253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2530 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_2530  Ricin B lectin  100 
 
 
412 aa  831    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00551776  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0661  Ricin B lectin  46.1 
 
 
571 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2942  Alpha-N-arabinofuranosidase  42.38 
 
 
474 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0858983  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2125  Ricin B lectin  44.97 
 
 
491 aa  125  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07393  conserved hypothetical protein  43.97 
 
 
185 aa  123  5e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4966  Alpha-N-arabinofuranosidase  43.62 
 
 
507 aa  123  6e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.451245  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3944  Alpha-N-arabinofuranosidase  39.72 
 
 
466 aa  118  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1643  parallel beta-helix repeat-containing ricin B lectin  40 
 
 
563 aa  117  3e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4440  Ricin B lectin  44.2 
 
 
566 aa  117  3e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0151299  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1280  glycoside hydrolase family 43  40.85 
 
 
691 aa  117  3e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.286369  hitchhiker  0.00183728 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1428  Ricin B lectin  42.28 
 
 
1139 aa  117  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.737248  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2848  Alpha-N-arabinofuranosidase  43.26 
 
 
520 aa  116  6e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.724859  decreased coverage  0.0053695 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  41.84 
 
 
495 aa  112  9e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6977  hypothetical protein  44.78 
 
 
897 aa  111  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.449457  normal  0.690746 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0383  Ricin B lectin  41.13 
 
 
401 aa  110  3e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4084  Ricin B lectin  40.74 
 
 
1413 aa  108  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0740  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  43.36 
 
 
507 aa  108  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1313  Pectate lyase  42.25 
 
 
430 aa  108  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0268992  hitchhiker  0.00857009 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3927  Ricin B lectin  41.67 
 
 
436 aa  107  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1962  Endo-1,4-beta-xylanase  44.7 
 
 
411 aa  106  8e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.634854  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1905  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  43.07 
 
 
695 aa  106  8e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0976  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  42.66 
 
 
507 aa  105  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2449  glycoside hydrolase family 43  41.18 
 
 
537 aa  105  1e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1461  Ricin B lectin  40.14 
 
 
560 aa  103  7e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.851115  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2450  Ricin B lectin  40.91 
 
 
582 aa  102  1e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0349225  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4496  glycoside hydrolase family 43  43.61 
 
 
503 aa  102  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0241272  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4904  Ricin B lectin  38.26 
 
 
494 aa  102  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146094  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2809  ATPase  37.33 
 
 
789 aa  98.6  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153749  decreased coverage  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4174  carbohydrate-binding family 6 protein  38.96 
 
 
957 aa  98.2  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49527  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2162  lipolytic protein G-D-S-L family  50 
 
 
436 aa  98.2  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4287  Ricin B lectin  37.42 
 
 
647 aa  98.6  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.718232  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6252  Ricin B lectin  38.52 
 
 
737 aa  97.1  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.189274 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1014  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  40.15 
 
 
472 aa  96.3  9e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194163  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4621  Ricin B lectin  34.81 
 
 
497 aa  95.5  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3710  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  34.72 
 
 
476 aa  93.2  7e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000857688  normal  0.462081 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3240  protein of unknown function DUF291  41.43 
 
 
2073 aa  93.2  8e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3803  Ricin B lectin  36.54 
 
 
943 aa  92.8  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307116  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3107  protein of unknown function DUF1680  37.04 
 
 
771 aa  92.8  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0859472  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4363  protein of unknown function DUF1680  35.07 
 
 
963 aa  92  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0125989  normal  0.151908 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2967  Ricin B lectin  36.03 
 
 
230 aa  92  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4176  carbohydrate-binding family 6 protein  38 
 
 
884 aa  90.9  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4504  glycoside hydrolase family 43  38.64 
 
 
510 aa  90.5  5e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3586  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  34.97 
 
 
514 aa  90.5  5e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4855  Ricin B lectin  34.97 
 
 
503 aa  89.7  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0410154  normal  0.0144537 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5663  Ricin B lectin  37.5 
 
 
1187 aa  89  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.765642  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6290  Ricin B lectin  31.8 
 
 
1259 aa  89.4  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0798248 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4856  Ricin B lectin  40.88 
 
 
569 aa  89  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.173308  normal  0.0148414 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5674  Ricin B lectin  39.07 
 
 
425 aa  89.4  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.510311 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2017  lipolytic protein G-D-S-L family  62.5 
 
 
303 aa  87.4  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4932  Alpha-L-fucosidase  39.26 
 
 
663 aa  87.4  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00307055  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4198  Pectinesterase  30.67 
 
 
487 aa  85.1  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.018397  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4959  Ricin B lectin  39.42 
 
 
576 aa  85.5  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.572354  normal  0.851755 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4332  Ricin B lectin  38.06 
 
 
615 aa  85.1  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.817761  normal  0.0720026 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4574  Ricin B lectin  33.33 
 
 
672 aa  84  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1060  cellulosome protein dockerin type I  61.29 
 
 
295 aa  83.6  0.000000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5654  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.9 
 
 
756 aa  80.5  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171925  normal  0.428495 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1099  glycoside hydrolase family 5  50.7 
 
 
475 aa  80.5  0.00000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4964  Pectinesterase  28.91 
 
 
794 aa  79.3  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467463  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6866  Ricin B lectin  34.62 
 
 
493 aa  78.2  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.191188  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6159  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.49 
 
 
507 aa  77.8  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.444689  normal  0.0822461 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0455  Carbohydrate binding family 6  32.82 
 
 
618 aa  76.6  0.0000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4199  Ricin B lectin  34.31 
 
 
474 aa  75.5  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876848  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2993  endoglucanase-like  41.18 
 
 
863 aa  73.6  0.000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0380373  hitchhiker  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2992  helix-turn-helix, AraC type  39.39 
 
 
982 aa  73.6  0.000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0557584  hitchhiker  0.000000421127 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0429  PKD domain containing protein  46.48 
 
 
861 aa  73.6  0.000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1703  hypothetical protein  31.65 
 
 
392 aa  72.4  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.595343 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0329  Pectate lyase  29.88 
 
 
445 aa  70.5  0.00000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0745769 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3716  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  34.97 
 
 
648 aa  68.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0082152 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2448  PA14 domain protein  35.17 
 
 
1141 aa  67.4  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84904  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1748  Ricin B lectin  37.21 
 
 
1347 aa  67  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207372  normal  0.0116173 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5656  Ricin B lectin  34.4 
 
 
824 aa  67  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0407757  normal  0.559684 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0931  glycoside hydrolase family 10  38.27 
 
 
423 aa  66.6  0.0000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.514764  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0819  pectate lyase  29.49 
 
 
427 aa  66.2  0.0000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.28547  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6915  Pectate lyase-like protein  29.94 
 
 
482 aa  66.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0649  cellulosome protein dockerin type I  47.06 
 
 
532 aa  65.1  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1625  Ricin B lectin  31.85 
 
 
664 aa  64.7  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.174665  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0859  Ricin B lectin  29.51 
 
 
483 aa  64.7  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4927  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  34.65 
 
 
498 aa  60.5  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290499  normal  0.586744 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1472  carbohydrate-binding family 11 protein  39.47 
 
 
900 aa  60.5  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.980604  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2866  glycoside hydrolase family 43  31.01 
 
 
487 aa  60.5  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.141314  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1234  Carbohydrate binding family 6  45.07 
 
 
536 aa  60.1  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.115461  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1664  lectin repeat-containing protein  27.89 
 
 
806 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.912119  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1713  lectin repeat-containing protein  27.89 
 
 
806 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1921  lectin repeat-containing protein  27.89 
 
 
806 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00570044  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0731  glycoside hydrolase family 9  42.65 
 
 
725 aa  58.9  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1890  cellulosome enzyme, dockerin type I  30.07 
 
 
710 aa  59.3  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0596  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  27.89 
 
 
806 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.39383  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4436  glucan 1,6-alpha-isomaltosidase  32.03 
 
 
1172 aa  59.3  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4931  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  35.43 
 
 
493 aa  59.3  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49706  predicted protein  26.99 
 
 
1222 aa  58.9  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2738  Ricin B lectin  33.86 
 
 
468 aa  58.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16823  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0712  lectin repeat-containing protein  27.89 
 
 
806 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.900098  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2337  glycoside hydrolase family 5  44.78 
 
 
539 aa  58.5  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2317  heme utilization/adhesion protein  27.89 
 
 
806 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2233  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  27.89 
 
 
806 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6876  glycoside hydrolase family 76  29.45 
 
 
514 aa  58.9  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.534141  normal 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48282  predicted protein  26.32 
 
 
1567 aa  58.5  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0286  polysaccharide deacetylase  35.35 
 
 
308 aa  58.5  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.350747  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0379  protein of unknown function DUF291  47.06 
 
 
732 aa  58.5  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3022  hypothetical protein  27.66 
 
 
644 aa  58.2  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000919721 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>