31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2852 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_0382  phage antirepressor protein, putative  100 
 
 
250 aa  526  1e-148  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  7.07014e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2852  AntA/AntB antirepressor domain protein  100 
 
 
250 aa  526  1e-148  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  2.03262e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0555  prophage LambdaSa1, antirepressor, putative  42.75 
 
 
249 aa  213  3e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1235  prophage antirepressor  68.61 
 
 
263 aa  200  2e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  2.98657e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0321  phage antirepressor protein  38.1 
 
 
250 aa  134  1e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0409481  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0312  phage antirepressor protein  38.1 
 
 
250 aa  134  1e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000635944  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1649  BRO-like protein  51.11 
 
 
265 aa  131  1e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  5.43299e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1680  phage-encoded protein  36.96 
 
 
239 aa  130  2e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0647  phage-encoded protein  32.55 
 
 
266 aa  108  8e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  4.7659e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0585  hypothetical protein  32.55 
 
 
266 aa  108  8e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  3.74128e-07  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0879  phage antirepressor protein  29.92 
 
 
257 aa  103  2e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00137369  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2087  phage antirepressor protein  31.22 
 
 
249 aa  96.7  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000258428  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2050  phage antirepressor protein  31.22 
 
 
249 aa  96.7  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.016924  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37230  Phage anti-repressor protein AntB-like protein  53.75 
 
 
182 aa  91.7  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.331791  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0871  BRO domain-containing protein  40.57 
 
 
255 aa  84  2e-15  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0855  prophage antirepressor  40.57 
 
 
255 aa  84  2e-15  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0851  AntA/AntB antirepressor domain protein  36.22 
 
 
230 aa  83.6  3e-15  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  6.20101e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4350  AntA/AntB antirepressor domain-containing protein  44.83 
 
 
291 aa  76.6  3e-13  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1070  AntA/AntB family antirepressor  42.31 
 
 
247 aa  76.6  3e-13  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0548  phage anti-repressor protein, putative  34.9 
 
 
205 aa  70.1  3e-11  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.19591  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0307  putative phage anti-repressor protein  32.52 
 
 
226 aa  68.6  1e-10  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  unclonable  1.07558e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1326  hypothetical protein  35.51 
 
 
230 aa  66.2  4e-10  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.18998  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3574  phage anti-repressor protein AntB  39.56 
 
 
217 aa  66.2  5e-10  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  1.90834e-15 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0049  hypothetical protein  38.04 
 
 
383 aa  63.5  3e-09  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0617  AntA/AntB antirepressor domain-containing protein  38.04 
 
 
267 aa  61.6  1e-08  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1743  AntA/AntB antirepressor domain protein  30.69 
 
 
115 aa  61.2  2e-08  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1623  Phage anti-repressor protein-like  36.96 
 
 
247 aa  60.1  3e-08  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0455176  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2462  BRO-like protein  31.2 
 
 
248 aa  58.5  9e-08  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  4.68179e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4001  AntA/AntB antirepressor domain protein  34.17 
 
 
280 aa  55.5  9e-07  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3884  AntA/AntB antirepressor domain-containing protein  32.58 
 
 
269 aa  52  9e-06  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1804  prophage antirepressor  25.62 
 
 
244 aa  44.3  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>