58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2641 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_2641  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  100 
 
 		 423 aa  884    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2424  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  63.36 
 
 		 423 aa  577  1.0000000000000001e-163  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2545  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  58.44 
 
 		 361 aa  496  1e-139  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.290644  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2647  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  49.16 
 
 		 426 aa  404  1e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2346  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  27.19 
 
 		 609 aa  97.4  5e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.600899 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3117  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  27.07 
 
 		 342 aa  89.7  9e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.853672  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1814  ATP-binding region ATPase domain protein  30.35 
 
 		 614 aa  85.9  0.000000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.211625  normal  0.35963 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0469  ATP-binding region ATPase domain protein  27.54 
 
 		 444 aa  80.5  0.00000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02250  histidine kinase  21.05 
 
 		 450 aa  74.7  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1751  sensor histidine kinase VirS  25.46 
 
 		 440 aa  73.9  0.000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0035916  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0430  ATP-binding region ATPase domain protein  25.1 
 
 		 313 aa  73.6  0.000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000157774 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1481  sensor histidine kinase VirS  24.54 
 
 		 441 aa  71.2  0.00000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000161061  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0032  histidine kinase-related ATPase, putative  25.42 
 
 		 248 aa  71.2  0.00000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000737644  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0499  sensor histidine kinase  25 
 
 		 431 aa  66.6  0.0000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000246195  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2269  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  20.6 
 
 		 442 aa  64.7  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0582  signal transduction protein  24.68 
 
 		 431 aa  60.5  0.00000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1601  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  20 
 
 		 446 aa  57.8  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00658825  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0487  sensor histidine kinase  23.66 
 
 		 431 aa  57.8  0.0000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0885624  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0401  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  27.19 
 
 		 479 aa  57.8  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3688  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  23.26 
 
 		 280 aa  56.6  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3198  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  27.67 
 
 		 456 aa  55.5  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000728956 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01630  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  22.69 
 
 		 325 aa  54.7  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0515  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  23.92 
 
 		 526 aa  55.1  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1579  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  23.56 
 
 		 277 aa  53.9  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000246185  normal  0.151427 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0863  putative sensor histidine kinase  24.55 
 
 		 420 aa  53.5  0.000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.147928  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1377  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  25.94 
 
 		 525 aa  53.1  0.000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14600  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  23.9 
 
 		 445 aa  52.8  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000227922  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0975  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  21.11 
 
 		 242 aa  52.8  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0745  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  22.22 
 
 		 460 aa  51.6  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0499  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  23.32 
 
 		 287 aa  50.1  0.00007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000111074  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4058  sporulation kinase B  21.66 
 
 		 424 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4025  sporulation kinase B  21.66 
 
 		 424 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4131  sporulation kinase B  21.66 
 
 		 424 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3916  sporulation kinase B  21.66 
 
 		 424 aa  48.1  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.651909  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3748  sporulation kinase B  21.66 
 
 		 424 aa  48.1  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3764  sporulation kinase B  21.66 
 
 		 424 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.320466  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4223  sporulation kinase B  21.66 
 
 		 424 aa  48.1  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0904  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  24.53 
 
 		 241 aa  48.1  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0511  sensor histidine kinase  22.66 
 
 		 516 aa  47.8  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4112  sporulation kinase B  21.66 
 
 		 424 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1127  sporulation kinase B  21.66 
 
 		 424 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.918455 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2708  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.88 
 
 		 424 aa  47.4  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0369764  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3835  histidine kinase  21.3 
 
 		 424 aa  47.4  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0500  sensor histidine kinase  22.66 
 
 		 516 aa  47.4  0.0006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1240  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  23.79 
 
 		 541 aa  46.2  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000276458  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1622  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  26.26 
 
 		 275 aa  46.2  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0471  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  29.5 
 
 		 225 aa  45.1  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0687563 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1781  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.39 
 
 		 430 aa  44.3  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3083  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23.08 
 
 		 541 aa  44.3  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.186488  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4452  sensor protein ZraS  23.28 
 
 		 458 aa  43.5  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.260374  hitchhiker  0.000970682 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1136  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23.72 
 
 		 541 aa  43.5  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2021  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  26.79 
 
 		 534 aa  43.5  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.769355  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3238  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  22.17 
 
 		 539 aa  43.5  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.698752  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2401  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  20.9 
 
 		 456 aa  43.5  0.008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.283788  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3300  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  22.17 
 
 		 539 aa  43.5  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.814205  hitchhiker  0.00983464 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3249  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  22.17 
 
 		 539 aa  43.5  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.710576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4495  sensor protein ZraS  23.28 
 
 		 458 aa  43.1  0.01  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000791685  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1299  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  21.58 
 
 		 618 aa  43.1  0.01  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000225639 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>