More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2379 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_2379  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 623 aa  1273    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0968  Radical SAM domain protein  41.01 
 
 		 630 aa  489  1e-137  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4198  radical SAM domain-containing protein  32.47 
 
 		 620 aa  355  1e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0178344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1133  radical SAM family protein  31.08 
 
 		 656 aa  314  3.9999999999999997e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0262562 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1626  Radical SAM domain protein  28.68 
 
 		 655 aa  297  4e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2292  radical SAM domain-containing protein  31.51 
 
 		 634 aa  288  2e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.727503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1863  radical SAM family protein  30.99 
 
 		 486 aa  285  2.0000000000000002e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.300057  normal  0.908691 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1684  radical SAM family protein  28.65 
 
 		 633 aa  266  8e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.198354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4968  Radical SAM domain protein  27.41 
 
 		 652 aa  239  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0095  radical SAM domain-containing protein  28.95 
 
 		 651 aa  228  2e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0641109 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1707  radical SAM domain-containing protein  23.79 
 
 		 646 aa  172  2e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1705  cobalamin B12-binding/radical SAM family protein  26.39 
 
 		 472 aa  107  5e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.900478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3593  radical SAM domain-containing protein  24.74 
 
 		 472 aa  103  8e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000974767  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3415  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  26.63 
 
 		 472 aa  100  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2479  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  25.24 
 
 		 484 aa  98.6  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.515921  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3553  Radical SAM domain protein  23.92 
 
 		 474 aa  94.4  6e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0488  Radical SAM domain protein  27.87 
 
 		 575 aa  94  7e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3504  cobalamin B12-binding/radical SAM family protein  23.18 
 
 		 677 aa  93.6  9e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2577  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  24.04 
 
 		 674 aa  93.6  9e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.451691  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0944  Radical SAM domain protein  26.52 
 
 		 488 aa  93.2  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000117321 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0909  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  23.8 
 
 		 681 aa  90.9  6e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3304  Radical SAM domain protein  26.16 
 
 		 487 aa  90.5  8e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.542811  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1171  radical SAM family protein  25.95 
 
 		 563 aa  89.7  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000834486  normal  0.0316133 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0597  radical SAM family protein  23.18 
 
 		 501 aa  89.4  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.678652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2638  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  24.15 
 
 		 512 aa  88.6  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0030  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  24.67 
 
 		 647 aa  88.6  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2074  radical SAM binding protein  24.26 
 
 		 598 aa  87.8  5e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0385557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1535  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  23.36 
 
 		 651 aa  87.4  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0897  Radical SAM domain protein  23.26 
 
 		 564 aa  87.8  6e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000336813  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2319  radical SAM family Fe-S protein  24.03 
 
 		 501 aa  87.4  6e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.518236  normal  0.0137531 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0871  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  24.05 
 
 		 554 aa  87.4  7e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0047  Fe-S oxidoreductase  23.03 
 
 		 647 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.982872  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3504  radical SAM domain-containing protein  23.69 
 
 		 646 aa  87  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.596547 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1243  radical SAM domain-containing protein  24.92 
 
 		 533 aa  85.9  0.000000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.445572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1836  radical SAM domain-containing protein  24.28 
 
 		 474 aa  86.3  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0246  radical SAM domain-containing protein  23.76 
 
 		 647 aa  86.3  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0033  B12-binding/radical SAM domain-containing protein  23.1 
 
 		 647 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0689  Radical SAM domain protein  26.3 
 
 		 459 aa  85.5  0.000000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3585  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  23.67 
 
 		 548 aa  85.5  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0670454 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0504  radical SAM domain-containing protein  23.88 
 
 		 471 aa  85.5  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3057  Radical SAM domain protein  22.04 
 
 		 518 aa  84.7  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00748759  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4972  radical SAM domain-containing protein  23.98 
 
 		 738 aa  83.6  0.000000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.991033  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0614  radical SAM domain-containing protein  26.09 
 
 		 570 aa  83.6  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.69222  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0027  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  22.77 
 
 		 651 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1180  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  22.77 
 
 		 647 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0516  radical SAM domain-containing protein  22.19 
 
 		 501 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0874  radical SAM family Fe-S protein  23.49 
 
 		 501 aa  83.6  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1460  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  22.77 
 
 		 651 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0033  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  22.77 
 
 		 647 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2888  B12 binding /radical SAM domain-containing protein  22.11 
 
 		 503 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00308859  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4199  cobalamin B12-binding:radical SAM family protein  23.23 
 
 		 548 aa  82.8  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.122489 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2929  radical SAM domain-containing protein  26.81 
 
 		 497 aa  82.8  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.43282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2276  radical SAM domain-containing protein  23.42 
 
 		 642 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.315011  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1897  radical SAM domain-containing protein  25.8 
 
 		 559 aa  82.4  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1616  radical SAM domain-containing protein  26.32 
 
 		 559 aa  82.4  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.710753  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1481  radical SAM family protein  22.69 
 
 		 644 aa  82  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.177835  normal  0.151823 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1369  radical SAM domain-containing protein  23.49 
 
 		 556 aa  81.6  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000805279  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3364  Radical SAM domain protein  23.26 
 
 		 564 aa  80.9  0.00000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.669906 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0558  radical SAM domain-containing protein  26.12 
 
 		 430 aa  80.9  0.00000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.236601  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2825  radical SAM domain-containing protein  22.4 
 
 		 476 aa  79.7  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000393045  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0112  Fe-S oxidoreductase  23.59 
 
 		 726 aa  79.7  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.702038 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0710  radical SAM domain-containing protein  23.36 
 
 		 516 aa  79  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.631588 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0643  Radical SAM domain protein  23.21 
 
 		 489 aa  79  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.83222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2787  Radical SAM domain protein  24.13 
 
 		 732 aa  79  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.231637  normal  0.0637853 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2185  Radical SAM domain protein  22.65 
 
 		 473 aa  79  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000424629  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1625  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  22.76 
 
 		 558 aa  79  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1302  Radical SAM domain protein  26.28 
 
 		 540 aa  79.3  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0143596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1100  radical SAM domain-containing protein  24.41 
 
 		 470 aa  78.6  0.0000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6404  Mg-protoporphyrin IX monomethyl ester oxidative cyclase 66kD subunit  25.1 
 
 		 534 aa  78.6  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0494  Fe-S oxidoreductase  25.37 
 
 		 569 aa  78.6  0.0000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4478  radical SAM family protein  25.25 
 
 		 554 aa  78.2  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.140837  normal  0.22726 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1155  radical SAM family protein  24.08 
 
 		 658 aa  77.8  0.0000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1150  oxidative cyclase-related protein  23.08 
 
 		 475 aa  77.4  0.0000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1134  putative Fe-S oxidoreductase  24.8 
 
 		 425 aa  77.4  0.0000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2416  radical SAM family protein  22.75 
 
 		 475 aa  77.4  0.0000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000137144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0873  radical SAM family Fe-S protein  21.99 
 
 		 501 aa  77  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3090  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  23.05 
 
 		 476 aa  76.6  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000038537  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3552  Radical SAM domain protein  22.86 
 
 		 488 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2434  radical SAM domain-containing protein  24.03 
 
 		 520 aa  77  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1420  radical SAM domain-containing protein  22.98 
 
 		 632 aa  76.3  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1423  radical SAM/B12 binding domain protein  24.65 
 
 		 715 aa  76.3  0.000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.623089  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1292  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  22.38 
 
 		 474 aa  75.9  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.118878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3127  radical SAM domain-containing protein  23.05 
 
 		 475 aa  75.9  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.543412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6339  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  24.44 
 
 		 479 aa  75.5  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00317674 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3570  radical SAM domain-containing protein  23.28 
 
 		 658 aa  75.5  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.370781  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2433  radical SAM domain-containing protein  22.92 
 
 		 502 aa  74.3  0.000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3586  Radical SAM domain protein  22.16 
 
 		 732 aa  74.7  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00751133 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0840  cobalamin B12-binding domain protein  22.19 
 
 		 590 aa  74.3  0.000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1777  Radical SAM domain protein  23.24 
 
 		 737 aa  73.9  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.54513 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0671  Radical SAM domain protein  26.32 
 
 		 468 aa  73.9  0.000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2210  radical SAM domain-containing protein  23.62 
 
 		 565 aa  74.3  0.000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.362097 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7154  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  24.12 
 
 		 479 aa  73.2  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.535479  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0114  Elongator protein 3/MiaB/NifB  26.87 
 
 		 609 aa  73.6  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0279  radical SAM domain-containing protein  22.46 
 
 		 494 aa  73.6  0.00000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3863  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  24.07 
 
 		 580 aa  73.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0582854  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1165  Radical SAM domain protein  21.45 
 
 		 506 aa  73.2  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1168  radical SAM family protein  22.44 
 
 		 566 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1602  radical SAM family Fe-S protein  24.02 
 
 		 487 aa  73.6  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4964  radical SAM family protein  24.36 
 
 		 476 aa  73.6  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.576294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3186  radical SAM family protein  23.1 
 
 		 583 aa  72.4  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>