104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2614 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_2614  glycoside hydrolase family 43  100 
 
 		 326 aa  677    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0822  Alpha-L-arabinofuranosidase  62.07 
 
 		 385 aa  422  1e-117  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000000000001862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1998  Alpha-N-arabinofuranosidase  60.57 
 
 		 344 aa  417  1e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1323  Alpha-N-arabinofuranosidase  61.16 
 
 		 330 aa  414  9.999999999999999e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3728  Alpha-L-arabinofuranosidase  59.35 
 
 		 383 aa  414  1e-114  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0375  Alpha-N-arabinofuranosidase  57.81 
 
 		 320 aa  413  1e-114  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.194615 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0795  Xylan 1,4-beta-xylosidase  58.26 
 
 		 346 aa  399  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000173963  normal  0.0629112 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0353  Xylan 1,4-beta-xylosidase  56.6 
 
 		 346 aa  398  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4846  Xylan 1,4-beta-xylosidase  58.54 
 
 		 367 aa  394  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0960373  hitchhiker  0.00474985 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03869  beta-xylosidase (1,4-beta-D-xylan xylohydrolase) (Xylan1,4-beta-xylosidase) (Exo-beta-(1,4)-xylanase)  53.48 
 
 		 344 aa  370  1e-101  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01477  beta-1,4-xylosidase (Eurofung)  50 
 
 		 404 aa  348  6e-95  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0551  Xylan 1,4-beta-xylosidase  50.48 
 
 		 335 aa  327  2.0000000000000001e-88  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000239269 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0810  carbohydrate-binding family 6 protein  36.73 
 
 		 450 aa  186  5e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.034958  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3224  Alpha-N-arabinofuranosidase  35.19 
 
 		 444 aa  179  7e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.136595  normal  0.135367 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4501  Alpha-N-arabinofuranosidase  36.04 
 
 		 316 aa  168  1e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.570213  normal  0.69004 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2447  putative xylosidase  31.4 
 
 		 468 aa  160  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.320135 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0946  SecY protein  35.69 
 
 		 317 aa  158  1e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.409307  hitchhiker  0.0000724629 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2196  carbohydrate-binding family 6 protein  32.41 
 
 		 533 aa  157  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1231  Carbohydrate binding family 6  31.89 
 
 		 524 aa  157  3e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0177163  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1235  Carbohydrate binding family 6  32.31 
 
 		 509 aa  153  2.9999999999999998e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00440741  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3213  glycoside hydrolase family 43  30.43 
 
 		 464 aa  153  4e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.331095  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0455  Carbohydrate binding family 6  29.15 
 
 		 618 aa  152  7e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1229  Carbohydrate binding family 6  33.53 
 
 		 535 aa  149  7e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.166566  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2837  glycoside hydrolase family 43  29.52 
 
 		 348 aa  147  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.61366  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3612  methionine biosynthesis MetW  32.23 
 
 		 1186 aa  144  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0161329  hitchhiker  0.00479901 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1992  glycoside hydrolase family protein  32.93 
 
 		 315 aa  143  3e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000493506  unclonable  0.0000204974 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10919  hypothetical protein  28.36 
 
 		 383 aa  143  4e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0280473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1271  carbohydrate-binding family 6 protein  32.26 
 
 		 679 aa  143  4e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1982  glycoside hydrolase family protein  32.93 
 
 		 315 aa  142  6e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000010784  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2069  glycoside hydrolase family protein  32.32 
 
 		 315 aa  142  8e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000027007  hitchhiker  0.0000035019 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2143  glycoside hydrolase family 43  32.93 
 
 		 311 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.209046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2063  glycoside hydrolase family protein  31.71 
 
 		 311 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000284349  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01459  xylosidase; arabinosidase  28.29 
 
 		 527 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.928055  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0789  endo-1,4-beta-xylanase D precursor  32.22 
 
 		 317 aa  120  3e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0130439  normal  0.452031 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0823  glycoside hydrolase family 43  29.88 
 
 		 302 aa  120  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.328209 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0182  glycoside hydrolase family 43  30.79 
 
 		 1338 aa  116  5e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1928  Carbohydrate-binding CenC domain protein  28.3 
 
 		 712 aa  107  2e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6730  glycoside hydrolase family 43  29.41 
 
 		 323 aa  99  9e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  normal  0.920031 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2866  glycoside hydrolase family 43  27.27 
 
 		 487 aa  97.8  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.141314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3276  carbohydrate-binding family 6 protein  28.85 
 
 		 401 aa  97.1  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2384  glycoside hydrolase family 43  27.3 
 
 		 330 aa  95.9  8e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0193  glycoside hydrolase family 43  27.61 
 
 		 324 aa  95.5  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00680352  normal  0.581709 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0531  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.57 
 
 		 471 aa  88.6  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1011  glycoside hydrolase family 43  29.41 
 
 		 471 aa  88.2  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1660  carbohydrate binding domain/beta-xylosidase family protein  28.42 
 
 		 667 aa  85.1  0.000000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.324921  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16970  beta-xylosidase  29.36 
 
 		 313 aa  83.2  0.000000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.374085 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01870  xylosidase/arabinosidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04480)  25 
 
 		 344 aa  80.1  0.00000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20580  glycoside hydrolase family 43  26.54 
 
 		 315 aa  79  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3109  glycoside hydrolase family protein  27.03 
 
 		 644 aa  76.3  0.0000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2482  glycoside hydrolase family 43  25.82 
 
 		 384 aa  67.4  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.24102 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2022  glycoside hydrolase family 43  25 
 
 		 334 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0536  glycoside hydrolase family 43  27.94 
 
 		 393 aa  61.2  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.812392 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2722  glycoside hydrolase family protein  26.34 
 
 		 310 aa  60.5  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123508  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2027  glycoside hydrolase family protein  28.52 
 
 		 325 aa  60.5  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.808853  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0737  glycoside hydrolase family protein  27.09 
 
 		 345 aa  59.3  0.00000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.612706  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0507  glycoside hydrolase family 43  28.34 
 
 		 337 aa  57.4  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.412329 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0359  glycoside hydrolase family protein  27.03 
 
 		 506 aa  56.6  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0212595 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2723  glycoside hydrolase family protein  29.91 
 
 		 345 aa  56.2  0.0000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.469303  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4788  Xylan 1,4-beta-xylosidase  25.4 
 
 		 562 aa  54.7  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.771274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3750  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  38.64 
 
 		 319 aa  54.3  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00407758  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1729  glycoside hydrolase family 43  32.95 
 
 		 472 aa  53.1  0.000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.101805  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2971  glycoside hydrolase family 43  22.66 
 
 		 855 aa  52  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0529993 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1115  family 43 glycoside hydrolase  24.34 
 
 		 338 aa  50.8  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2639  glycoside hydrolase family 43  25.2 
 
 		 472 aa  51.2  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  0.0143862 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3903  glycoside hydrolase family protein  27.46 
 
 		 340 aa  50.4  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.969992  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0739  glycoside hydrolase family protein  25.44 
 
 		 348 aa  50.1  0.00005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3228  glycoside hydrolase family protein  27.75 
 
 		 563 aa  50.1  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00674596  normal  0.0120766 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0206  glycoside hydrolase family 43  29.58 
 
 		 304 aa  50.1  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1150  glycoside hydrolase family 43  25.4 
 
 		 560 aa  49.3  0.00008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2156  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  22.3 
 
 		 352 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000116592  hitchhiker  0.00999646 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3334  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.2 
 
 		 536 aa  47  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.783434  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0191  glycoside hydrolase family protein  26.38 
 
 		 512 aa  47.4  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2732  glycoside hydrolase family 43  27.23 
 
 		 315 aa  47.4  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2529  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.44 
 
 		 355 aa  47  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0997912 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0501  glycoside hydrolase family 43  22.82 
 
 		 525 aa  46.6  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00998877 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1500  glycoside hydrolase family 43  24.5 
 
 		 551 aa  47  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0650  glycoside hydrolase family 43  22.18 
 
 		 495 aa  46.6  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0713148  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4504  glycoside hydrolase family 43  29.78 
 
 		 510 aa  46.6  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4540  coagulation factor 5/8 type domain protein  29.38 
 
 		 616 aa  46.2  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0786  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  23.7 
 
 		 346 aa  46.2  0.0008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141301  normal  0.447167 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4284  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  31.96 
 
 		 327 aa  45.4  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2809  ATPase  24.56 
 
 		 789 aa  45.1  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153749  decreased coverage  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03855  xylosidase; arabinosidase  27.49 
 
 		 556 aa  44.7  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0745  glycoside hydrolase family 43  29.36 
 
 		 327 aa  45.1  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.465475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5511  glycoside hydrolase family 43  25.16 
 
 		 536 aa  44.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6044  glycoside hydrolase family 43  29.53 
 
 		 501 aa  44.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.845022  normal  0.0554344 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2051  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  22.56 
 
 		 357 aa  44.3  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3519  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  27.27 
 
 		 640 aa  44.3  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1390  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  23.6 
 
 		 341 aa  44.3  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.287204  normal  0.664348 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2423  glycoside hydrolase family 43  32.65 
 
 		 699 aa  43.9  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2392  glycoside hydrolase family 43  28.57 
 
 		 306 aa  44.3  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540158  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1423  Xylan 1,4-beta-xylosidase  27.41 
 
 		 558 aa  44.3  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.423704 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4249  glycoside hydrolase family protein  37.31 
 
 		 532 aa  43.9  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158619  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2632  glycoside hydrolase family protein  25.75 
 
 		 543 aa  43.5  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0211688  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2556  glycoside hydrolase family 43  23.6 
 
 		 319 aa  43.5  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.149373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1233  Carbohydrate binding family 6  25.11 
 
 		 746 aa  43.1  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.555313  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1751  coagulation factor 5/8 type domain protein  29.41 
 
 		 576 aa  43.1  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1302  putative beta-xylosidase  33.33 
 
 		 713 aa  43.1  0.007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0628  glycoside hydrolase family 43  24.9 
 
 		 505 aa  43.1  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3109  glycoside hydrolase family protein  22.5 
 
 		 348 aa  42.7  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.158232 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>