More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2511 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_2511  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  100 
 
 		 416 aa  858    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3255  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  41.25 
 
 		 415 aa  332  5e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0113  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  37.1 
 
 		 442 aa  317  2e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0528354  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0126  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  41.19 
 
 		 411 aa  307  2.0000000000000002e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0486  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  37.28 
 
 		 417 aa  303  3.0000000000000004e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.252649  normal  0.657753 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0098  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  37.16 
 
 		 440 aa  303  3.0000000000000004e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2528  pyridoxal-dependent decarboxylase, exosortase system type 1 associated  40.36 
 
 		 416 aa  292  7e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0397628 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2669  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  37.76 
 
 		 410 aa  288  9e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.499942  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1957  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  39.06 
 
 		 410 aa  287  2.9999999999999996e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.47769  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1565  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  39.57 
 
 		 411 aa  283  5.000000000000001e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3425  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  35.01 
 
 		 431 aa  277  3e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.569361  normal  0.792047 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3620  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  34.17 
 
 		 429 aa  276  7e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0244678 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2435  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  39.58 
 
 		 412 aa  274  3e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0136  pyridoxal-dependent decarboxylase, exosortase system type 1 associated  37.43 
 
 		 402 aa  272  7e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0421  putative Orn/DAP/Arg decarboxylase  37.7 
 
 		 402 aa  272  9e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3734  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  35.01 
 
 		 428 aa  272  1e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1392  pyridoxal-dependent decarboxylase, exosortase system type 1 associated  38.42 
 
 		 415 aa  268  1e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0214918  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0700  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  39.3 
 
 		 414 aa  265  1e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4274  pyridoxal-dependent decarboxylase, exosortase system type 1 associated  35.88 
 
 		 402 aa  264  3e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000282467 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2019  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  35.7 
 
 		 419 aa  259  5.0000000000000005e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.225254 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7006  pyridoxal-dependent decarboxylase, exosortase system type 1 associated  37.17 
 
 		 408 aa  258  9e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0015439 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3805  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  36.2 
 
 		 404 aa  258  1e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3879  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  33.25 
 
 		 508 aa  257  2e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00597643  normal  0.0295865 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4030  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  38.5 
 
 		 413 aa  243  6e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.157056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1290  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  32.83 
 
 		 414 aa  239  9e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1929  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  38.2 
 
 		 409 aa  237  3e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1835  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  36.25 
 
 		 430 aa  231  3e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.59311  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2337  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  35.62 
 
 		 408 aa  225  1e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2078  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  31.54 
 
 		 428 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.192664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0834  diaminopimelate decarboxylase  33.9 
 
 		 418 aa  216  7e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3058  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  30.95 
 
 		 418 aa  203  5e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.700588  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3135  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  32.8 
 
 		 404 aa  203  5e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0167539  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4055  diaminopimelate decarboxylase  31.64 
 
 		 417 aa  195  1e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4145  diaminopimelate decarboxylase  30.66 
 
 		 417 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0683  diaminopimelate decarboxylase  30.73 
 
 		 437 aa  189  5e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000143238  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0075  diaminopimelate decarboxylase  29.17 
 
 		 416 aa  189  5.999999999999999e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0353  diaminopimelate decarboxylase  30.66 
 
 		 422 aa  188  2e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.336132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3634  diaminopimelate decarboxylase  30.05 
 
 		 414 aa  187  4e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.239025  normal  0.49264 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0696  diaminopimelate decarboxylase  29.73 
 
 		 431 aa  186  5e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0391  diaminopimelate decarboxylase  29.8 
 
 		 414 aa  186  7e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0390  diaminopimelate decarboxylase  30.05 
 
 		 414 aa  186  7e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0554  diaminopimelate decarboxylase  30.71 
 
 		 419 aa  186  9e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0720  diaminopimelate decarboxylase  30 
 
 		 429 aa  186  1.0000000000000001e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00473762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0716  diaminopimelate decarboxylase  29.48 
 
 		 431 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.670894 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0997  diaminopimelate decarboxylase  29.48 
 
 		 421 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.877632  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1110  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  28.68 
 
 		 397 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.585964  normal  0.770001 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0233  diaminopimelate decarboxylase  30.41 
 
 		 417 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.601671  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2538  diaminopimelate decarboxylase  28.75 
 
 		 422 aa  184  4.0000000000000006e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0787755  normal  0.617657 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0114  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  31.2 
 
 		 400 aa  183  5.0000000000000004e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0110  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  31.2 
 
 		 400 aa  183  5.0000000000000004e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0541  diaminopimelate decarboxylase  29.8 
 
 		 418 aa  182  9.000000000000001e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2910  diaminopimelate decarboxylase  29.41 
 
 		 423 aa  182  9.000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00334908 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1665  diaminopimelate decarboxylase  29.06 
 
 		 399 aa  182  1e-44  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0058  diaminopimelate decarboxylase  28.04 
 
 		 434 aa  182  1e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.586159  normal  0.874852 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4309  diaminopimelate decarboxylase  28.86 
 
 		 414 aa  181  2e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3257  diaminopimelate decarboxylase  28.89 
 
 		 423 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.314031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0207  diaminopimelate decarboxylase  29.18 
 
 		 420 aa  180  4e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0485  diaminopimelate decarboxylase  31.33 
 
 		 420 aa  180  4e-44  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4873  diaminopimelate decarboxylase  28.92 
 
 		 421 aa  180  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1337  diaminopimelate decarboxylase  28.5 
 
 		 418 aa  180  4.999999999999999e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3588  diaminopimelate decarboxylase  30.17 
 
 		 417 aa  180  4.999999999999999e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.776676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2384  diaminopimelate decarboxylase  28.22 
 
 		 421 aa  180  4.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.193755  normal  0.99015 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1724  diaminopimelate decarboxylase  30.71 
 
 		 435 aa  180  4.999999999999999e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0238  diaminopimelate decarboxylase  30.35 
 
 		 414 aa  179  7e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.24058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0729  diaminopimelate decarboxylase  28.22 
 
 		 421 aa  179  9e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1348  diaminopimelate decarboxylase  29.54 
 
 		 416 aa  179  9e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000478718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1301  diaminopimelate decarboxylase  31.55 
 
 		 412 aa  179  1e-43  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2159  diaminopimelate decarboxylase  31.12 
 
 		 407 aa  178  1e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0522  diaminopimelate decarboxylase  29.62 
 
 		 420 aa  179  1e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000495897  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1109  diaminopimelate decarboxylase  30.77 
 
 		 418 aa  178  1e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0992  diaminopimelate decarboxylase  29.63 
 
 		 427 aa  178  2e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0609  diaminopimelate decarboxylase  28.92 
 
 		 437 aa  178  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.357283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2097  diaminopimelate decarboxylase  30.11 
 
 		 430 aa  178  2e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.579458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0227  diaminopimelate decarboxylase  30.96 
 
 		 424 aa  178  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.690316  normal  0.715181 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0377  diaminopimelate decarboxylase  28.24 
 
 		 414 aa  178  2e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1411  diaminopimelate decarboxylase  31.09 
 
 		 386 aa  177  2e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0507581  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2472  diaminopimelate decarboxylase  31.06 
 
 		 412 aa  178  2e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.255967  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0681  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  30.41 
 
 		 416 aa  177  2e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0214  diaminopimelate decarboxylase  29.38 
 
 		 401 aa  177  3e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0541  diaminopimelate decarboxylase  31.13 
 
 		 421 aa  177  3e-43  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.407931  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3735  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  30.05 
 
 		 388 aa  177  3e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0413562  normal  0.130406 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3475  diaminopimelate decarboxylase  29.06 
 
 		 421 aa  177  3e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1588  diaminopimelate decarboxylase  29.78 
 
 		 407 aa  177  3e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3495  diaminopimelate decarboxylase  27.82 
 
 		 421 aa  177  4e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.844313 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4218  diaminopimelate decarboxylase  27.8 
 
 		 427 aa  176  6e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.15741  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3567  diaminopimelate decarboxylase  30.4 
 
 		 422 aa  176  6e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67276  normal  0.379648 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1740  diaminopimelate decarboxylase  28.89 
 
 		 422 aa  176  9e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.309969  normal  0.840232 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2979  diaminopimelate decarboxylase protein  28.19 
 
 		 451 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.492096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2448  diaminopimelate decarboxylase  28.64 
 
 		 421 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.147668  normal  0.347917 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4070  diaminopimelate decarboxylase  27.8 
 
 		 427 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1362  diaminopimelate decarboxylase  30.5 
 
 		 401 aa  175  9.999999999999999e-43  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.884156  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3040  diaminopimelate decarboxylase  30.6 
 
 		 421 aa  175  9.999999999999999e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.365095  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0444  diaminopimelate decarboxylase  29.08 
 
 		 414 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.249159  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1600  diaminopimelate decarboxylase  28.85 
 
 		 422 aa  175  9.999999999999999e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.458641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2020  diaminopimelate decarboxylase  28.33 
 
 		 421 aa  175  9.999999999999999e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0398534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00206  putative diaminopimelate decarboxylase  28.93 
 
 		 416 aa  175  1.9999999999999998e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08531  diaminopimelate decarboxylase  30.79 
 
 		 406 aa  174  1.9999999999999998e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2443  diaminopimelate decarboxylase  28.1 
 
 		 445 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000493249  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0390  diaminopimelate decarboxylase  28.57 
 
 		 414 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.584204  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0858  diaminopimelate decarboxylase  28.36 
 
 		 415 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.168666  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>