More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2901 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_2901  cold-shock DNA-binding domain protein  100 
 
 
66 aa  134  3e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  5.81473e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1853  cold-shock DNA-binding protein family protein  86.36 
 
 
66 aa  119  2e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  5.50442e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1817  cold-shock DNA-binding domain protein  72.73 
 
 
66 aa  106  9e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  2.542e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5298  cold shock protein CspC  80.33 
 
 
67 aa  105  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5356  cold shock protein CspC  80.33 
 
 
67 aa  105  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4985  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  78.69 
 
 
67 aa  104  4e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4885  cold shock protein  78.69 
 
 
67 aa  104  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4870  cold shock protein  78.69 
 
 
67 aa  104  4e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5647  cold shock protein CspC  78.69 
 
 
65 aa  104  4e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.35799e-06 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5040  cold shock protein CspC  78.69 
 
 
67 aa  104  4e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5310  cold shock protein CspC  78.69 
 
 
65 aa  104  4e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.156889  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5424  cold shock protein CspC  78.69 
 
 
65 aa  104  4e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491326  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5280  cold shock protein CspC  78.69 
 
 
67 aa  104  4e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.84465e-07 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1369  hypothetical protein  71.21 
 
 
66 aa  102  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.309276 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3598  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  69.7 
 
 
66 aa  103  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.851035  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4614  cold shock protein  72.31 
 
 
66 aa  101  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  1.69422e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4990  cold shock protein CspD  72.31 
 
 
66 aa  101  4e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00510931  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4592  cold shock protein  72.31 
 
 
66 aa  101  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.32551e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4972  cold shock protein CspD  72.31 
 
 
66 aa  101  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5001  cold shock protein CspD  72.31 
 
 
66 aa  101  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.219986  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5115  cold shock protein CspD  72.31 
 
 
66 aa  101  4e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00303936  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5019  cold shock protein CspD  72.31 
 
 
66 aa  101  4e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0351296  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4754  cold shock protein CspD  72.31 
 
 
66 aa  101  4e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  1.81e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3497  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  70.77 
 
 
66 aa  100  6e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  6.16798e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3728  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  75.41 
 
 
65 aa  100  6e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.484525  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0248  cold shock protein CspD  72.31 
 
 
66 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  5.99312e-06  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3973  cold-shock DNA-binding domain protein  74.19 
 
 
65 aa  99  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  3.42931e-10  unclonable  6.81945e-11 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1463  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  76.19 
 
 
66 aa  99  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.302037  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0555  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  69.23 
 
 
66 aa  99  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  7.05321e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1492  cold-shock protein DNA-binding  76.19 
 
 
66 aa  99  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  1.92979e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4701  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  70.77 
 
 
66 aa  98.6  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000295831  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0644  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  70.77 
 
 
66 aa  98.6  3e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  2.53244e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0972  CSD family cold shock protein  74.6 
 
 
77 aa  97.4  5e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0833  cold-shock protein DNA-binding  74.6 
 
 
66 aa  97.4  6e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  4.57197e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0782  cold-shock DNA-binding domain protein  69.7 
 
 
66 aa  97.4  6e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.733249  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0817  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  74.6 
 
 
66 aa  97.4  6e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  1.23312e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2963  cold-shock DNA-binding domain protein  73.02 
 
 
65 aa  97.1  7e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3245  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  77.05 
 
 
65 aa  97.1  7e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.370321  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1517  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  71.43 
 
 
65 aa  97.1  7e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0466  CSD family cold shock protein  74.6 
 
 
66 aa  97.1  8e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.281351  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3080  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  72.58 
 
 
65 aa  96.7  9e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  3.56634e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1666  cold shock protein CspB  73.77 
 
 
65 aa  95.9  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3679  cold shock protein CspB  73.77 
 
 
65 aa  95.9  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.844549  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2223  cold-shock DNA-binding protein family  68.85 
 
 
65 aa  96.3  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  3.39527e-13  decreased coverage  1.60158e-22 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3242  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  69.23 
 
 
66 aa  96.7  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  1.34861e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3594  cold shock protein CspB  67.69 
 
 
66 aa  95.5  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  6.32893e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0226  cold-shock DNA-binding protein family protein  68.75 
 
 
65 aa  95.9  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  1.7804e-12  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3548  cold shock protein CspB  67.69 
 
 
66 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.86244e-45 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3297  cold shock protein  67.69 
 
 
66 aa  95.5  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.03106e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3553  cold shock protein CspB  67.69 
 
 
66 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  9.60966e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3557  cold shock protein CspB  67.69 
 
 
66 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  6.16269e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3647  cold shock protein CspB  67.69 
 
 
66 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  7.02498e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2221  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  71.43 
 
 
66 aa  95.5  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  3.48612e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3333  cold shock protein CspB  67.69 
 
 
66 aa  95.5  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  7.36097e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2146  cold-shock DNA-binding domain protein  68.25 
 
 
66 aa  95.9  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3248  cold shock protein  67.69 
 
 
66 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  2.22014e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1670  cold shock protein CspB  67.69 
 
 
66 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  1.43673e-10  decreased coverage  2.448e-23 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1376  cold-shock DNA-binding protein family protein  65.15 
 
 
67 aa  95.1  3e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.128629  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1264  cold-shock DNA-binding domain protein  68.25 
 
 
66 aa  95.1  3e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  1.76373e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2064  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  67.69 
 
 
67 aa  95.1  3e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  4.24325e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3185  cold-shock DNA-binding domain protein  70.77 
 
 
66 aa  94.7  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  9.97397e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1327  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  72.13 
 
 
65 aa  94.7  4e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00843058  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0036  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  71.43 
 
 
66 aa  94.4  4e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0174  cold-shock DNA-binding protein family protein  66.15 
 
 
65 aa  94.7  4e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  2.15085e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1077  cold-shock DNA-binding domain protein  70.77 
 
 
66 aa  94.7  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.27833e-32 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1629  cold shock protein CspB  72.13 
 
 
65 aa  94.4  5e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2727  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68.75 
 
 
66 aa  94.4  5e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1905  cold shock domain-contain protein  69.7 
 
 
66 aa  94.4  5e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  9.74395e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4019  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  70.77 
 
 
66 aa  94.4  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  2.0604e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2784  cold-shock protein DNA-binding  68.75 
 
 
66 aa  94.4  5e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1512  cold shock protein CspB  72.13 
 
 
65 aa  94.4  5e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0532666  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1484  cold shock protein  72.13 
 
 
65 aa  94.4  5e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00463121  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2422  cold shock protein CspA  70.97 
 
 
67 aa  94  6e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  2.71714e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2454  cold shock protein CspA  70.97 
 
 
67 aa  94  6e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  2.0427e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2440  cold shock protein CspA  70.97 
 
 
67 aa  94  6e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.11145 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2521  cold shock protein CspA  70.97 
 
 
67 aa  94  6e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  1.75758e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2216  cold shock protein  70.97 
 
 
67 aa  94  6e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  9.62754e-25  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2177  cold shock protein  70.97 
 
 
67 aa  94  6e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  1.47175e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2257  cold shock protein CspA  70.97 
 
 
67 aa  94  6e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  6.81816e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1771  cold shock protein CspB  72.13 
 
 
65 aa  93.6  8e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.674817  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1474  cold shock protein  72.13 
 
 
65 aa  93.6  8e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259968  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0220  cold-shock DNA-binding domain protein  67.16 
 
 
67 aa  93.6  8e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3670  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.67 
 
 
66 aa  93.6  8e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  2.54143e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1720  cold shock protein CspB  72.13 
 
 
65 aa  93.6  8e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.146917  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6113  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.62 
 
 
66 aa  93.2  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0958  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.67 
 
 
68 aa  92.8  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  1.77063e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1266  cold-shock DNA-binding protein family protein  68.18 
 
 
66 aa  93.2  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  2.7573e-18  decreased coverage  1.00442e-12 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2806  cold shock proteins  69.23 
 
 
85 aa  92.8  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  5.72104e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05400  putative cold-shock DNA-binding domain protein  68.33 
 
 
67 aa  92.4  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  4.33246e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0645  cold-shock DNA-binding domain protein  69.23 
 
 
66 aa  92.4  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  1.55303e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2739  cold-shock DNA-binding domain protein  67.69 
 
 
68 aa  92  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  8.0188e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0581  cold-shock domain-contain protein  68.18 
 
 
66 aa  92  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0658  cold-shock DNA-binding domain protein  69.23 
 
 
66 aa  92  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.18008e-25 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16470  putative cold-shock DNA-binding domain protein  70 
 
 
67 aa  92  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.46303e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1697  cold shock protein CspB  70.49 
 
 
65 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2944  cold shock protein CspA  70.97 
 
 
67 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  1.90383e-09  hitchhiker  3.28218e-09 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1777  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  70.97 
 
 
67 aa  91.7  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  5.55984e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1502  cold-shock DNA-binding domain protein  67.69 
 
 
68 aa  91.7  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.683183 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2387  cold shock protein CspA  70.97 
 
 
67 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000343372  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0982  cold-shock DNA-binding domain protein  69.35 
 
 
83 aa  91.7  3e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  7.34957e-10  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>