25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2737 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_2737  hypothetical protein  100 
 
 
86 aa  177  4e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3123  hypothetical protein  39.39 
 
 
246 aa  51.2  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00465086  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3746  hypothetical protein  31.34 
 
 
269 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2787  hypothetical protein  33.85 
 
 
246 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.20395 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4446  phage O protein family  36.36 
 
 
313 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0401993  unclonable  0.00000000141211 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1259  phage O family protein  44.29 
 
 
315 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000280847  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1653  hypothetical protein  35.38 
 
 
251 aa  47  0.00008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000671597  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1433  phage O protein family  46.48 
 
 
320 aa  47  0.00009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000630558  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0244  hypothetical protein  36.92 
 
 
80 aa  47  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.201216  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1423  hypothetical protein  36.92 
 
 
269 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1441  hypothetical protein  36.92 
 
 
269 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2497  Terminase  36.36 
 
 
455 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0224039  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3439  putative transcriptional regulator  36.92 
 
 
249 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119584  unclonable  9.09525e-17 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1139  replication protein  37.68 
 
 
326 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00398063  hitchhiker  2.1893400000000002e-24 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2159  replication protein  35.82 
 
 
274 aa  44.7  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000201859  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01960  hypothetical protein  36.11 
 
 
318 aa  43.9  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2981  hypothetical protein  36.23 
 
 
270 aa  43.9  0.0008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2276  phage O protein  46.15 
 
 
295 aa  43.5  0.0009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000295472  hitchhiker  0.000000000000106842 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0773  hypothetical protein  31.34 
 
 
249 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00104231 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0743  putative replication protein  31.34 
 
 
249 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1425  hypothetical protein  30.14 
 
 
328 aa  41.2  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.792823  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3612  putative replication protein  31.34 
 
 
249 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000425732  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0770  hypothetical protein  31.34 
 
 
244 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0218266  normal  0.283783 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3448  hypothetical protein  37.78 
 
 
237 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06400  hypothetical protein  33.33 
 
 
352 aa  40.4  0.008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>