More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2444 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_2444  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 
396 aa  764    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00360852  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0227  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  44.95 
 
 
399 aa  281  1e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423497  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3439  sodium/hydrogen exchanger  40 
 
 
445 aa  255  1.0000000000000001e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0227  Na/H antiporter (napA)  43.43 
 
 
399 aa  255  1.0000000000000001e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.751994  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0667  potassium efflux system protein  39.58 
 
 
375 aa  241  2e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4462  germination protein gerN  39.58 
 
 
375 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.765663 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0780  germination protein gerN  39.58 
 
 
375 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0729  Na+/H+ antiporter (NapA)  39.58 
 
 
375 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0873  germination protein gerN  39.58 
 
 
375 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1320  sodium/hydrogen exchanger  38.3 
 
 
382 aa  239  5.999999999999999e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0819  germination protein gern  39.58 
 
 
375 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0915  germination protein gerN  39.58 
 
 
375 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42795e-41 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0729  potassium efflux system protein  39.31 
 
 
375 aa  238  1e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3669  germination protein gerN  36.36 
 
 
387 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000427463  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1965  sodium/hydrogen exchanger family protein  35.47 
 
 
418 aa  234  3e-60  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00243073  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1332  potassium efflux system protein  37.69 
 
 
385 aa  234  3e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1675  germination protein gerN  36.67 
 
 
387 aa  233  5e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000302392  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1729  germination protein gerN  36.41 
 
 
387 aa  232  1e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1493  Na+/H+ exchanger family protein  36.67 
 
 
387 aa  231  1e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000735632  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1706  germination protein gerN  36.67 
 
 
387 aa  231  1e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1483  Na+/H+ exchanger family protein  36.41 
 
 
387 aa  231  1e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000497564  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1780  germination protein gerN  36.41 
 
 
387 aa  231  1e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00295662  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1521  germination protein gerN  36.67 
 
 
387 aa  231  2e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000601236  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1639  germination protein gern  36.67 
 
 
387 aa  231  2e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481694  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1526  potassium efflux system protein  35.9 
 
 
387 aa  230  3e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.848534  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0910  germination protein gerN  39.58 
 
 
375 aa  228  1e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0984  germination protein gerN  39.58 
 
 
375 aa  228  1e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0715  Na+/H+ antiporter (NapA)  39.58 
 
 
375 aa  228  2e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1827  Kef-type K+ transport system, membrane component  37.11 
 
 
386 aa  227  3e-58  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2265  sodium/hydrogen exchanger  35.31 
 
 
400 aa  226  6e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000115576 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1782  sodium/hydrogen exchanger  36.5 
 
 
389 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4248  sodium/hydrogen exchanger  38.38 
 
 
412 aa  217  2.9999999999999998e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.646884  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0964  Na+/H+ exchanger family protein  37.6 
 
 
375 aa  207  4e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000622449  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2186  Na+/H+ antiporter  35.53 
 
 
379 aa  203  4e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0326583  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0200  sodium/hydrogen exchanger  33.51 
 
 
389 aa  202  8e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0769976  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0581  sodium/hydrogen exchanger  32.35 
 
 
416 aa  192  9e-48  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0841  sodium/hydrogen exchanger  33.51 
 
 
399 aa  187  3e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.278715 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1557  sodium/hydrogen exchanger  33.17 
 
 
404 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00176225  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0655  sodium/hydrogen exchanger  32.55 
 
 
424 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_628  Kef-type K+ transport systems membrane component  32.48 
 
 
424 aa  184  3e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0722  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.71 
 
 
427 aa  183  4.0000000000000006e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.313467  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0764  sodium/hydrogen exchanger  34.11 
 
 
395 aa  177  4e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00200926  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1633  hypothetical protein  32.33 
 
 
423 aa  176  9e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0120  sodium/hydrogen exchanger  34.51 
 
 
385 aa  174  1.9999999999999998e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1355  Kef-type K+ transport system, membrane component  31.79 
 
 
352 aa  174  2.9999999999999996e-42  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.495043  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0706  sodium/hydrogen exchanger  33.75 
 
 
404 aa  172  1e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.584868  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0255  sodium/hydrogen exchanger  30.79 
 
 
398 aa  169  7e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.79751  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3029  Sodium/hydrogen exchanger  32.05 
 
 
453 aa  167  4e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.75325  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1868  sodium/hydrogen exchanger  31.86 
 
 
469 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1631  sodium/hydrogen exchanger  31.28 
 
 
474 aa  165  1.0000000000000001e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.599529 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0593  sodium/hydrogen exchanger  31.04 
 
 
467 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0608  sodium/hydrogen exchanger  31.04 
 
 
467 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.365139  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1099  sodium/hydrogen exchanger  32.17 
 
 
392 aa  161  2e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0109  sodium/hydrogen exchanger  34.91 
 
 
388 aa  158  2e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.254018 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2594  sodium/hydrogen exchanger  32.29 
 
 
491 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.131358  normal  0.15214 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0847  sodium/hydrogen exchanger  31.58 
 
 
392 aa  157  4e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.461656  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4724  sodium/hydrogen exchanger  32.04 
 
 
473 aa  156  6e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.934987 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0669  sodium/hydrogen exchanger  33.75 
 
 
388 aa  156  7e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1792  sodium/hydrogen exchanger  34.41 
 
 
388 aa  156  8e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.906777  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1576  sodium/hydrogen exchanger  31.08 
 
 
392 aa  155  1e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.000000405712  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0056  sodium/hydrogen exchanger  31.2 
 
 
388 aa  153  5e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0601402  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2633  Na(+)/H(+) antiporter  29.95 
 
 
414 aa  151  2e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3964  sodium/hydrogen exchanger  31 
 
 
402 aa  149  8e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0770173  normal  0.0859803 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3950  sodium/hydrogen exchanger  29.15 
 
 
414 aa  143  6e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.387419 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1282  sodium/hydrogen exchanger  28.61 
 
 
406 aa  143  6e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1464  Sodium/hydrogen exchanger  33.98 
 
 
485 aa  142  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000329156  hitchhiker  0.00284815 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0433  sodium/hydrogen exchanger  30.23 
 
 
387 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.129504  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3726  sodium/hydrogen exchanger  32.49 
 
 
413 aa  139  8.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3462  sodium/hydrogen exchanger  29.44 
 
 
750 aa  137  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0330875 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3809  sodium/hydrogen exchanger  30.08 
 
 
413 aa  137  4e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.397158  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3217  sodium/hydrogen exchanger  28.23 
 
 
397 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5263  sodium/hydrogen exchanger  29.61 
 
 
586 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.680967  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5355  sodium/hydrogen exchanger  29.61 
 
 
586 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.547992 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5648  Sodium/hydrogen exchanger  29.06 
 
 
587 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00653645 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0839  hypothetical protein  29.97 
 
 
479 aa  134  3e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0578  sodium/hydrogen exchanger  29.06 
 
 
756 aa  134  3e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3668  Sodium/hydrogen exchanger  31.11 
 
 
415 aa  134  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2359  Na+/H+ antiporter  30.48 
 
 
460 aa  133  5e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.484387  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5404  sodium/hydrogen exchanger  29.61 
 
 
586 aa  133  5e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.115045 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0606  sodium/hydrogen exchanger  28.26 
 
 
414 aa  132  9e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1799  sodium/hydrogen exchanger  30.18 
 
 
462 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5133  sodium/hydrogen exchanger  29.06 
 
 
586 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.322747 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0868  hypothetical protein  29.69 
 
 
479 aa  131  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6330  putative sodium/proton antiporter  28.27 
 
 
585 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5068  sodium/hydrogen exchanger family protein  28.27 
 
 
587 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5519  sodium/hydrogen exchanger family protein  28.53 
 
 
587 aa  129  6e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01670  potassium:hydrogen antiporter, putative  29.61 
 
 
951 aa  129  6e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0153  CPA2 family Na+/H+ antiporter  30.98 
 
 
458 aa  129  1.0000000000000001e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.430918  normal  0.17839 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1937  sodium/hydrogen exchanger  28.9 
 
 
412 aa  129  1.0000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1695  sodium/hydrogen exchanger  27.2 
 
 
390 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000892043  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72940  putative sodium/proton antiporter  28.27 
 
 
585 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0960  Sodium/hydrogen exchanger  30.2 
 
 
425 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.848142  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0325  sodium/hydrogen exchanger  28.28 
 
 
398 aa  127  3e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1281  sodium/hydrogen exchanger  26.84 
 
 
460 aa  127  5e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.345739  normal  0.428465 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0863  sodium/hydrogen exchanger  30.44 
 
 
513 aa  125  1e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0750424  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0821  Na+/H+ antiporter  27.01 
 
 
741 aa  125  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0612935  normal  0.436267 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1178  putative potassium efflux transporter  26.76 
 
 
650 aa  125  1e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3520  Na+/H+-exchanging protein (Na+/H+ antiporter)  28.5 
 
 
764 aa  123  5e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0454  Na+/H+ antiporter  28.92 
 
 
701 aa  122  8e-27  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.809076  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20501  CPA2 family Na+/H+ antiporter  29.02 
 
 
457 aa  122  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0786073  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>