More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2414 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  57.77 
 
 		 558 aa  652    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2414  type II secretion system protein E  100 
 
 		 564 aa  1147    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1884  type II secretion system protein E  53.72 
 
 		 570 aa  623  1e-177  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000626903  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1107  type II secretion system protein E  51.05 
 
 		 787 aa  588  1e-167  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0853  type II secretion system protein E  50.81 
 
 		 561 aa  572  1.0000000000000001e-162  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000472298  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2570  secretion system protein E  50.89 
 
 		 562 aa  562  1.0000000000000001e-159  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3555  type II secretion system protein E  46.77 
 
 		 573 aa  553  1e-156  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422315  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  50.27 
 
 		 558 aa  551  1e-156  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2272  secretion system protein E  50.62 
 
 		 563 aa  554  1e-156  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  45.8 
 
 		 553 aa  536  1e-151  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  47 
 
 		 553 aa  530  1e-149  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0888  type II secretion system protein E  48.22 
 
 		 553 aa  530  1e-149  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2103  type II secretion system protein E  48.07 
 
 		 571 aa  524  1e-147  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2562  type II secretion system protein E  48.03 
 
 		 555 aa  523  1e-147  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0968  type II secretion system protein E  46.52 
 
 		 561 aa  520  1e-146  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.197479  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  45.68 
 
 		 871 aa  506  9.999999999999999e-143  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  45.16 
 
 		 553 aa  507  9.999999999999999e-143  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0991  type II secretion system protein E  45.45 
 
 		 564 aa  499  1e-140  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1392  type II secretion system protein E  44.06 
 
 		 571 aa  495  1e-139  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.025124 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  44.72 
 
 		 571 aa  496  1e-139  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2682  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  43.74 
 
 		 568 aa  492  9.999999999999999e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1347  type II secretion system protein E  43.14 
 
 		 556 aa  490  1e-137  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1653  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  44 
 
 		 568 aa  490  1e-137  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  42.71 
 
 		 568 aa  487  1e-136  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0667  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  44.19 
 
 		 568 aa  487  1e-136  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0453527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0301  type II secretion system protein E  44.56 
 
 		 554 aa  484  1e-135  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1822  type II secretion system protein E  42.96 
 
 		 557 aa  484  1e-135  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0186286  normal  0.89431 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0622  type II secretion system protein E  44.01 
 
 		 568 aa  484  1e-135  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0685  type II secretion system protein E  42.28 
 
 		 599 aa  482  1e-135  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  44.11 
 
 		 568 aa  484  1e-135  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  44.29 
 
 		 568 aa  484  1e-135  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2149  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  42.53 
 
 		 566 aa  480  1e-134  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.365322  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  42.83 
 
 		 568 aa  481  1e-134  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0719  general secretory pathway protein E  42.23 
 
 		 599 aa  482  1e-134  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1631  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  43.21 
 
 		 568 aa  479  1e-134  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4828  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  43.85 
 
 		 563 aa  480  1e-134  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.436741 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1055  type II secretion system protein E  46.31 
 
 		 559 aa  481  1e-134  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0268645  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0720  general secretory pathway protein E  42.11 
 
 		 599 aa  481  1e-134  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17740  type II secretion system protein E (GspE)  42.33 
 
 		 557 aa  478  1e-133  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.898246 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2595  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  43.03 
 
 		 568 aa  476  1e-133  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0956  type II secretion system protein E  42.53 
 
 		 561 aa  472  1e-132  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2514  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  42.33 
 
 		 568 aa  473  1e-132  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.066963  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1996  type II secretion system protein E  41.56 
 
 		 567 aa  470  1.0000000000000001e-131  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1034  type II secretion system protein E  42.63 
 
 		 558 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0408  type II secretion system protein E  41.86 
 
 		 570 aa  469  1.0000000000000001e-131  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0042  type II secretion system protein E  41.91 
 
 		 568 aa  469  1.0000000000000001e-131  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0729  general secretory pathway protein E  41.45 
 
 		 603 aa  468  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.26973  normal  0.525639 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1168  type II secretion system protein E  43.82 
 
 		 561 aa  467  9.999999999999999e-131  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0682  general secretory pathway protein E  46.47 
 
 		 520 aa  464  1e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.980899  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3257  type II secretion system protein E  41.89 
 
 		 561 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0594  general secretory pathway protein E  45.21 
 
 		 520 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0608  general secretory pathway protein E  45.21 
 
 		 520 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000611826 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1028  type II secretion system protein E  41.96 
 
 		 568 aa  449  1e-125  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.328232 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3365  type II secretion system protein E  44.84 
 
 		 520 aa  449  1e-125  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.219755  normal  0.0138681 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1792  type II secretion system protein E  41.39 
 
 		 573 aa  445  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.608065 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0756  type II secretion system protein E  43.75 
 
 		 589 aa  444  1e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1731  type II secretion system protein E  41.77 
 
 		 561 aa  443  1e-123  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0239334 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4160  general secretory pathway protein E  42.01 
 
 		 578 aa  442  1e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895585 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1103  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  42.12 
 
 		 571 aa  442  1e-123  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.202418  decreased coverage  0.00743342 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0173  type II secretion system protein E  41.7 
 
 		 637 aa  443  1e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1022  type II secretion system protein E  44.64 
 
 		 554 aa  444  1e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00254  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshE (pilus type IV)  41.12 
 
 		 570 aa  444  1e-123  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1280  general secretory pathway protein E  43.65 
 
 		 521 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0752  pilus assembly pathway ATPase PilB  40.85 
 
 		 577 aa  439  9.999999999999999e-123  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.440841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1128  type II secretion system protein E  40.89 
 
 		 563 aa  440  9.999999999999999e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1156  type II secretion system protein E  40.82 
 
 		 591 aa  442  9.999999999999999e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0676561 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1166  type II secretion system protein E  39.6 
 
 		 572 aa  440  9.999999999999999e-123  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1408  type II secretion system protein E  38.23 
 
 		 577 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.22381  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0328  general secretion pathway protein E  45.97 
 
 		 514 aa  437  1e-121  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0426  type II secretion system protein E  41.31 
 
 		 577 aa  437  1e-121  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0285266  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2744  type II secretion system protein E  43.55 
 
 		 527 aa  436  1e-121  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.804654  normal  0.322952 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1114  general secretion pathway protein E  39.72 
 
 		 585 aa  432  1e-120  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0263  type II secretion system protein E  40.18 
 
 		 891 aa  435  1e-120  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.198237  normal  0.68743 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4189  type II secretion system protein E  40.56 
 
 		 557 aa  434  1e-120  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02837  hypothetical type II secretion protein GspE  44.63 
 
 		 497 aa  429  1e-119  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000237275  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3426  general secretory pathway protein E  44.31 
 
 		 497 aa  430  1e-119  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0949  type II secretion system protein E  41.14 
 
 		 885 aa  429  1e-119  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.14742  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02787  hypothetical protein  44.63 
 
 		 497 aa  429  1e-119  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000039107  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0879  type II secretion system protein E  41.22 
 
 		 569 aa  427  1e-118  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.13472 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0410  type II secretion system protein E  40.97 
 
 		 565 aa  428  1e-118  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.430305  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1138  type II secretory pathway, ATPase  42.77 
 
 		 582 aa  426  1e-118  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0594  type II secretion system protein E  40.07 
 
 		 888 aa  427  1e-118  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0229677 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2609  general secretory pathway protein E  39.62 
 
 		 610 aa  426  1e-118  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0938454  normal  0.754135 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0170  general secretion pathway protein E  43.57 
 
 		 520 aa  427  1e-118  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3246  general secretory pathway protein GspE  44.21 
 
 		 497 aa  427  1e-118  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.827332 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3765  type II secretion system protein E  40.63 
 
 		 577 aa  425  1e-117  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.238087  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1042  general secretory pathway protein E  42.27 
 
 		 570 aa  425  1e-117  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.90473  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3137  general secretory pathway protein E  44.1 
 
 		 497 aa  425  1e-117  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3357  type II secretion system protein E  39.53 
 
 		 595 aa  421  1e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.987223 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0457  MSHA biogenesis protein MshE  39.02 
 
 		 587 aa  419  1e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3407  type II secretion system protein E  39.82 
 
 		 568 aa  421  1e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1924  type II secretion system protein E  39.75 
 
 		 576 aa  418  9.999999999999999e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2089  general secretory pathway protein E  37.23 
 
 		 559 aa  416  9.999999999999999e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.86871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0547  ATPase, type IV pilus assembly protein PilB  38.76 
 
 		 565 aa  416  9.999999999999999e-116  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0904  type II secretion system protein E  43.02 
 
 		 595 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3271  type II secretion system protein E  43.17 
 
 		 574 aa  418  9.999999999999999e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1299  general secretory pathway protein E  40.6 
 
 		 575 aa  417  9.999999999999999e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0445374 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1571  type II secretion system protein E  39.18 
 
 		 587 aa  417  9.999999999999999e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00763489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0326  type II secretion system protein E  42.8 
 
 		 612 aa  418  9.999999999999999e-116  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.038954  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2895  type II secretion system protein E  38.01 
 
 		 580 aa  413  1e-114  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.847539  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>