More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2867 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_2867  DNA-cytosine methyltransferase  100 
 
 
416 aa  859  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  9.39229e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0145  hypothetical protein  42.71 
 
 
417 aa  264  2e-69  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1078  hypothetical protein  46.06 
 
 
320 aa  255  8e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00371  site-specific DNA methylase  44.44 
 
 
305 aa  253  4e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1565  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  48.01 
 
 
328 aa  253  6e-66  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2371  DNA-cytosine methyltransferase  42.77 
 
 
419 aa  247  3e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0692329  hitchhiker  2.23127e-07 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0356  site-specific DNA methylase  46.79 
 
 
323 aa  242  7e-63  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0298  DNA-cytosine methyltransferase  37.62 
 
 
415 aa  241  2e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4919  DNA-cytosine methyltransferase  44.21 
 
 
416 aa  237  2e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00440588 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1143  DNA-cytosine methyltransferase  42.06 
 
 
426 aa  236  6e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0060  DNA-cytosine methyltransferase  41.05 
 
 
329 aa  235  1e-60  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2140  DNA-cytosine methyltransferase  40 
 
 
428 aa  233  5e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000767539 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2549  DNA-cytosine methyltransferase  39.05 
 
 
338 aa  232  8e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.149278  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf138  cytosine-specific methyltransferase, related to HhaI  42.77 
 
 
327 aa  231  1e-59  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  decreased coverage  0.000711386  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0083  DNA-cytosine methyltransferase  41.67 
 
 
425 aa  229  5e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.817279  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0414  DNA-cytosine methyltransferase  42.49 
 
 
436 aa  229  6e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.596456  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1968  DNA-cytosine methyltransferase  40.57 
 
 
324 aa  227  3e-58  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0573  DNA cytosine methylase  42.04 
 
 
491 aa  226  7e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3354  C-5 cytosine-specific DNA methylase  41.79 
 
 
418 aa  224  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4374  DNA-cytosine methyltransferase  42.51 
 
 
417 aa  223  6e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.423632  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4747  DNA cytosine methylase  40.16 
 
 
474 aa  223  7e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.209155  normal  0.300797 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2460  DNA-cytosine methyltransferase  39.07 
 
 
424 aa  219  1e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  2.66884e-09  hitchhiker  1.86187e-12 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3057  DNA-cytosine methyltransferase  41.43 
 
 
406 aa  216  4e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3387  DNA-cytosine methyltransferase  41.03 
 
 
417 aa  216  8e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.28418  normal 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3583  DNA-cytosine methyltransferase  41.85 
 
 
487 aa  211  2e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2360  DNA-cytosine methyltransferase  37.39 
 
 
336 aa  202  8e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00768264  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2551  DNA cytosine methylase  38.93 
 
 
471 aa  202  1e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.491902 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1127  DNA cytosine methylase  40.11 
 
 
476 aa  201  1e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00778828  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2208  DNA cytosine methylase  40.06 
 
 
476 aa  201  2e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.736012 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1249  DNA cytosine methylase  40.06 
 
 
476 aa  201  2e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.608462  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2155  DNA cytosine methylase  40.06 
 
 
476 aa  201  2e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0409475 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2151  DNA cytosine methylase  40.06 
 
 
476 aa  201  2e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.366802 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2695  DNA-cytosine methyltransferase  40.39 
 
 
320 aa  200  4e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4748  DNA cytosine methylase  39.45 
 
 
447 aa  199  1e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2193  DNA cytosine methylase  39.49 
 
 
472 aa  198  2e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000335113  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0923  DNA cytosine methylase  39.49 
 
 
472 aa  197  3e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.579059  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2738  DNA cytosine methylase  39.49 
 
 
472 aa  197  3e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.285306  normal  0.358012 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1224  DNA cytosine methylase  39.49 
 
 
472 aa  197  3e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.27257  normal  0.639542 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2793  DNA-cytosine methyltransferase  37.39 
 
 
727 aa  197  3e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1688  DNA-cytosine methyltransferase  39.49 
 
 
472 aa  197  3e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.105701  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1682  DNA cytosine methylase  39.49 
 
 
472 aa  197  4e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0382129 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2063  DNA cytosine methylase  38.92 
 
 
472 aa  197  4e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00482699  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3202  DNA-cytosine methyltransferase  36.98 
 
 
417 aa  191  3e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  3.17903e-08  unclonable  2.51181e-11 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1245  DNA-cytosine methyltransferase  57.54 
 
 
438 aa  191  3e-47  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1526  DNA-cytosine methyltransferase  37.94 
 
 
311 aa  188  1e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.5111e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1839  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase., Type II site-specific deoxyribonuclease  37.58 
 
 
657 aa  189  1e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.520497  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3307  DNA-cytosine methyltransferase  36.47 
 
 
331 aa  187  4e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0822  DNA-cytosine methyltransferase  36.65 
 
 
318 aa  185  1e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.091848  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0841  modification methylase HpaII (cytosine-specific methyltransferase HpaII)  35.39 
 
 
373 aa  171  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  4.59966e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47357  predicted protein  35.02 
 
 
495 aa  162  9e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.22131  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0587  DNA-cytosine methyltransferase  36.63 
 
 
319 aa  161  2e-38  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.00791678  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1297  C-5 cytosine-specific DNA methylase  40.89 
 
 
451 aa  156  8e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000219997  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1008  cytosine-specific methyltransferase NlaX  31.74 
 
 
350 aa  155  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0816  DNA-cytosine methyltransferase  31.09 
 
 
350 aa  154  4e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1962  DNA-cytosine methyltransferase  40.41 
 
 
467 aa  152  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0166825 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0160  DNA-cytosine methyltransferase  32.42 
 
 
328 aa  151  2e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4652  DNA-cytosine methyltransferase  45.4 
 
 
413 aa  150  5e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.030739 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  33.84 
 
 
423 aa  150  6e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2320  DNA-cytosine methyltransferase  31.79 
 
 
334 aa  149  1e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0652  DNA-cytosine methyltransferase  32.71 
 
 
329 aa  149  1e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  1.9493e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3450  DNA-cytosine methyltransferase  41.74 
 
 
460 aa  147  4e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2666  DNA-cytosine methyltransferase  41.74 
 
 
460 aa  147  4e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.566614  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1633  DNA-cytosine methyltransferase  30.41 
 
 
368 aa  145  1e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00134402  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0084  DNA-cytosine methyltransferase  33.44 
 
 
423 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2257  DNA-cytosine methyltransferase  31.23 
 
 
323 aa  143  7e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120501 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  30 
 
 
313 aa  142  8e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1869  prophage LambdaSa2, type II DNA modification methyltransferase, putative  39.62 
 
 
437 aa  142  8e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000208673  n/a   
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5352  DNA-cytosine methyltransferase  36.14 
 
 
444 aa  140  6e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20440  DNA-methyltransferase Dcm  31.13 
 
 
315 aa  139  7e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.359782  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4296  DNA-cytosine methyltransferase  44.26 
 
 
456 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4356  DNA-cytosine methyltransferase  44.26 
 
 
456 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.593221  normal  0.193587 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001833  DNA-cytosine methyltransferase  29.39 
 
 
427 aa  138  2e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0272  DNA-cytosine methyltransferase  30.34 
 
 
308 aa  137  4e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1823  DNA-cytosine methyltransferase  31.56 
 
 
321 aa  137  5e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1728  DNA-cytosine methyltransferase  41.57 
 
 
483 aa  135  1e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.770689  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0731  site-specific DNA methylase  41.08 
 
 
406 aa  135  2e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00265008  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1093  DNA-cytosine methyltransferase  28.8 
 
 
386 aa  132  1e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1616  C-5 cytosine-specific DNA methylase family protein  30.09 
 
 
345 aa  132  2e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  28.48 
 
 
313 aa  129  6e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1855  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  37 
 
 
435 aa  128  2e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.918584  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1722  DNA-cytosine methyltransferase  28.99 
 
 
335 aa  127  3e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  2.69653e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0932  DNA-cytosine methyltransferase  31.14 
 
 
350 aa  126  6e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  1.50039e-09 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0271  DNA-cytosine methyltransferase  29.06 
 
 
310 aa  125  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0079  DNA-cytosine methyltransferase  38.32 
 
 
335 aa  124  3e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1972  DNA-cytosine methyltransferase  29.28 
 
 
490 aa  123  5e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0825702  normal  0.570166 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1510  DNA-cytosine methyltransferase  30 
 
 
414 aa  120  4e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1155  DNA-cytosine methyltransferase  30.03 
 
 
317 aa  118  2e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0058  phage-related DNA methylase, N-terminal region  38.86 
 
 
239 aa  115  1e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4810  DNA-cytosine methyltransferase  30.09 
 
 
379 aa  115  1e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0047  cytosine-specific methyltransferase NlaX (M.NlaX)  27.81 
 
 
352 aa  115  2e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00306927  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3855  DNA-cytosine methyltransferase  27.55 
 
 
313 aa  115  2e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  3.45727e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4337  cytosine-specific methyltransferase NlaX  28.91 
 
 
348 aa  114  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0259442  hitchhiker  1.1708e-08 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2535  DNA-cytosine methyltransferase  27.64 
 
 
400 aa  109  9e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6992  DNA-cytosine methyltransferase  26.78 
 
 
454 aa  109  9e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0535  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  26 
 
 
357 aa  107  3e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.73164e-05 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4525  DNA-cytosine methyltransferase  30.65 
 
 
337 aa  107  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.301699 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3950  DNA-cytosine methyltransferase  32 
 
 
508 aa  107  5e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1050  DNA-cytosine methyltransferase  35.4 
 
 
361 aa  104  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00805794  n/a   
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4233  DNA-cytosine methyltransferase  35.2 
 
 
283 aa  103  4e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0101  C-5 cytosine-specific DNA methylase  33.33 
 
 
431 aa  103  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999272  normal  0.127001 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>