268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2793 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_2793  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 108 aa  216  1e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000236555  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0378  transcriptional regulator, XRE family  38.94 
 
 		 120 aa  85.9  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.309443  hitchhiker  0.00198984 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0058  transcriptional regulator, XRE family  42.42 
 
 		 112 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0711688  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2483  transcriptional regulator, XRE family  34.69 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0889  XRE family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 81 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4456  transcriptional regulator, XRE family  40.91 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0814  XRE family transcriptional regulator  31 
 
 		 112 aa  52.8  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0751  helix-turn-helix domain-containing protein  41.27 
 
 		 69 aa  52.4  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0163  transcriptional regulator, XRE family  39.06 
 
 		 141 aa  50.4  0.000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.953205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4304  transcriptional regulator, XRE family  38.33 
 
 		 131 aa  50.4  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.663644 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4237  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 140 aa  50.1  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.55821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2112  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  27.37 
 
 		 299 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0280682 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2388  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  27.37 
 
 		 299 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  36.67 
 
 		 256 aa  49.7  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5705  transcriptional regulator, XRE family  37.1 
 
 		 139 aa  48.9  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.712971 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1971  XRE family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 112 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.910423 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0921  XRE family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000830973  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2349  hypothetical protein  44.23 
 
 		 69 aa  49.3  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0746  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  26.32 
 
 		 306 aa  48.9  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.248494  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0921  Tn916, transcriptional regulator, putative  30.21 
 
 		 117 aa  48.5  0.00003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2064  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  26.32 
 
 		 299 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.471576  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1436  transcriptional regulator, XRE family  29.69 
 
 		 83 aa  48.1  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.118358  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1806  XRE family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 86 aa  48.1  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.579392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5234  DNA-binding protein  33.85 
 
 		 67 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000302998 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0278  XRE family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 128 aa  47.8  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000672654  normal  0.646275 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1500  transcriptional regulator, XRE family  36.51 
 
 		 81 aa  47.8  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0794  transcriptional regulator, XRE family  31.08 
 
 		 101 aa  47.8  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.382222 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0070  XRE family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 67 aa  47.4  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3445  XRE family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 76 aa  47.4  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0664347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06770  predicted transcriptional regulator  31.15 
 
 		 106 aa  47.4  0.00006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4217  helix-turn-helix domain-containing protein  35.48 
 
 		 69 aa  47.4  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.538571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0083  DNA-binding protein  33.85 
 
 		 67 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000440854 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0086  DNA-binding protein  33.85 
 
 		 67 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.786766  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0073  DNA-binding protein  33.85 
 
 		 67 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0074  DNA-binding protein  33.85 
 
 		 67 aa  47.4  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0070  transcriptional regulator  33.85 
 
 		 67 aa  47.4  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0070  transcriptional regulator  33.85 
 
 		 67 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0074  DNA-binding protein  33.85 
 
 		 67 aa  47.4  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0278  XRE family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 145 aa  47.4  0.00007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1868  XRE family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 81 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1190  transcriptional regulator, XRE family  31.94 
 
 		 79 aa  47.4  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1992  transcriptional regulator, XRE family  33.87 
 
 		 81 aa  47  0.00008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2077  transcriptional regulator, XRE family  33.87 
 
 		 81 aa  47  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0687  XRE family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 105 aa  47  0.00009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0236581  normal  0.500342 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3831  prophage LambdaBa02, repressor protein  29.41 
 
 		 122 aa  47  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0071415  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4126  prophage LambdaBa02, repressor protein  29.41 
 
 		 122 aa  47  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.158818  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4657  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  28.87 
 
 		 305 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.848783 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0465  transcriptional regulator, XRE family  26.21 
 
 		 163 aa  46.2  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00289124  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0026  XRE family transcriptional regulator  30 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4719  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 156 aa  46.6  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4028  prophage LambdaBa02, repressor protein  29.41 
 
 		 122 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.210086  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0841  XRE family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 129 aa  46.6  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000196105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6836  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 199 aa  46.2  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6923  XRE family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 81 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.251007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0591  XRE family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 113 aa  46.6  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4841  cupin 2 domain-containing protein  40.62 
 
 		 202 aa  46.2  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2429  XRE family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 191 aa  46.6  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0848952 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2116  hypothetical protein  34.43 
 
 		 86 aa  45.4  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1091  transcriptional regulator, XRE family  32.39 
 
 		 79 aa  45.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4980  XRE family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 93 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.213037  normal  0.656597 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1890  XRE family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 120 aa  46.2  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00515298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 252 aa  45.8  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0568  transcriptional regulator, XRE family  37.84 
 
 		 304 aa  45.8  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.415819  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2435  transcriptional regulator, XRE family  29.49 
 
 		 105 aa  45.4  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0082  DNA-binding protein  32.31 
 
 		 67 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.815457  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1249  Cro/CI family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 74 aa  45.4  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2655  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 80 aa  45.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4238  XRE family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 154 aa  45.4  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0673449  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20950  putative prophage repressor  32.86 
 
 		 200 aa  45.1  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000578065  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0474  XRE family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 192 aa  45.4  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.554508  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10510  Helix-turn-helix protein  31.75 
 
 		 101 aa  45.1  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0903  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 255 aa  45.4  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000193278  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0300  helix-turn-helix domain-containing protein  25.71 
 
 		 370 aa  45.1  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.193502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0051  XRE family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 138 aa  45.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5326  transcriptional regulator, XRE family  35.38 
 
 		 68 aa  45.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.134062 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1224  transcriptional regulator, XRE family  30.56 
 
 		 79 aa  44.7  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0288237  hitchhiker  0.00260767 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1650  DNA-binding protein  30.53 
 
 		 181 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000412674  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1892  XRE family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 390 aa  45.1  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0261519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1781  DNA-binding protein  30.53 
 
 		 181 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1921  transcriptional regulator, XRE family  28.17 
 
 		 78 aa  44.7  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.339052  normal  0.010603 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1649  XRE family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 181 aa  44.7  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.176921  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1554  XRE family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 91 aa  45.1  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.902215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2484  XRE family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 187 aa  44.7  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0499056 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1998  transcriptional regulator, XRE family  24.77 
 
 		 131 aa  44.7  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0308  transcriptional regulator, XRE family  24.77 
 
 		 144 aa  44.7  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3608  XRE family transcriptional regulator  27 
 
 		 130 aa  44.7  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3995  XRE family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 120 aa  44.7  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4240  hypothetical protein  32.26 
 
 		 472 aa  44.7  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.726169  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1555  DNA-binding protein  34.92 
 
 		 72 aa  44.3  0.0005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000236293  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3546  DNA-binding protein  30.53 
 
 		 181 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1854  DNA-binding protein  30.53 
 
 		 181 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.653009  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1629  MerR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 181 aa  44.3  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000044317  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1599  MerR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 181 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2467  transcriptional regulator, XRE family  31.75 
 
 		 122 aa  44.7  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000461389  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0877  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  26.04 
 
 		 317 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.54694  normal  0.67724 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1831  DNA-binding protein  30.53 
 
 		 181 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1906  DNA-binding protein  30.53 
 
 		 181 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0011859  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3248  transcriptional regulator, XRE family  35.59 
 
 		 110 aa  44.7  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2958  transcriptional regulator, XRE family  35 
 
 		 70 aa  44.3  0.0006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.526804  normal  0.873082 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3182  transcriptional regulator, XRE family  38.89 
 
 		 513 aa  44.3  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0470208  hitchhiker  0.000000000985397 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>