP/P60 protein  37.89 
 
 
207 aa  120  2e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2520  NLP/P60 family protein  48.72 
 
 
365 aa  119  4e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.509627  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2149  NLP/P60 protein  48.72 
 
 
365 aa  119  4e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  5.21128e-05  hitchhiker  0.000892281 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3902  NLP/P60 protein  47.86 
 
 
171 aa  119  6e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5353  enterotoxin  51.72 
 
 
582 aa  119  6e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  3.81193e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2365  NLP/P60:sporulation-related protein  36.08 
 
 
266 aa  119  7e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5324  enterotoxin  51.3 
 
 
598 aa  117  1e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.21636e-60 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2585  NLP/P60 protein  46.4 
 
 
183 aa  117  1e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.364054  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2497  NLP/P60 protein  39.18 
 
 
221 aa  118  1e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  1.64638e-06  normal  0.0130851 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2041  NLP/P60 protein  38.35 
 
 
284 aa  118  1e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000350881  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1554  NLP/P60  45.6 
 
 
208 aa  117  2e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.68889  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5406  putative cell wall hydrolase  51.79 
 
 
582 aa  117  2e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  5.66692e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1640  NLP/P60 family protein  40.38 
 
 
221 aa  117  2e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000364437  normal  0.336888 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1652  NLP/P60 protein  50 
 
 
178 aa  117  2e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.111398  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1982  NLP/P60 family protein  47.97 
 
 
234 aa  117  2e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000770897  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2830  NLP/P60 protein  47.06 
 
 
220 aa  116  4e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.704353  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2671  NLP/P60 protein  31.6 
 
 
283 aa  116  4e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.179494  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1892  NLP/P60 protein  42.67 
 
 
319 aa  116  4e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2074  NLP/P60 protein  38.85 
 
 
295 aa  115  5e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.591046  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4915  cell wall hydrolase; N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  51.79 
 
 
580 aa  115  5e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  9.30619e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2387  NLP/P60 protein  31.47 
 
 
283 aa  116  5e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.05451  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4930  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase; enterotoxin  51.79 
 
 
579 aa  115  5e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  2.72032e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1293  NLP/P60  36.63 
 
 
205 aa  116  5e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0496746  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2543  NlpC/P60 domain-containing protein  47.54 
 
 
218 aa  115  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.241327  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2105  NLP/P60 family protein  47.54 
 
 
218 aa  115  6e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  5.76333e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3208  NLP/P60 family protein  47.54 
 
 
218 aa  115  6e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00320254  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2489  NlpC/P60 domain-containing protein  47.54 
 
 
234 aa  115  6e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00285101  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1378  NLP/P60 family protein  47.54 
 
 
218 aa  115  6e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0650104  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1602  NLP/P60 family protein  47.54 
 
 
234 aa  115  6e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  6.24175e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33170  NLP/P60 family lipoprotein  44.6 
 
 
173 aa  115  6e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0857869  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2630  NLP/P60 family protein  47.54 
 
 
234 aa  115  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  2.2944e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1379  NLP/P60 protein  45.53 
 
 
223 aa  115  6e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0123318  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  41.78 
 
 
255 aa  115  9e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2097  NLP/P60 protein  41.46 
 
 
341 aa  115  1e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  33.92 
 
 
333 aa  114  1e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1388  NLP/P60  45.45 
 
 
303 aa  114  2e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297937  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1250  NLP/P60 protein  44.35 
 
 
248 aa  114  2e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.000552171  normal  0.790948 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5084  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, C-terminus  51.79 
 
 
341 aa  114  2e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.143081  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1132  NLP/P60 protein  42.31 
 
 
556 aa  114  2e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  1.55845e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1787  NLP/P60 protein  40 
 
 
202 aa  113  3e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0258261 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2476  NLP/P60 protein  35.62 
 
 
214 aa  113  4e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.188506  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1664  NLP/P60 protein  44.72 
 
 
192 aa  112  4e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2091  NLP/P60 protein  44.72 
 
 
192 aa  112  5e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.315099  normal  0.543667 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1956  NLP/P60 protein  39.71 
 
 
296 aa  112  5e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0783  putative outer membrane lipoprotein  44.54 
 
 
188 aa  112  6e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02064  hypothetical protein  44.54 
 
 
188 aa  112  6e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2324  putative outer membrane lipoprotein  44.54 
 
 
188 aa  112  6e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00669952 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1472  putative outer membrane lipoprotein  44.54 
 
 
188 aa  112  6e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000135569  normal  0.0170642 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1482  NLP/P60 protein  44.54 
 
 
188 aa  112  6e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.736883  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3731  NLP/P60 protein  49.57 
 
 
409 aa  112  6e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  1.96287e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2313  putative outer membrane lipoprotein  44.54 
 
 
188 aa  112  6e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.871525  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>