132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2834 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_2834  phage major capsid protein, HK97 family  100 
 
 
397 aa  803  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.174812  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1628  HK97 family phage major capsid protein  79.95 
 
 
400 aa  660  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0400  HK97 family phage major capsid protein  98.49 
 
 
397 aa  794  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1254  HK97 family phage major capsid protein  74.19 
 
 
399 aa  615  1e-175  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1085  HK97 family major capsid protein  57.39 
 
 
405 aa  490  1e-137  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1485  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  59.19 
 
 
392 aa  466  1e-130  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0852  major capsid protein, HK97 family  36.57 
 
 
386 aa  220  3e-56  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0590991  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1466  HK97 family phage major capsid protein  36.22 
 
 
312 aa  212  1e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000392324  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1458  HK97 family major capsid protein  36.36 
 
 
388 aa  210  4e-53  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.90039  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0861  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  35.58 
 
 
403 aa  191  2e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.456659  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1022  phage major capsid protein, HK97 family  33.17 
 
 
411 aa  190  3e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1895  HK97 family phage major capsid protein  35.6 
 
 
389 aa  185  1e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2025  phage major capsid protein, HK97  34.26 
 
 
382 aa  184  2e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.848367  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0337  phage major capsid protein, HK97  34.26 
 
 
382 aa  184  2e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.139658  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0875  phage capsid family protein  32.61 
 
 
315 aa  184  3e-45  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7329  phage major capsid protein, HK97 family  32.29 
 
 
417 aa  181  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0906  HK97 family phage major capsid protein  33.86 
 
 
435 aa  181  3e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.225289  normal  0.497938 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1719  phage major capsid protein, HK97  33.33 
 
 
384 aa  181  3e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3980  phage major capsid protein, HK97 family  35.45 
 
 
382 aa  172  7e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0867  HK97 family phage major capsid protein  29.95 
 
 
407 aa  171  2e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.887226  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3970  HK97 family phage major capsid protein  30.62 
 
 
413 aa  171  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.33538 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2358  phage phi-C31 gp36-like protein /HK97 family major capsid protein  33.76 
 
 
420 aa  167  3e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.172606  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1427  phage major capsid protein, HK97 family  32.63 
 
 
421 aa  167  3e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.370183 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1359  HK97 family phage major capsid protein  34.13 
 
 
385 aa  166  6e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.504084  normal  0.308637 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1047  HK97 family phage major capsid protein  32.31 
 
 
441 aa  164  3e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.144894  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2266  phage major capsid protein, HK97 family  32.23 
 
 
401 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  7.39522e-11 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3867  HK97 family phage major capsid protein  29.21 
 
 
425 aa  161  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00292858 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2263  phage major capsid protein, HK97 family  32.5 
 
 
401 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0574985 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0277  HK97 family phage major capsid protein  31.63 
 
 
385 aa  161  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1705  phage major capsid protein, HK97 family  31.67 
 
 
421 aa  161  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.154021  normal  0.125329 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6186  phage major capsid protein HK97 family  34.67 
 
 
471 aa  159  9e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.423125  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1970  phage major capsid protein, HK97  33.54 
 
 
431 aa  158  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.141118  normal  0.540615 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1190  HK97 family phage major capsid protein  32.09 
 
 
401 aa  157  4e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  1.2399e-07 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5467  hypothetical protein  33.44 
 
 
386 aa  157  4e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0951  HK97 family phage major capsid protein  30.36 
 
 
389 aa  156  8e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2096  phage major capsid protein, HK97 family  31.33 
 
 
418 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.225363  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1415  phage major capsid protein, HK97  31.55 
 
 
417 aa  155  1e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3155  HK97 family phage major capsid protein  31.56 
 
 
428 aa  155  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0231727  normal  0.0147808 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1431  HK97 family phage major capsid protein  31.42 
 
 
421 aa  152  7e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.263231 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0922  HK97 family phage major capsid protein  30.52 
 
 
403 aa  152  9e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.255185 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1167  Phage major capsid protein, HK97  32.92 
 
 
417 aa  151  2e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3481  Phage major capsid protein, HK97  32.15 
 
 
417 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.137838  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4965  HK97 family phage major capsid protein  32.1 
 
 
430 aa  149  6e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  1.54569e-05 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1805  phage major capsid protein, HK97  33.03 
 
 
416 aa  149  7e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.539863  normal  0.129536 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2500  phage major capsid protein, HK97 family  34.58 
 
 
416 aa  148  1e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00454127  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1625  Phage major capsid protein, HK97  33.85 
 
 
385 aa  148  2e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.490763  normal  0.450118 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1482  Phage major capsid protein, HK97  33.85 
 
 
385 aa  148  2e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.353157 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1334  HK97 family phage major capsid protein  31.85 
 
 
424 aa  147  3e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.280266  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1970  major capsid-like protein  31.05 
 
 
425 aa  145  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.244233  n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4253  phage major capsid protein, HK97 family  29.45 
 
 
440 aa  145  1e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1542  Phage major capsid protein, HK97  35.36 
 
 
419 aa  144  4e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1655  phage major capsid protein, HK97 family  28.35 
 
 
406 aa  144  4e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3709  HK97 family phage major capsid protein  29.9 
 
 
450 aa  143  4e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2174  putative phage major capsid protein  29.32 
 
 
405 aa  143  5e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2898  HK97 family phage major capsid protein  31.25 
 
 
388 aa  142  8e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.593833  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3913  HK97 family phage major capsid protein  31.19 
 
 
408 aa  142  9e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.511324  normal  0.0176262 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1061  phage major capsid protein, HK97  30.03 
 
 
398 aa  142  1e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0887541 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3122  phage major capsid protein, HK97  30.7 
 
 
380 aa  142  1e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1684  phage phi-C31 GP36-like protein  29.59 
 
 
412 aa  141  2e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.885456 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1999  phage major capsid protein, HK97  31.33 
 
 
380 aa  140  3e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00431544 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1635  phage major capsid protein, HK97  29.97 
 
 
393 aa  139  9e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.304591  normal  0.904057 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1338  phage major capsid protein HK97 family  29.6 
 
 
420 aa  136  6e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0373474  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2598  HK97 family phage major capsid protein  29.93 
 
 
409 aa  134  3e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00517058 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2489  phage major capsid protein, HK97  32.75 
 
 
390 aa  132  1e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1078  HK97 family phage major capsid protein  30.03 
 
 
387 aa  130  4e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.506947 
 
 
-
 
NC_002978  WD0458  HK97 family phage major capsid protein  29.25 
 
 
399 aa  129  8e-29  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.830326  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0644  HK97 family phage major capsid protein  30.36 
 
 
379 aa  129  1e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.146587 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1695  phage major capsid protein, HK97 family  26.71 
 
 
427 aa  128  2e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2271  phage major capsid protein, HK97 family  26.71 
 
 
427 aa  128  2e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1311  phage major capsid protein, HK97 family  26.71 
 
 
427 aa  128  2e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0795  HK97 family phage major capsid protein  30.03 
 
 
379 aa  128  2e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2471  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  31.17 
 
 
398 aa  127  3e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1133  HK97 family phage major capsid protein  31.17 
 
 
387 aa  127  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0466  HK97 family phage major capsid protein  28.92 
 
 
369 aa  127  4e-28  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0589  HK97 family major capsid protein  29.63 
 
 
424 aa  127  5e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1086  HK97 family phage major capsid protein  31.97 
 
 
400 aa  123  6e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0830  HK97 family phage major capsid protein  24.63 
 
 
383 aa  122  8e-27  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1998  phage major capsid protein, HK97 family  26.01 
 
 
438 aa  115  2e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0256  HK97 family phage major capsid protein  26.03 
 
 
382 aa  114  2e-24  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0170854  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4981  HK97 family phage major capsid protein  30.04 
 
 
359 aa  107  5e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5360  HK97 family phage major capsid protein  30.04 
 
 
346 aa  107  5e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2179  phage major capsid protein, HK97 family  30.6 
 
 
373 aa  104  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3313  phage major capsid protein, HK97 family  27.78 
 
 
562 aa  96.3  8e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  5.33544e-10 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2852  phage major capsid protein, HK97 family  26.48 
 
 
466 aa  92.4  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107077  normal  0.025439 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0540  putative major capsid protein  24.1 
 
 
388 aa  90.9  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.272419 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12666  phiRv2 prophage protein  25.52 
 
 
479 aa  90.1  5e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.5272e-17  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4361  phage major capsid protein, HK97  26.63 
 
 
389 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.455164  normal  0.407566 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0569  phage major capsid protein, HK97 family  25 
 
 
514 aa  85.9  1e-15  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.361307  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2910  phage major capsid protein, HK97  26.52 
 
 
281 aa  85.1  2e-15  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2954  phage major capsid protein, HK97  26.52 
 
 
281 aa  85.1  2e-15  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.624972  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3078  phage major capsid protein, HK97  26.95 
 
 
282 aa  83.6  6e-15  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.237973  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1619  HK97 family phage major capsid protein  24.47 
 
 
437 aa  83.6  6e-15  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.314426 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3878  phage major capsid protein, HK97  29.15 
 
 
285 aa  81.6  2e-14  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.112437  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3805  phage major capsid protein, HK97  29.15 
 
 
285 aa  81.6  2e-14  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.183482  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4311  phage major capsid protein, HK97  29.15 
 
 
285 aa  81.6  2e-14  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.101318  normal  0.740598 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2686  phage major capsid protein, HK97 family  29.11 
 
 
466 aa  75.5  1e-12  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3666  major capsid protein HK97  26.67 
 
 
337 aa  75.5  2e-12  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.017941  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3486  HK97 family phage major capsid protein  25.61 
 
 
394 aa  73.2  8e-12  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.168874  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1284  major capsid protein HK97  23.47 
 
 
416 aa  69.3  1e-10  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0461297  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3877  hypothetical protein  24.52 
 
 
490 aa  68.9  2e-10  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0282142 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>