193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2790 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_2790  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 
133 aa  273  6e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  2.03467e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0958  transcriptional regulator, XRE family  85.71 
 
 
133 aa  235  1e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1027  transcriptional regulator, XRE family  48.44 
 
 
321 aa  67.8  4e-11  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3095  XRE family transcriptional regulator  41.43 
 
 
152 aa  66.2  1e-10  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2436  transcriptional regulator, XRE family  41.56 
 
 
104 aa  62.8  1e-09  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0364  XRE family transcriptional regulator  46.67 
 
 
231 aa  62  2e-09  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2460  XRE family transcriptional regulator  40.74 
 
 
142 aa  59.7  1e-08  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0113682  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3317  transcriptional regulator, XRE family  41.94 
 
 
281 aa  58.9  2e-08  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  7.86405e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0702  XRE family transcriptional regulator  48.39 
 
 
137 aa  58.2  3e-08  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000217339  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2431  XRE family transcriptional regulator  42.19 
 
 
143 aa  57.8  4e-08  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0278  XRE family transcriptional regulator  42.62 
 
 
128 aa  57.8  5e-08  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  6.72654e-05  normal  0.646275 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0465  transcriptional regulator, XRE family  28 
 
 
163 aa  57.4  6e-08  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00289124  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2878  transcriptional regulator, XRE family  44.26 
 
 
322 aa  57.4  7e-08  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00252317  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07480  helix-turn-helix domain protein  31.73 
 
 
301 aa  55.1  3e-07  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.961759  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0514  DNA-binding protein  42.62 
 
 
328 aa  55.1  3e-07  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00329657 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1249  Cro/CI family transcriptional regulator  47.54 
 
 
74 aa  55.1  3e-07  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00980  predicted transcriptional regulator  38.71 
 
 
459 aa  54.3  5e-07  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.224409  normal  0.709118 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1254  transcriptional regulator, XRE family  41.43 
 
 
364 aa  54.3  5e-07  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2791  XRE family transcriptional regulator  33.82 
 
 
139 aa  54.3  5e-07  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0797  transcriptional regulator, XRE family  28.3 
 
 
206 aa  53.9  6e-07  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.028007  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0510  XRE family transcriptional regulator  42.62 
 
 
114 aa  53.9  7e-07  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  7.59518e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2209  putative DNA-binding protein  37.1 
 
 
117 aa  53.9  7e-07  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.706329  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3459  transcriptional regulator  45.31 
 
 
145 aa  53.9  8e-07  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3465  XRE family transcriptional regulator  45.31 
 
 
142 aa  53.5  9e-07  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1587  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 
75 aa  53.1  1e-06  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4720  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 
327 aa  53.1  1e-06  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1576  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 
75 aa  53.1  1e-06  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4446  putative phage repressor  32.39 
 
 
209 aa  53.5  1e-06  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1565  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 
75 aa  53.1  1e-06  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1715  XRE family transcriptional regulator  38.81 
 
 
152 aa  52.4  2e-06  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  1.19777e-11  normal  0.864438 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3288  transcriptional regulator, XRE family  40.62 
 
 
135 aa  52  3e-06  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1604  DNA-binding protein  40.98 
 
 
114 aa  52  3e-06  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00115974  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2113  transcriptional regulator, putative  35.21 
 
 
143 aa  51.2  4e-06  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1391  hypothetical protein  48.21 
 
 
342 aa  51.2  4e-06  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0916  XRE family transcriptional regulator  45.16 
 
 
115 aa  50.8  6e-06  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0495  XRE family transcriptional regulator  30.36 
 
 
100 aa  50.8  6e-06  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00400235  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2431  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 
125 aa  50.8  6e-06  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000620136 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3618  XRE family transcriptional regulator  35.48 
 
 
123 aa  50.8  6e-06  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0637  XRE family transcriptional regulator  35.48 
 
 
115 aa  50.4  7e-06  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  1.52617e-06  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2111  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 
380 aa  50.4  7e-06  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2433  transcriptional regulator, XRE family  34.85 
 
 
132 aa  50.8  7e-06  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000213647 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1673  ABC transporter related  41.79 
 
 
293 aa  50.4  7e-06  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  5.39653e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0575  XRE family transcriptional regulator  35.48 
 
 
115 aa  50.4  7e-06  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  1.42648e-12  normal  0.969931 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0468  transcriptional regulator, XRE family  34.33 
 
 
82 aa  49.7  1e-05  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  1.57698e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1967  XRE family transcriptional regulator  43.86 
 
 
268 aa  50.1  1e-05  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  1.6802e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2672  transcriptional regulator, XRE family  34.43 
 
 
118 aa  49.7  1e-05  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  6.79525e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2624  XRE family transcriptional regulator  38.81 
 
 
112 aa  48.9  2e-05  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00551798  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0801  XRE family transcriptional regulator  36.07 
 
 
111 aa  48.9  2e-05  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  2.60527e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1621  transcriptional regulator  38.33 
 
 
146 aa  49.3  2e-05  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1881  DNA-binding protein  38.33 
 
 
142 aa  49.3  2e-05  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2730  putative DNA-binding protein  27.27 
 
 
117 aa  49.3  2e-05  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  1.0572e-06  hitchhiker  2.67972e-05 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3663  helix-turn-helix domain protein  39.66 
 
 
262 aa  48.1  3e-05  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0164225  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3652  helix-turn-helix domain-containing protein  39.66 
 
 
262 aa  48.5  3e-05  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0250948  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2391  transcriptional regulator, XRE family  38.18 
 
 
247 aa  48.1  4e-05  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.274459 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1578  helix-turn-helix domain protein  39.66 
 
 
262 aa  48.1  4e-05  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00571888  normal  0.126267 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1882  prophage LambdaSa2, repressor protein, putative  36.76 
 
 
120 aa  48.1  4e-05  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.124676  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0281  XRE family transcriptional regulator  37.88 
 
 
78 aa  48.1  4e-05  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0335018  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3317  XRE family transcriptional regulator  39.66 
 
 
262 aa  48.1  4e-05  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00645923  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0234  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 
334 aa  47.8  5e-05  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00407493  hitchhiker  7.90722e-13 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1067  transcriptional regulator, XRE family  32.35 
 
 
82 aa  47.8  5e-05  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0145003  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0117  transcriptional regulator, XRE family  33.87 
 
 
118 aa  47.4  7e-05  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0416  prophage LambdaBa04, DNA-binding protein  33.33 
 
 
114 aa  47.4  7e-05  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0428  prophage lambdaba04, DNA-binding protein  33.33 
 
 
114 aa  47.4  7e-05  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.663163  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19180  predicted transcriptional regulator  35 
 
 
141 aa  47  8e-05  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.433834  normal  0.0717748 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0798  transcriptional regulator, XRE family  44.44 
 
 
73 aa  47  8e-05  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0286273  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1063  hypothetical protein  36.07 
 
 
149 aa  47  9e-05  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0001043  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4130  prophage lambdaba02, repressor protein  25.45 
 
 
114 aa  47  9e-05  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.05101  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2457  transcriptional regulator, XRE family  33.82 
 
 
380 aa  47  9e-05  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3833  prophage LambdaBa02, repressor protein  25.45 
 
 
114 aa  47  9e-05  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1666  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 
205 aa  47  9e-05  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.130033  hitchhiker  0.00224482 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2626  transcriptional regulator, XRE family  29.11 
 
 
137 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0239529  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1292  transcriptional regulator, XRE family  37.1 
 
 
110 aa  46.2  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.020008  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1022  DNA-binding protein  34.43 
 
 
149 aa  46.2  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  1.16919e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4236  hypothetical protein  26.42 
 
 
149 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00014165  hitchhiker  2.09993e-08 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1223  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  43.75 
 
 
197 aa  46.6  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.995499 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1538  XRE family transcriptional regulator  32.79 
 
 
374 aa  46.6  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4388  helix-turn-helix domain-containing protein  32.31 
 
 
355 aa  46.6  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0956  DNA-binding protein  34.43 
 
 
92 aa  46.2  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00187553  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3466  transcriptional regulator, XRE family  32.84 
 
 
121 aa  45.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0047  XRE family transcriptional regulator  37.7 
 
 
192 aa  46.2  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.139805  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7699  putative transcriptional regulator  36.07 
 
 
112 aa  46.2  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.829097  normal  0.153836 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0945  XRE family transcriptional regulator  34.43 
 
 
149 aa  46.2  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  4.14379e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2146  transcriptional regulator, XRE family  35.09 
 
 
206 aa  46.2  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0483341  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1543  XRE family transcriptional regulator  41.38 
 
 
359 aa  46.2  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0944  DNA-binding protein transcriptional regulator  33.87 
 
 
149 aa  46.2  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.85883e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1103  hypothetical protein  34.43 
 
 
149 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23911e-56 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1931  transcriptional regulator of molybdate metabolism, XRE family  36.62 
 
 
352 aa  45.4  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.584244  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26020  predicted transcriptional regulator  31.58 
 
 
200 aa  45.8  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.676624  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0471  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  28.12 
 
 
72 aa  45.4  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  1.42015e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2790  helix-turn-helix domain protein  32.93 
 
 
393 aa  45.4  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.783266 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_13  putative peptidase, S24-like  28.45 
 
 
205 aa  45.1  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.568691  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6747  XRE family transcriptional regulator  30.77 
 
 
115 aa  44.7  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3135  transcriptional regulator, XRE family  36.07 
 
 
137 aa  45.1  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.317529  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0099  XRE-family DNA-binding domain-containing protein  35.48 
 
 
296 aa  44.7  0.0004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12052  transcriptional regulator  30.16 
 
 
346 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.12403  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1144  helix-turn-helix domain-containing protein  37.5 
 
 
145 aa  44.7  0.0005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  1.3392e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20950  putative prophage repressor  34.92 
 
 
200 aa  44.7  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.78065e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2256  transcriptional regulator, XRE family  30.12 
 
 
117 aa  44.3  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0869  helix-turn-helix domain-containing protein  37.7 
 
 
110 aa  44.3  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0966  transcriptional regulator, XRE family  32.86 
 
 
277 aa  44.3  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>