More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2434 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_2434  agmatinase  100 
 
 
287 aa  593  1e-168  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0530  agmatinase  56.29 
 
 
285 aa  343  2e-93  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0516  agmatinase  56.29 
 
 
285 aa  343  2e-93  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3053  agmatinase  57.61 
 
 
284 aa  335  5.999999999999999e-91  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2793  agmatinase  53.6 
 
 
280 aa  314  9.999999999999999e-85  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5066  agmatinase (agmatine ureohydrolase)  48.91 
 
 
290 aa  276  4e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5218  agmatinase  48.91 
 
 
290 aa  275  6e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5050  agmatinase (agmatine ureohydrolase)  48.91 
 
 
290 aa  275  6e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5617  agmatinase  48.91 
 
 
290 aa  275  6e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5461  putative agmatinase  48.91 
 
 
290 aa  275  6e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5163  putative agmatinase  48.91 
 
 
290 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0178  agmatinase  48.01 
 
 
285 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000300631  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5498  agmatinase, putative  48.55 
 
 
290 aa  272  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5460  putative agmatinase  48.55 
 
 
290 aa  272  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5547  putative agmatinase  48.55 
 
 
290 aa  272  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0489  putative agmatinase  46.91 
 
 
288 aa  272  5.000000000000001e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000593846  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5491  putative agmatinase  48.55 
 
 
290 aa  272  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3883  putative agmatinase  47.46 
 
 
290 aa  270  2e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0695  agmatinase  45.39 
 
 
289 aa  268  1e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.109058  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3460  agmatinase  45.65 
 
 
291 aa  264  2e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3566  agmatinase  44.72 
 
 
287 aa  261  6.999999999999999e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3350  agmatinase  46.74 
 
 
294 aa  261  1e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00473387  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2793  agmatinase  45.82 
 
 
295 aa  254  1.0000000000000001e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.66818  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1315  agmatinase  43.84 
 
 
285 aa  247  1e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1581  putative agmatinase  45.13 
 
 
288 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0207  agmatinase  43.43 
 
 
290 aa  241  7.999999999999999e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.973687  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21591  arginase  42.09 
 
 
299 aa  238  1e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.703776 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1287  arginase family  41.88 
 
 
299 aa  234  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18171  arginase  40.89 
 
 
296 aa  233  3e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0669  hypothetical protein  42.34 
 
 
288 aa  232  4.0000000000000004e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.340442  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1779  arginase family  42.4 
 
 
293 aa  232  6e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.632137  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18771  arginase  40.34 
 
 
294 aa  231  7.000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.218611  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2591  agmatinase  39.13 
 
 
291 aa  231  8.000000000000001e-60  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.259439 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18961  arginase  41.32 
 
 
293 aa  231  1e-59  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1815  agmatinase  43.64 
 
 
296 aa  230  2e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000239855  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18771  arginase  41.07 
 
 
293 aa  229  3e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.993676  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2230  putative agmatinase  38.77 
 
 
287 aa  227  2e-58  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1824  agmatinase  43.66 
 
 
282 aa  224  1e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1085  agmatinase  42.86 
 
 
282 aa  224  1e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0832  putative agmatinase  42.5 
 
 
282 aa  221  9e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29511  arginase family  38.13 
 
 
304 aa  219  3e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1446  putative agmatinase  43.32 
 
 
279 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00618219  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0897  putative agmatinase  43.21 
 
 
283 aa  218  1e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1978  putative agmatinase  43.42 
 
 
250 aa  190  2e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000215726  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0694  agmatinase  34.63 
 
 
291 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.464925  normal  0.230846 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8153  agmatinase  35.19 
 
 
327 aa  170  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0004  agmatinase  36.01 
 
 
290 aa  166  2.9999999999999998e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1797  putative agmatinase  33.22 
 
 
319 aa  161  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.57797 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0939  agmatinase  34.52 
 
 
315 aa  161  1e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.220122 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0597  agmatinase, putative  33.33 
 
 
315 aa  160  2e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2295  agmatinase  31.91 
 
 
319 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2256  agmatinase  31.91 
 
 
319 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2303  agmatinase  31.91 
 
 
319 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.433444  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1457  agmatinase  32.86 
 
 
316 aa  160  3e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.284678  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4700  agmatinase  32.97 
 
 
318 aa  159  5e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0797  putative agmatinase  32.25 
 
 
337 aa  158  9e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0965  putative agmatinase  35.48 
 
 
283 aa  158  9e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.336082  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2241  agmatinase  33.09 
 
 
315 aa  158  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.014845  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5662  putative agmatinase  31.79 
 
 
326 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5283  agmatinase  31.79 
 
 
326 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5372  putative agmatinase  31.79 
 
 
326 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1619  putative agmatinase  34.18 
 
 
310 aa  157  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0140397 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0046  putative agmatinase  32.5 
 
 
321 aa  157  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.319664 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0058  agmatinase  33.58 
 
 
324 aa  156  3e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.741294  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46070  guanidinobutyrase  32.36 
 
 
319 aa  155  6e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.781131 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0509  putative agmatinase  34.05 
 
 
309 aa  155  6e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0425  agmatinase  35.13 
 
 
283 aa  155  7e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.509578 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3918  guanidinobutyrase  32.36 
 
 
319 aa  155  7e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0721  putative agmatinase  37.02 
 
 
307 aa  155  7e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1728  agmatinase  33.45 
 
 
318 aa  155  9e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.180213  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3382  agmatinase  33.45 
 
 
321 aa  155  9e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143421  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1417  agmatinase  32.97 
 
 
325 aa  154  1e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2950  agmatinase  34.28 
 
 
324 aa  154  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00201595  hitchhiker  0.00051665 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1877  Guanidinobutyrase  33.21 
 
 
320 aa  153  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0851  agmatinase  33.45 
 
 
378 aa  152  5e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2336  agmatinase  36.49 
 
 
287 aa  151  1e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.329379 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1896  agmatinase  32.85 
 
 
289 aa  151  1e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.436435  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6362  agmatinase  34.98 
 
 
324 aa  151  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.823573  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1388  putative agmatinase  32.17 
 
 
320 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.584775  normal  0.7008 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3815  agmatinase  32.17 
 
 
316 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0376134 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4523  agmatinase, putative  32.16 
 
 
320 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4029  agmatinase  32.16 
 
 
320 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.192086  normal  0.0901062 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5116  putative agmatinase  35.17 
 
 
322 aa  150  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.971195 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0273  agmatinase  35.36 
 
 
317 aa  150  3e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0967  agmatinase  32.4 
 
 
354 aa  150  3e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1433  putative agmatinase  34.17 
 
 
321 aa  150  3e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.946335  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0638  agmatinase  31.45 
 
 
330 aa  149  5e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1047  agmatinase  32.97 
 
 
315 aa  149  6e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2576  agmatinase  31.11 
 
 
319 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2787  agmatinase  31.52 
 
 
316 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3040  agmatinase  33.57 
 
 
313 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.301335  normal  0.166116 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3024  agmatinase  33.57 
 
 
313 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3083  agmatinase  33.57 
 
 
313 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.220565  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0161  putative agmatinase  32.63 
 
 
329 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2635  putative agmatinase  31.62 
 
 
315 aa  145  6e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5199  agmatinase  31.16 
 
 
316 aa  145  9e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1825  agmatinase  32.55 
 
 
365 aa  145  9e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.028899  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1872  agmatinase  32.55 
 
 
365 aa  145  9e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.548708  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4379  agmatinase  31.72 
 
 
322 aa  144  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.865355  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0897  putative agmatinase  39.46 
 
 
268 aa  144  2e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.322484  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>