More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2364 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_2364  S-layer domain protein  100 
 
 
1421 aa  2833  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00153299  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2809  glycoside hydrolase family protein  30.75 
 
 
1321 aa  193  2e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.149168  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2357  S-layer domain-containing protein  30.84 
 
 
1081 aa  179  3e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0251259  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0077  S-layer domain protein  33.08 
 
 
1710 aa  175  7e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1775  S-layer domain-containing protein  32.76 
 
 
2117 aa  167  1e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.83614  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0141  hypothetical protein  31.55 
 
 
758 aa  145  4e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  37.78 
 
 
1821 aa  121  9e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.5 
 
 
1029 aa  115  7e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0275  S-layer domain protein  27.22 
 
 
830 aa  114  1e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1982  S-layer domain protein  37.16 
 
 
506 aa  114  2e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.192953  normal  0.0752938 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0436  S-layer domain protein  31.37 
 
 
1226 aa  113  3e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  3.13752e-05 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2998  S-layer domain-containing protein  32.95 
 
 
926 aa  109  4e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2999  S-layer domain-containing protein  34.07 
 
 
524 aa  107  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1963  S-layer domain protein  35 
 
 
1009 aa  106  4e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  4.81253e-06  normal  0.0221131 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2680  S-layer domain-containing protein  33 
 
 
1174 aa  103  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3986  S-layer domain protein  29.05 
 
 
920 aa  102  5e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00445864 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0685  Ig domain protein group 2 domain protein  46.47 
 
 
437 aa  102  6e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3498  S-layer domain protein  37.21 
 
 
457 aa  97.1  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2454  fibronectin, type III  32.4 
 
 
1042 aa  96.7  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3478  S-layer domain protein  36.81 
 
 
548 aa  95.1  8e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2015  S-layer domain protein  30.65 
 
 
288 aa  94  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.859332  normal  0.142835 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3484  Ig domain protein group 2 domain protein  34.64 
 
 
526 aa  92.4  6e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2489  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.32 
 
 
1661 aa  92  7e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1459  Ig-like, group 2  33.94 
 
 
932 aa  90.9  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1781  alpha amylase, catalytic region  35.75 
 
 
1847 aa  90.9  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3495  S-layer domain protein  32.24 
 
 
935 aa  89.7  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0139036  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3203  Ig domain-containing protein  39.66 
 
 
981 aa  90.1  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1798  hypothetical protein  30.46 
 
 
218 aa  89.7  4e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.351482  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1863  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, family 4  30.74 
 
 
459 aa  89.4  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.27744e-53 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0243  hypothetical protein  30.92 
 
 
685 aa  89.4  4e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2434  cell wall/surface repeat protein  29.38 
 
 
2207 aa  89.4  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0293  hypothetical protein  29.28 
 
 
1260 aa  89  6e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00245165  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1967  hypothetical protein  33.88 
 
 
1194 aa  89  6e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3122  S-layer-like domain-containing protein  30.56 
 
 
692 aa  89  7e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1208  Ig domain-containing protein  38.38 
 
 
1048 aa  88.6  7e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1714  S-layer domain-containing protein  31.49 
 
 
573 aa  88.6  9e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1991  hypothetical protein  33.14 
 
 
625 aa  88.6  9e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.897372  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2319  glycoside hydrolase family 10  33.33 
 
 
1495 aa  87.8  1e-15  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0120  S-layer domain protein  30.48 
 
 
767 aa  87.8  1e-15  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1683  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.74 
 
 
459 aa  88.2  1e-15  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00306779  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1818  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.74 
 
 
459 aa  88.2  1e-15  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  5.45238e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0056  Ig-like, group 2  28 
 
 
4630 aa  87.4  2e-15  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3099  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.29 
 
 
1016 aa  86.3  4e-15  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0087  S-layer domain protein  33.53 
 
 
1223 aa  85.1  9e-15  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0189  hypothetical protein  27.78 
 
 
548 aa  84.3  1e-14  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3582  S-layer domain protein  27.68 
 
 
921 aa  85.1  1e-14  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  1.37339e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1505  S-layer-like domain-containing protein  32.39 
 
 
223 aa  84.3  1e-14  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0317  hypothetical protein  32.94 
 
 
820 aa  84  2e-14  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0705809  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0789  S-layer protein  30.86 
 
 
880 aa  84  2e-14  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.229168  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1963  hypothetical protein  30.99 
 
 
518 aa  83.2  3e-14  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3985  S-layer domain protein  28.74 
 
 
531 aa  82.8  4e-14  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.664034  hitchhiker  0.000502969 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1307  cellulosome anchoring protein, cohesin region  32.43 
 
 
631 aa  82  7e-14  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1629  S-layer protein  30.85 
 
 
470 aa  81.6  9e-14  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00040233  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3091  Ig family protein  33.15 
 
 
618 aa  81.3  1e-13  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1368  S-layer-like domain-containing protein  32.75 
 
 
710 aa  80.9  2e-13  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  4.86639e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1594  5'-nucleotidase/2' 3'-cyclic phosphodiesterase and related esterases-like protein  32.04 
 
 
733 aa  80.9  2e-13  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2877  S-layer-like domain-containing protein  28.64 
 
 
585 aa  80.5  2e-13  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0608  S-layer domain protein  31.67 
 
 
547 aa  80.9  2e-13  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.453799  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0779  S-layer domain-containing protein  29.38 
 
 
693 aa  80.5  2e-13  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.725533  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1431  S-layer domain-containing protein  27.78 
 
 
458 aa  80.1  3e-13  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1827  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.39 
 
 
1054 aa  79.7  4e-13  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.426628  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  30 
 
 
6885 aa  79.3  5e-13  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2506  S-layer-like domain-containing protein  32.96 
 
 
1013 aa  79.3  5e-13  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1939  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, family 4  28.85 
 
 
470 aa  79  7e-13  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  7.81755e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3489  S-layer domain protein  29.14 
 
 
506 aa  78.2  1e-12  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.662384  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0039  S-layer domain protein  27.91 
 
 
337 aa  77  2e-12  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2329  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.56 
 
 
596 aa  77  2e-12  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234722  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0559  S-layer domain protein  31.67 
 
 
1168 aa  77.4  2e-12  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3240  protein of unknown function DUF291  31.45 
 
 
2073 aa  77.8  2e-12  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2108  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.23 
 
 
995 aa  77.4  2e-12  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.557195  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0656  hypothetical protein  30 
 
 
660 aa  77  2e-12  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  1.40636e-07  hitchhiker  3.60107e-07 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0054  hypothetical protein  29.76 
 
 
729 aa  77  3e-12  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  8.0624e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1890  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.37 
 
 
470 aa  76.6  3e-12  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00294488  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2341  hypothetical protein  27.46 
 
 
554 aa  76.3  4e-12  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.920789 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0188  hypothetical protein  31.32 
 
 
756 aa  76.3  4e-12  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0060  surface layer protein  28.74 
 
 
484 aa  75.9  6e-12  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000340805  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0130  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.46 
 
 
1231 aa  75.9  6e-12  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.231553  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0443  hypothetical protein  27.62 
 
 
413 aa  75.5  7e-12  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3466  Excalibur domain-containing protein  29.38 
 
 
272 aa  75.5  7e-12  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1444  internalin, putative  28.9 
 
 
755 aa  75.1  9e-12  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.101045  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3080  cellulosome anchoring protein, cohesin region  34.62 
 
 
447 aa  75.1  9e-12  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2155  S-layer-like domain-containing protein  30.32 
 
 
631 aa  75.1  9e-12  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1246  internalin  28.49 
 
 
542 aa  74.7  1e-11  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0673  S-layer domain protein  28.49 
 
 
431 aa  74.7  1e-11  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1419  putative internalin  28.49 
 
 
779 aa  74.3  1e-11  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.131072 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1485  putative internalin  28.9 
 
 
766 aa  74.7  1e-11  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2530  S-layer protein  27.75 
 
 
461 aa  74.7  1e-11  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  3.47347e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1220  internalin  28.49 
 
 
765 aa  74.7  1e-11  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.359434  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4160  S-layer domain protein  29.83 
 
 
834 aa  74.7  1e-11  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  1.23931e-05  normal  0.0864092 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1718  S-layer region-like  29.38 
 
 
414 aa  73.9  2e-11  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2811  putative S-layer protein  27.75 
 
 
461 aa  73.9  2e-11  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.74812e-07 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3446  S-layer domain-containing protein  30.29 
 
 
876 aa  74.3  2e-11  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2803  S-layer protein  27.75 
 
 
461 aa  73.9  2e-11  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0432636  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0079  surface layer protein  28.74 
 
 
489 aa  73.9  2e-11  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2613  S-layer protein  27.75 
 
 
461 aa  73.9  2e-11  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170996  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3449  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.1 
 
 
843 aa  73.9  2e-11  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1222  internalin  32.61 
 
 
772 aa  73.6  3e-11  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.347362  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1064  crystal protein  27.32 
 
 
822 aa  73.6  3e-11  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  5.77462e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3710  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.79 
 
 
575 aa  73.2  3e-11  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3716  surface-layer N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.79 
 
 
575 aa  73.2  4e-11  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.597701  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>