More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2453 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_2453  histidine kinase  100 
 
 
612 aa  1262  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  4.29093e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2056  putative sensor with HAMP domain  31.59 
 
 
587 aa  313  7e-84  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3212  histidine kinase internal region  27.02 
 
 
596 aa  192  1e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0148  putative sensor with HAMP domain  25.88 
 
 
594 aa  184  5e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2551  signal transduction histidine kinase, LytS  27.95 
 
 
600 aa  183  8e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0852  putative sensor with HAMP domain  34.4 
 
 
610 aa  181  4e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2008  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.97 
 
 
585 aa  162  2e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2345  sensor histidine kinase  32.44 
 
 
578 aa  160  6e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0123193  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3248  putative sensor with HAMP domain  32.91 
 
 
600 aa  159  1e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2057  sensor histidine kinase  32.99 
 
 
578 aa  159  1e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0772  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.76 
 
 
640 aa  155  2e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  7.85951e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0495  histidine kinase internal region  37.31 
 
 
604 aa  154  5e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19850  histidine kinase internal region  35.87 
 
 
595 aa  154  6e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0223  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.18 
 
 
502 aa  153  8e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0103  signal transduction histidine kinase, LytS  31.27 
 
 
495 aa  150  6e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3406  histidine kinase internal region  23.34 
 
 
603 aa  149  2e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.264135  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0398  histidine kinase internal region  25.22 
 
 
567 aa  147  4e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2114  putative sensor with HAMP domain  24.45 
 
 
627 aa  145  1e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.28006  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1959  histidine kinase  38.6 
 
 
414 aa  146  1e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4590  putative sensor with HAMP domain  33.81 
 
 
577 aa  145  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2719  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.95 
 
 
576 aa  144  3e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3886  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.67 
 
 
580 aa  142  2e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  3.03887e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1227  histidine kinase  31.79 
 
 
488 aa  140  5e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2122  histidine kinase internal region  32.92 
 
 
516 aa  140  6e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190674  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0526  histidine kinase internal region  24.68 
 
 
594 aa  140  6e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  2.53378e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1137  putative sensor with HAMP domain  34.93 
 
 
597 aa  139  2e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0599  putative sensor with HAMP domain  25.49 
 
 
623 aa  139  2e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.396658  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3281  signal transduction histidine kinase, LytS  35.94 
 
 
335 aa  139  2e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1171  sensor histidine kinase  37.86 
 
 
410 aa  137  4e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.400646  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1002  sensor histidine kinase  38.35 
 
 
410 aa  137  5e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2171  ATP-binding region, ATPase-like  40.47 
 
 
455 aa  135  2e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  3.46246e-08  normal  0.0306612 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3774  signal transduction histidine kinase, LytS  36.89 
 
 
446 aa  132  1e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.469079  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2114  histidine kinase  33.33 
 
 
607 aa  132  2e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.156393  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0994  putative sensor with HAMP domain  27.76 
 
 
603 aa  132  2e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3306  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.24 
 
 
483 aa  131  3e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3263  histidine kinase internal region  35.16 
 
 
397 aa  130  5e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1646  putative sensor with HAMP domain  27.11 
 
 
617 aa  130  5e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.177984  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1112  sensor histidine kinase  25.05 
 
 
574 aa  130  6e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0193784  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1762  signal transduction histidine kinase, LytS  36.74 
 
 
465 aa  130  8e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.513767  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1965  histidine kinase internal region  34.69 
 
 
576 aa  130  9e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10410  signal transduction histidine kinase, LytS  40.36 
 
 
578 aa  129  1e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.4237e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1585  signal transduction histidine kinase, LytS  32.33 
 
 
574 aa  129  1e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1339  signal transduction histidine kinase, LytS  31.56 
 
 
426 aa  129  1e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2398  signal transduction histidine kinase, LytS  37.8 
 
 
568 aa  128  3e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0899  signal transduction histidine kinase, LytS  35.77 
 
 
572 aa  128  3e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.144133  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0578  histidine kinase internal region  30.82 
 
 
604 aa  127  7e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0292  signal transduction histidine kinase, LytS  33.03 
 
 
506 aa  127  8e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2698  histidine kinase internal region  34.55 
 
 
576 aa  127  8e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3543  signal transduction histidine kinase, LytS  36.54 
 
 
403 aa  127  8e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00838652  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0554  sensor histidine kinase  30.22 
 
 
583 aa  127  9e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0945  histidine kinase  34.19 
 
 
600 aa  126  9e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0863  histidine kinase internal region  29.77 
 
 
599 aa  125  2e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0538  sensor histidine kinase  30.22 
 
 
583 aa  124  4e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1983  putative sensor with HAMP domain  30.63 
 
 
597 aa  124  7e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.24245  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2252  histidine kinase internal region  31.64 
 
 
569 aa  123  1e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4086  signal transduction histidine kinase, LytS  33.97 
 
 
412 aa  123  1e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0199  putative sensor with HAMP domain  23.4 
 
 
589 aa  120  5e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0468  signal transduction histidine kinase, LytS  35.56 
 
 
450 aa  120  7e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1582  signal transduction histidine kinase, LytS  27.88 
 
 
498 aa  120  8e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0045193  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2355  signal transduction histidine kinase, LytS  37.32 
 
 
580 aa  119  1e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.461368  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0069  signal transduction histidine kinase, LytS  32.51 
 
 
400 aa  118  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0746502  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2134  signal transduction histidine kinase LytS  33.96 
 
 
394 aa  118  4e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.775402  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2919  signal transduction histidine kinase, LytS  35.96 
 
 
565 aa  117  7e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.125544 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1394  signal transduction histidine kinase, LytS  33.18 
 
 
393 aa  116  1e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.64266e-11 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2140  histidine kinase internal region  27.78 
 
 
564 aa  116  1e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3292  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.22 
 
 
388 aa  115  2e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.210554  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4032  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.17 
 
 
446 aa  115  2e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0162124  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3612  sensor histidine kinase  35.87 
 
 
559 aa  115  3e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.857731 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2749  sensor histidine kinase  35.87 
 
 
559 aa  115  3e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02290  predicted sensory kinase in two-component system with YpdB  35.87 
 
 
565 aa  115  3e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02251  hypothetical protein  35.87 
 
 
565 aa  115  3e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2517  sensor histidine kinase  35.87 
 
 
559 aa  115  3e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2532  sensor histidine kinase  35.87 
 
 
559 aa  115  3e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1225  signal transduction histidine kinase, LytS  31.93 
 
 
603 aa  115  3e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.247489 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1289  signal transduction histidine kinase, LytS  35.87 
 
 
559 aa  115  3e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2670  sensor histidine kinase  35.87 
 
 
559 aa  115  3e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1277  signal transduction histidine kinase, LytS  35.87 
 
 
565 aa  115  3e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1178  histidine kinase internal region  31 
 
 
414 aa  114  6e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1324  signal transduction histidine kinase, LytS  33.59 
 
 
433 aa  113  8e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0634382  hitchhiker  0.00226936 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0068  signal transduction histidine kinase, LytS  29.52 
 
 
366 aa  113  1e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.361346  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5281  signal transduction histidine kinase, LytS  27.99 
 
 
391 aa  113  1e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.119621  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6326  signal transduction histidine kinase, LytS  32.74 
 
 
398 aa  112  2e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.521722 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01910  Autolysin sensor kinase  33.01 
 
 
729 aa  112  2e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.665726  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0054  signal transduction histidine kinase, LytS  33.94 
 
 
557 aa  112  2e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0054  signal transduction histidine kinase, LytS  33.49 
 
 
557 aa  112  3e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0736236  hitchhiker  0.000664675 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0056  signal transduction histidine kinase, LytS  33.49 
 
 
557 aa  112  3e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0698199  decreased coverage  1.26428e-07 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4300  signal transduction histidine kinase, LytS  33.94 
 
 
557 aa  111  4e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0131803  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2761  signal transduction histidine kinase, LytS  29.76 
 
 
394 aa  111  4e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175049  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0058  signal transduction histidine kinase, LytS  33.94 
 
 
557 aa  111  4e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0059  signal transduction histidine kinase, LytS  33.94 
 
 
557 aa  111  4e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.996795  hitchhiker  0.000632462 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1721  histidine kinase internal region  28.78 
 
 
573 aa  110  5e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00390  putative regulator of cell autolysis  36.45 
 
 
431 aa  110  5e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.848872  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2792  signal transduction histidine kinase, LytS  32.14 
 
 
564 aa  110  6e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  2.75265e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3378  signal transduction histidine kinase, LytS  32.23 
 
 
394 aa  110  6e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1250  signal transduction histidine kinase, LytS  29.84 
 
 
574 aa  110  6e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.888178  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2372  histidine kinase internal region  28.86 
 
 
595 aa  109  1e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1376  signal transduction histidine kinase, LytS  33.18 
 
 
405 aa  109  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3404  signal transduction histidine kinase, LytS  35.1 
 
 
563 aa  110  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.823402  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2170  signal transduction histidine kinase, LytS  35.12 
 
 
581 aa  109  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.041747  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1861  signal transduction histidine kinase, LytS  33.48 
 
 
389 aa  109  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.923195  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>