More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2489 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_2489  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  100 
 
 
1661 aa  3313  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2319  glycoside hydrolase family 10  37.87 
 
 
1495 aa  330  2e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0293  hypothetical protein  40.4 
 
 
1260 aa  320  1e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00245165  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  33.43 
 
 
1340 aa  297  1e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  36.54 
 
 
1222 aa  288  7e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1906  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  32.71 
 
 
2194 aa  285  4e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4998  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  35.59 
 
 
1800 aa  281  7e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.329522  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4498  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  34.22 
 
 
1225 aa  259  3e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0601  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  36.29 
 
 
1118 aa  243  2e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0657  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  39.45 
 
 
1113 aa  237  1e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0893942  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1367  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.09 
 
 
3396 aa  205  7e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.410312 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4367  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  35.99 
 
 
1269 aa  199  3e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4429  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  35.64 
 
 
1269 aa  196  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.332356 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3855  hemolysin-type calcium-binding protein  30.94 
 
 
1029 aa  193  2e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.460711  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4185  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.76 
 
 
1029 aa  193  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.610735 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0279  cadherin domain/calx-beta domain-containing protein  28.68 
 
 
5899 aa  188  8e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3001  chitinase  31.38 
 
 
2310 aa  175  6e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426725  normal  0.0460481 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3495  S-layer domain protein  32.32 
 
 
935 aa  174  9e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0139036  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4725  polymorphic membrane protein  40.62 
 
 
1037 aa  170  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.708929  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1594  5'-nucleotidase/2' 3'-cyclic phosphodiesterase and related esterases-like protein  45.36 
 
 
733 aa  168  7e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0599  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  34.65 
 
 
1012 aa  168  8e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0387425  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5094  conserved repeat domain protein  28.98 
 
 
4013 aa  166  3e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1773  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  37 
 
 
889 aa  164  2e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.403539  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3936  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  34.43 
 
 
1009 aa  162  4e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00889284  hitchhiker  0.000639264 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3505  chitinase, cellulase  29.7 
 
 
2305 aa  160  3e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0820772 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1307  cellulosome anchoring protein, cohesin region  31.19 
 
 
631 aa  157  2e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0666  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  37.44 
 
 
891 aa  137  1e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3099  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.04 
 
 
1016 aa  134  1e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0100  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  37.12 
 
 
928 aa  130  3e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3185  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  36.33 
 
 
768 aa  127  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  36.51 
 
 
6885 aa  126  4e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0188  hypothetical protein  32.63 
 
 
756 aa  124  2e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0298  hypothetical protein  38.58 
 
 
1457 aa  122  4e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00924887  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0608  S-layer domain protein  30.66 
 
 
547 aa  121  9e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.453799  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2320  glycoside hydrolase family 10  43.15 
 
 
1050 aa  121  1e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1963  S-layer domain protein  34.62 
 
 
1009 aa  120  2e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  4.81253e-06  normal  0.0221131 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1781  alpha amylase, catalytic region  28.05 
 
 
1847 aa  120  2e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0993  Carbohydrate-binding family 9  29.23 
 
 
2286 aa  119  4e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.938361  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1714  S-layer domain-containing protein  32.62 
 
 
573 aa  118  8e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3478  S-layer domain protein  41.62 
 
 
548 aa  118  1e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1982  S-layer domain protein  37.5 
 
 
506 aa  115  5e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.192953  normal  0.0752938 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3240  protein of unknown function DUF291  36.46 
 
 
2073 aa  115  6e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3484  Ig domain protein group 2 domain protein  34.76 
 
 
526 aa  114  2e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2998  S-layer domain-containing protein  31.52 
 
 
926 aa  114  2e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0141  hypothetical protein  40.11 
 
 
758 aa  113  3e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2506  S-layer-like domain-containing protein  35.16 
 
 
1013 aa  113  3e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3489  S-layer domain protein  33.52 
 
 
506 aa  110  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.662384  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0054  hypothetical protein  34.07 
 
 
729 aa  109  4e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  8.0624e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3091  Ig family protein  32.37 
 
 
618 aa  109  4e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0189  hypothetical protein  29.9 
 
 
548 aa  108  7e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3247  sugar-binding domain protein  32.46 
 
 
2375 aa  108  8e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0077  S-layer domain protein  37.14 
 
 
1710 aa  108  9e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3019  S-layer domain protein  33.51 
 
 
609 aa  107  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1963  hypothetical protein  35.71 
 
 
518 aa  107  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1459  Ig-like, group 2  29.17 
 
 
932 aa  106  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2108  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30 
 
 
995 aa  105  5e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.557195  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2341  hypothetical protein  31.52 
 
 
554 aa  105  9e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.920789 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1991  hypothetical protein  36.07 
 
 
625 aa  104  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.897372  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1505  S-layer-like domain-containing protein  33.71 
 
 
223 aa  103  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0779  S-layer domain-containing protein  33.87 
 
 
693 aa  104  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.725533  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.09 
 
 
1029 aa  104  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3498  S-layer domain protein  30.71 
 
 
457 aa  103  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0436  S-layer domain protein  32.04 
 
 
1226 aa  103  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  3.13752e-05 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1547  S-layer domain protein  31.44 
 
 
3320 aa  103  4e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  35.33 
 
 
1821 aa  103  4e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02371  hypothetical protein  28 
 
 
2127 aa  102  7e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2008  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  33.58 
 
 
3168 aa  102  8e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2681  S-layer domain protein  32.61 
 
 
1208 aa  101  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4824  Beta-Ig-H3/fasciclin  32.42 
 
 
558 aa  100  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.597464  normal  0.196528 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1798  hypothetical protein  35.75 
 
 
218 aa  100  3e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.351482  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003407  putative calcium-binding outer membrane-like protein  24.81 
 
 
2042 aa  99  8e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1967  hypothetical protein  34.81 
 
 
1194 aa  99  8e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2454  fibronectin, type III  35.26 
 
 
1042 aa  98.2  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0274  S-layer domain protein  35.63 
 
 
779 aa  97.1  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.430281  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  26.08 
 
 
4848 aa  97.4  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0714  Ig domain-containing protein  32.35 
 
 
807 aa  97.1  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000270996  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1827  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.23 
 
 
1054 aa  97.1  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.426628  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1368  S-layer-like domain-containing protein  32.02 
 
 
710 aa  93.2  4e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  4.86639e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0559  S-layer domain protein  27.5 
 
 
1168 aa  92  8e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0056  Ig-like, group 2  30.22 
 
 
4630 aa  92  8e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2364  S-layer domain protein  31.32 
 
 
1421 aa  92  9e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00153299  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2999  S-layer domain-containing protein  33.15 
 
 
524 aa  92  9e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3135  hypothetical protein  29.26 
 
 
624 aa  91.3  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.189969  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2434  cell wall/surface repeat protein  24.87 
 
 
2207 aa  91.3  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0422  cell wall/surface repeat protein  32.61 
 
 
1729 aa  91.3  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00920532  hitchhiker  6.07429e-05 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2809  glycoside hydrolase family protein  29.38 
 
 
1321 aa  90.9  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.149168  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2680  S-layer domain-containing protein  25.6 
 
 
1174 aa  90.5  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0632  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.33 
 
 
1415 aa  89.4  5e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0317  hypothetical protein  30.6 
 
 
820 aa  89.4  5e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0705809  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2734  S-layer domain-containing protein  30.77 
 
 
413 aa  89.4  5e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.115763  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3178  hypothetical protein  30.05 
 
 
552 aa  89.4  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.925927  normal  0.121635 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2877  S-layer-like domain-containing protein  33.15 
 
 
585 aa  87.8  1e-15  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3446  S-layer domain-containing protein  29.78 
 
 
876 aa  87  3e-15  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4228  hypothetical protein  29.05 
 
 
693 aa  86.7  3e-15  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0789  S-layer protein  34.08 
 
 
880 aa  86.7  3e-15  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.229168  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0428  glycoside hydrolase family 5  33.56 
 
 
930 aa  87  3e-15  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3582  S-layer domain protein  27.14 
 
 
921 aa  86.3  5e-15  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  1.37339e-06  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1718  S-layer region-like  28.73 
 
 
414 aa  86.3  5e-15  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3986  S-layer domain protein  28.98 
 
 
920 aa  85.9  7e-15  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00445864 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1064  crystal protein  31.4 
 
 
822 aa  85.9  7e-15  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  5.77462e-06  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>