More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2587 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_2587  ABC transporter related  100 
 
 		 240 aa  485  1e-136  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.163007  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  70 
 
 		 240 aa  342  2.9999999999999997e-93  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  67.92 
 
 		 240 aa  340  2e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  69.17 
 
 		 240 aa  338  2.9999999999999998e-92  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0849  ABC transporter related  65.42 
 
 		 247 aa  337  7e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000288361  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2289  ABC transporter related  65.42 
 
 		 240 aa  334  7.999999999999999e-91  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000025555  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1053  ABC transporter related  65.42 
 
 		 242 aa  333  2e-90  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0949  ABC transporter related  66.25 
 
 		 241 aa  332  3e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0984  ABC transporter related  66.25 
 
 		 241 aa  332  3e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3029  ABC transporter related  66.25 
 
 		 241 aa  330  9e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0970  ABC transporter related  66.25 
 
 		 241 aa  330  1e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.805871  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  63.33 
 
 		 242 aa  329  2e-89  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  65.83 
 
 		 244 aa  330  2e-89  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3394  ABC transporter related  65.42 
 
 		 241 aa  328  3e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00476356  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  65.83 
 
 		 242 aa  328  3e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1977  glutamate ABC transporter ATP-binding protein  64.17 
 
 		 244 aa  328  4e-89  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  67.5 
 
 		 240 aa  327  8e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  62.5 
 
 		 244 aa  327  9e-89  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  65.83 
 
 		 240 aa  327  1.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  64.17 
 
 		 242 aa  325  3e-88  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  65.42 
 
 		 240 aa  325  3e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  63.75 
 
 		 244 aa  325  3e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0917  ABC transporter related  64.17 
 
 		 241 aa  324  1e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0880  ABC transporter related  64.17 
 
 		 241 aa  324  1e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.152128  normal  0.31511 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0492  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  64.17 
 
 		 244 aa  323  2e-87  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00185587  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1042  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  64.17 
 
 		 241 aa  323  2e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3055  ABC transporter related  64.17 
 
 		 241 aa  323  2e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00427883  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  65.42 
 
 		 239 aa  322  4e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3164  ABC transporter-related protein  65.42 
 
 		 241 aa  322  4e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.195167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1473  ABC transporter related  64.17 
 
 		 243 aa  322  5e-87  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0234902  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3399  ABC transporter related  65.42 
 
 		 241 aa  320  9.999999999999999e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0726  ABC transporter related  64.17 
 
 		 243 aa  319  3e-86  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1072  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  64.58 
 
 		 240 aa  319  3e-86  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.244358  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3762  ABC transporter-related protein  63.75 
 
 		 241 aa  319  3e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000558421  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  60.25 
 
 		 246 aa  318  3.9999999999999996e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1229  ABC transporter related  63.75 
 
 		 243 aa  318  3.9999999999999996e-86  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2280  ABC transporter related protein  59.12 
 
 		 274 aa  318  7e-86  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000113339  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  61.67 
 
 		 246 aa  315  6e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1596  ABC transporter related  62.34 
 
 		 249 aa  313  1.9999999999999998e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  59.41 
 
 		 249 aa  313  1.9999999999999998e-84  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  59.17 
 
 		 242 aa  312  3.9999999999999997e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1911  ABC transporter related  61.25 
 
 		 242 aa  311  4.999999999999999e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00547545  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1945  ABC transporter related  61.25 
 
 		 242 aa  311  4.999999999999999e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0428328  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2727  ABC transporter related  61.25 
 
 		 243 aa  311  5.999999999999999e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3809  ABC transporter related  60.42 
 
 		 240 aa  311  7.999999999999999e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1394  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  60 
 
 		 240 aa  310  1e-83  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0590  ABC transporter related protein  58.58 
 
 		 257 aa  310  1e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0861  ATPase  57.74 
 
 		 363 aa  309  2e-83  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.528651 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1038  ATPase  57.74 
 
 		 363 aa  309  2e-83  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.396319 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0490  ABC transporter related  62.24 
 
 		 241 aa  310  2e-83  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2152  ABC transporter related  58.75 
 
 		 242 aa  309  2.9999999999999997e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.104649 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0396  ABC transporter related  60.83 
 
 		 253 aa  308  4e-83  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127447  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2057  ABC transporter related  60.42 
 
 		 243 aa  307  9e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  59.83 
 
 		 244 aa  307  1.0000000000000001e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  59.17 
 
 		 244 aa  307  1.0000000000000001e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3165  ABC transporter related  61.09 
 
 		 257 aa  307  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.127499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0973  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60 
 
 		 240 aa  306  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000128228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3993  ABC transporter related  60.83 
 
 		 240 aa  306  2.0000000000000002e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.107157  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0468  ABC transporter related  62.5 
 
 		 240 aa  306  2.0000000000000002e-82  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4704  ABC transporter-related protein  60.67 
 
 		 257 aa  306  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.874551  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4057  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  60 
 
 		 240 aa  306  3e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000175078  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3903  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60 
 
 		 240 aa  306  3e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000661212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4374  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  60 
 
 		 240 aa  306  3e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00801919  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4283  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60 
 
 		 240 aa  306  3e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000077342  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  57.5 
 
 		 244 aa  305  4.0000000000000004e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1042  ABC transporter related  58.75 
 
 		 241 aa  305  4.0000000000000004e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0556178  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3896  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.58 
 
 		 240 aa  305  5.0000000000000004e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000617996  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4172  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60 
 
 		 240 aa  305  5.0000000000000004e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.183609 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1428  ATPase  58.33 
 
 		 242 aa  305  5.0000000000000004e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0713  ABC transporter related  56.9 
 
 		 363 aa  303  1.0000000000000001e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  57.92 
 
 		 242 aa  303  1.0000000000000001e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0741  ABC transporter related  61 
 
 		 241 aa  303  1.0000000000000001e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2298  ABC transporter related  60 
 
 		 247 aa  303  1.0000000000000001e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000478919  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_360  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.42 
 
 		 284 aa  303  1.0000000000000001e-81  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000584312  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2021  ABC transporter related  56.9 
 
 		 363 aa  303  1.0000000000000001e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4223  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.58 
 
 		 240 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00581903  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1871  ABC transporter related protein  61.67 
 
 		 240 aa  303  2.0000000000000002e-81  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000629259  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1445  ABC transporter related  60.83 
 
 		 249 aa  303  2.0000000000000002e-81  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.124868  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.42 
 
 		 253 aa  302  3.0000000000000004e-81  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00684125  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  59.58 
 
 		 240 aa  302  3.0000000000000004e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2847  ABC transporter-related protein  60.42 
 
 		 240 aa  301  4.0000000000000003e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.174952  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4262  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.17 
 
 		 240 aa  301  5.000000000000001e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00783268  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1064  ABC transporter related  58.33 
 
 		 252 aa  301  6.000000000000001e-81  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0916  ABC transporter related  57.92 
 
 		 242 aa  301  6.000000000000001e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3012  ABC transporter related  57.32 
 
 		 244 aa  301  7.000000000000001e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197193  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0099  ABC transporter related  60.25 
 
 		 247 aa  301  8.000000000000001e-81  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000131657  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.83 
 
 		 240 aa  300  2e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1924  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  59.83 
 
 		 247 aa  299  3e-80  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.467603  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3404  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.17 
 
 		 240 aa  298  4e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0452934  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3499  ABC transporter related  56.91 
 
 		 254 aa  298  4e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.114372  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0469  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60 
 
 		 240 aa  298  7e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0468  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60 
 
 		 240 aa  298  7e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3151  ABC transporter related  57.08 
 
 		 242 aa  298  7e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0859723 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1462  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  57.32 
 
 		 246 aa  297  9e-80  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.837039  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4901  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.42 
 
 		 240 aa  297  9e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0354  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  60 
 
 		 240 aa  297  1e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0344  ABC transporter related  59.17 
 
 		 242 aa  296  1e-79  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0368  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  60 
 
 		 240 aa  297  1e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1457  ABC transporter related  57.5 
 
 		 253 aa  297  1e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.830633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1180  ABC transporter related  56.49 
 
 		 360 aa  297  1e-79  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>