92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2403 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_2403  PA14 domain protein  100 
 
 		 1172 aa  2402    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0316  PA14  39.56 
 
 		 644 aa  125  6e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.914268  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2778  PA14 domain protein  35.71 
 
 		 978 aa  119  5e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3065  PA14 domain-containing protein  30.73 
 
 		 14944 aa  111  9.000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1092  PA14 domain protein  40.56 
 
 		 613 aa  109  4e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2680  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  33.54 
 
 		 1206 aa  101  8e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.117789 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2448  PA14 domain protein  30.58 
 
 		 1141 aa  95.9  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1146  hypothetical protein  32.16 
 
 		 1504 aa  94.4  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0521  PA14 domain protein  32.39 
 
 		 841 aa  93.6  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.387199  hitchhiker  0.000185661 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4482  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  32.42 
 
 		 795 aa  92.4  5e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000203992  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0370  Galactose oxidase  26.73 
 
 		 918 aa  90.5  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03856  glucan 1,4-beta-glucosidase  31.54 
 
 		 904 aa  82.4  0.00000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3233  hypothetical protein  32.45 
 
 		 4465 aa  80.5  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.226873 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1543  cellulosome anchoring protein cohesin region  29.25 
 
 		 782 aa  79.3  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000430269  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0264  Fibronectin type III domain protein  28.42 
 
 		 480 aa  75.1  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.375315  normal  0.632573 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1687  PA14 domain-containing protein  29.41 
 
 		 584 aa  73.9  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000321103 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1268  PA14 domain-containing protein  27.72 
 
 		 578 aa  73.9  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.29777 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0134  Fibronectin type III domain protein  27.27 
 
 		 1628 aa  72.8  0.00000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.504623  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0648  Fibronectin type III domain protein  24.64 
 
 		 1795 aa  71.6  0.00000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.034686  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4643  OmpA/MotB domain protein  26.47 
 
 		 361 aa  71.6  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000815983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  33.33 
 
 		 6885 aa  71.2  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6292  PA14 domain protein  37.14 
 
 		 1314 aa  70.5  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.237878 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0642  Fibronectin type III domain protein  27.74 
 
 		 692 aa  68.9  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.022056  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0957  PA14 domain protein  28.96 
 
 		 3802 aa  68.6  0.0000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.168147 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1919  Chitinase-like protein  29.12 
 
 		 680 aa  67.4  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2042  glycoside hydrolase family 3 protein  27.44 
 
 		 886 aa  67  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.198368  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0327  Peptidase S53 propeptide  30.73 
 
 		 1199 aa  66.6  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0684029  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2675  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  34.71 
 
 		 834 aa  65.5  0.000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.343316 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2036  fibronectin, type III domain-containing protein  30.88 
 
 		 2068 aa  63.9  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.573808  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0948  YD repeat protein  24.1 
 
 		 2215 aa  64.3  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.784395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4289  glycoside hydrolase family 5  29.88 
 
 		 717 aa  64.3  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.162807  normal  0.0359435 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7155  Glucodextranase N  31.32 
 
 		 1160 aa  64.3  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0849564  normal  0.457795 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1100  FG-GAP repeat protein  27.55 
 
 		 1065 aa  62.8  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2485  Protein of unknown function DUF1588  22.63 
 
 		 778 aa  62.8  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.474006  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2193  carbohydrate-binding family 6 protein  32.03 
 
 		 948 aa  62.4  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.43679  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0962  Fibronectin type III domain protein  29.36 
 
 		 1363 aa  61.2  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04160  beta-1,3-glucanase  33.15 
 
 		 1067 aa  61.2  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2022  fibronectin, type III domain-containing protein  29.41 
 
 		 683 aa  60.1  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00638663  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0965  Fibronectin type III domain protein  28.7 
 
 		 1363 aa  60.5  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2467  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.7 
 
 		 1064 aa  60.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5990  Carbohydrate-binding CenC domain protein  29.21 
 
 		 648 aa  59.3  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.793128  normal  0.422272 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4791  PA14 domain protein  29.45 
 
 		 2252 aa  59.7  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.45455  normal  0.215304 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3050  fibronectin, type III  26.95 
 
 		 667 aa  57.8  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000157497  n/a   
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0019  PA14 domain protein  34.51 
 
 		 2392 aa  57  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000236303 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05360  fibronectin type 3 domain-containing protein  29.07 
 
 		 1880 aa  57  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0896  Fibronectin type III domain protein  26.69 
 
 		 804 aa  56.6  0.000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2185  fibronectin, type III  25.63 
 
 		 656 aa  56.2  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0292079  hitchhiker  0.000132126 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  29.88 
 
 		 3027 aa  55.5  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2750  YD repeat protein  23.94 
 
 		 2447 aa  55.1  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1621  PA14 domain-containing protein  28.18 
 
 		 654 aa  53.9  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.459309  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0912  fibronectin, type III/multicopper oxidase, type 2  28.27 
 
 		 1380 aa  53.9  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5537  Fibronectin type III domain protein  23.51 
 
 		 744 aa  53.9  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3704  PA14 domain protein  26.11 
 
 		 2334 aa  53.1  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.205023 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2155  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  28.79 
 
 		 649 aa  52.4  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000475992  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2969  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  28.04 
 
 		 558 aa  51.6  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00836901  hitchhiker  0.00161075 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4152  glycoside hydrolase family protein  25.66 
 
 		 831 aa  51.2  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.198899  normal  0.318604 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1314  Fibronectin type III domain protein  29.68 
 
 		 211 aa  50.1  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000146829  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2327  alpha amylase catalytic region  23.42 
 
 		 1401 aa  50.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.775797  normal  0.294215 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4335  alpha amylase catalytic region  36.67 
 
 		 1753 aa  50.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.167512  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0164  protective antigen  28.07 
 
 		 764 aa  49.7  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3668  fibronectin type III domain-containing protein  25.45 
 
 		 836 aa  50.1  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0068  fibronectin, type III domain-containing protein  26.15 
 
 		 1695 aa  48.9  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2278  alpha amylase catalytic region  37.5 
 
 		 1307 aa  48.9  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.792883  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1073  fibronectin type III domain-containing protein  25.68 
 
 		 9585 aa  48.9  0.0005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0017  fibronectin type III domain protein  24.66 
 
 		 207 aa  48.5  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.857049  normal  0.0757173 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04176  exoglucanase A  30 
 
 		 548 aa  48.5  0.0008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0198  YD repeat-containing protein  23.37 
 
 		 3333 aa  48.1  0.0009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00448474 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1569  helix-turn-helix, AraC type  29.71 
 
 		 1113 aa  47.4  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2986  PA14 domain-containing protein  28 
 
 		 1293 aa  47.8  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2469  fibronectin, type III  28.26 
 
 		 3507 aa  48.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2202  fibronectin type III domain-containing protein  29.63 
 
 		 841 aa  48.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.536559 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2346  chitin-binding domain-containing protein  28.02 
 
 		 458 aa  47  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.179071  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1917  Chitinase-like protein  28.39 
 
 		 613 aa  47  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4160  glycoside hydrolase family 18  28.64 
 
 		 762 aa  47.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.299546 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0431  Pectate lyase/Amb allergen  29.32 
 
 		 527 aa  47.4  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.471187  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0036  chitin-binding domain protein  30.69 
 
 		 456 aa  46.6  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0067572  normal  0.0435633 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3093  PA14 domain protein  25 
 
 		 569 aa  46.6  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2003  Fibronectin type III domain protein  25.75 
 
 		 725 aa  46.6  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.333921  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1812  penicillin-binding protein, 1A family  31.25 
 
 		 941 aa  46.6  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.022556  normal  0.0842954 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3221  glycoside hydrolase family protein  21.78 
 
 		 995 aa  46.6  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179721 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3077  cellulosome anchoring protein, cohesin region  28.45 
 
 		 1853 aa  46.6  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2666  glycosy hydrolase family protein  36.78 
 
 		 970 aa  46.6  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2454  fibronectin, type III  22.81 
 
 		 1042 aa  46.2  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2374  hypothetical protein  26.81 
 
 		 772 aa  46.2  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.447497  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0704  Fibronectin type III domain protein  35.48 
 
 		 718 aa  45.8  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6593  fibronectin type III domain-containing protein  25.93 
 
 		 428 aa  45.8  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1747  hypothetical protein  29.63 
 
 		 1139 aa  45.8  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000564232 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4253  fibronectin type III domain-containing protein  25.85 
 
 		 680 aa  45.8  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2065  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  30.25 
 
 		 506 aa  45.4  0.007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.140778  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2169  chitin-binding domain-containing protein  25.91 
 
 		 455 aa  45.1  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102093  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2417  Fibronectin type III domain protein  28.85 
 
 		 485 aa  44.7  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0276  chitin-binding protein  30.16 
 
 		 456 aa  44.7  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281673  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>