100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2442 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_2442  cellulosome protein dockerin type I  100 
 
 
870 aa  1794  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  1.50479e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4177  glycoside hydrolase family protein  32.14 
 
 
1332 aa  104  6e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2965  PKD domain-containing protein  37.02 
 
 
1029 aa  104  7e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.651624  normal  0.0385802 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0356  hypothetical protein  30.77 
 
 
1011 aa  97.4  9e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.161093  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4783  hypothetical protein  33.54 
 
 
701 aa  90.5  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.292143  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4789  hypothetical protein  33.33 
 
 
710 aa  85.1  5e-15  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.148662  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2327  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  30.73 
 
 
12684 aa  84  1e-14  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.614505 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0253  hypothetical protein  33.33 
 
 
885 aa  83.2  2e-14  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274245  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2675  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  30.1 
 
 
834 aa  81.3  8e-14  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.343316 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2396  Fibronectin type III domain protein  24 
 
 
1050 aa  79.7  2e-13  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2491  Fibronectin type III domain protein  29.28 
 
 
566 aa  79.3  3e-13  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2394  Fibronectin type III domain protein  29.89 
 
 
580 aa  78.6  4e-13  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.374405  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1607  hypothetical protein  30.64 
 
 
826 aa  78.2  5e-13  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0443973  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0435  cellulosome enzyme, dockerin type I  44.87 
 
 
350 aa  77.8  8e-13  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0779  periplasmic copper-binding protein  25.3 
 
 
1332 aa  73.6  2e-11  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.195346  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1398  cellulosome enzyme, dockerin type I  48.57 
 
 
842 aa  71.2  8e-11  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.461235  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2395  lipolytic protein G-D-S-L family  45.59 
 
 
311 aa  68.9  4e-10  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00016801  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0134  Fibronectin type III domain protein  23.49 
 
 
1628 aa  67.4  1e-09  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.504623  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0626  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.22 
 
 
669 aa  66.2  2e-09  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.142173  normal  0.0665505 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2399  hypothetical protein  33.57 
 
 
1406 aa  65.1  6e-09  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1656  Carbohydrate binding family 6  50 
 
 
951 aa  65.1  6e-09  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00148801  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0931  glycoside hydrolase family 10  42.03 
 
 
423 aa  63.5  1e-08  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.514764  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1209  Fibronectin type III domain protein  25.08 
 
 
1242 aa  63.2  2e-08  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1235  Carbohydrate binding family 6  47.62 
 
 
509 aa  63.2  2e-08  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00440741  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1597  glycoside hydrolase clan GH-D  44.93 
 
 
471 aa  62.4  3e-08  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.312648  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1231  Carbohydrate binding family 6  41.18 
 
 
524 aa  62.8  3e-08  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0177163  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1232  Carbohydrate binding family 6  49.21 
 
 
490 aa  62.4  3e-08  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.122742  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3141  lipolytic enzyme, G-D-S-L  42.86 
 
 
831 aa  60.5  1e-07  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1229  Carbohydrate binding family 6  36.17 
 
 
535 aa  60.1  2e-07  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.166566  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2137  cellulosome enzyme, dockerin type I  42.03 
 
 
790 aa  59.3  3e-07  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0574  peptidase C1A papain  24.11 
 
 
487 aa  59.3  3e-07  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.17095 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2123  glycosyl hydrolase 53 domain protein  45.57 
 
 
425 aa  59.3  3e-07  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.052262  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1773  hypothetical protein  25.23 
 
 
718 aa  58.9  4e-07  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00222697 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0649  cellulosome protein dockerin type I  42.65 
 
 
532 aa  58.2  7e-07  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4160  glycoside hydrolase family 18  35.77 
 
 
762 aa  57.8  8e-07  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.299546 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2229  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.41 
 
 
659 aa  57.8  8e-07  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.167752  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0258  cellulosome enzyme, dockerin type I  44.44 
 
 
469 aa  57  1e-06  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  5.67445e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2761  glycoside hydrolase family protein  38.57 
 
 
707 aa  56.2  2e-06  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  2.61631e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5648  hypothetical protein  26.62 
 
 
518 aa  55.8  4e-06  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2228  putative PAS/PAC sensor protein  24.14 
 
 
652 aa  55.5  5e-06  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0829706  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2398  Carbohydrate binding family 6  34.41 
 
 
1004 aa  54.7  8e-06  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0137535  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0660  glycoside hydrolase family protein  45 
 
 
773 aa  54.3  1e-05  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0249  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  25.42 
 
 
497 aa  53.9  1e-05  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2394  Fibronectin type III domain protein  36.08 
 
 
651 aa  52.8  2e-05  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.253992  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1900  hypothetical protein  27.78 
 
 
504 aa  53.5  2e-05  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0528132 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1628  peptidase C1A papain  21.46 
 
 
820 aa  53.1  2e-05  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.305041 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0797  glycoside hydrolase family protein  40.58 
 
 
814 aa  52.8  3e-05  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2806  WD40 domain protein beta Propeller  21.38 
 
 
509 aa  52.8  3e-05  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2318  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.82 
 
 
671 aa  51.6  6e-05  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.202041  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6485  peptidase C1A papain  20.14 
 
 
494 aa  51.6  6e-05  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1298  glycoside hydrolase family 8  42.62 
 
 
477 aa  51.6  7e-05  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  4.71564e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1400  glycosyl hydrolase 53  38.81 
 
 
415 aa  51.6  7e-05  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.195161  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2509  hypothetical protein  47.17 
 
 
364 aa  51.6  7e-05  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3012  carbohydrate-binding family 6 protein  38.46 
 
 
630 aa  51.2  8e-05  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2639  hypothetical protein  47.17 
 
 
364 aa  51.2  9e-05  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0373  coagulation factor 5/8 type domain protein  25.64 
 
 
795 aa  51.2  9e-05  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.634884  normal  0.96557 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0640  cellulosome enzyme, dockerin type I  41.18 
 
 
582 aa  50.4  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2147  glycoside hydrolase family protein  38.24 
 
 
660 aa  50.1  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2271  cellulosome enzyme, dockerin type I  46.15 
 
 
178 aa  50.4  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00813708  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0918  cellulosome enzyme, dockerin type I  36.19 
 
 
1209 aa  49.7  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.447129  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0270  glycoside hydrolase family protein  34.33 
 
 
484 aa  49.3  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3362  hypothetical protein  28.03 
 
 
770 aa  49.3  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.142309  normal  0.0931446 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0417  cellulosome protein dockerin type I  38.81 
 
 
848 aa  49.3  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000135998  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5875  hypothetical protein  29.7 
 
 
543 aa  49.7  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.191888 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0644  periplasmic copper-binding  30.95 
 
 
1092 aa  49.3  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.167347  normal  0.0259302 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  32.08 
 
 
6885 aa  48.5  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0617  glycoside hydrolase family protein  31.76 
 
 
1121 aa  48.5  0.0005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413787  hitchhiker  0.00805779 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0661  Ricin B lectin  36.51 
 
 
571 aa  48.1  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1648  glycoside hydrolase family 9  36.17 
 
 
949 aa  47.8  0.0008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.230883  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2466  fibronectin type III domain-containing protein  28.57 
 
 
1887 aa  47.8  0.0009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401987  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1838  glycoside hydrolase family protein  37.7 
 
 
619 aa  47.8  0.0009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.561717  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1913  hypothetical protein  24.7 
 
 
215 aa  47.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.909317  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2776  Fibronectin type III domain protein  30.53 
 
 
823 aa  47.4  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  4.81721e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  27.72 
 
 
809 aa  47.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4721  endonuclease I  32.47 
 
 
617 aa  47  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1655  cellulosome protein dockerin type I  38.46 
 
 
435 aa  47.8  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  3.88378e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4723  endonuclease I  25.51 
 
 
614 aa  47.4  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0578  glycoside hydrolase family protein  35.71 
 
 
736 aa  47.4  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0145  hypothetical protein  24.58 
 
 
712 aa  47.4  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0015  alpha-L-arabinofuranosidase B  36.23 
 
 
707 aa  46.6  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4253  fibronectin type III domain-containing protein  33.65 
 
 
680 aa  47  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2512  cellulose-binding family II protein  28.72 
 
 
637 aa  47  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02670  glycoside hydrolase family 16  32.65 
 
 
503 aa  45.8  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0239  cellulosome enzyme, dockerin type I  36.23 
 
 
1051 aa  46.2  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2675  hypothetical protein  23.38 
 
 
353 aa  46.2  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  28.74 
 
 
743 aa  45.8  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2139  alpha-L-arabinofuranosidase B  35.82 
 
 
982 aa  45.4  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3136  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.31 
 
 
375 aa  45.8  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2811  glycoside hydrolase family protein  35.29 
 
 
591 aa  45.8  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0274  glycoside hydrolase family protein  35.62 
 
 
563 aa  45.1  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00113767  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6088  peptidase C1A papain  25.84 
 
 
395 aa  45.4  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0625  glycoside hydrolase family protein  36.76 
 
 
710 aa  45.1  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2399  glycoside hydrolase family 9  33.72 
 
 
984 aa  45.1  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.466816  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7134  Chitinase-like protein  31.87 
 
 
662 aa  45.1  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0276  chitin-binding protein  27.96 
 
 
456 aa  44.7  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281673  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7591  Chitinase-like protein  29.81 
 
 
854 aa  44.7  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0192661  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0983  peptidase C1A papain  27.69 
 
 
305 aa  44.7  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0036  chitin-binding domain protein  31.96 
 
 
456 aa  44.7  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0067572  normal  0.0435633 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1701  glycoside hydrolase family protein  32.94 
 
 
1137 aa  44.7  0.008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102428 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0211  glycoside hydrolase family protein  39.68 
 
 
334 aa  44.3  0.01  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00263756  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>