More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2356 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_2356  ABC transporter related  100 
 
 		 233 aa  475  1e-133  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0836286  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2590  ABC transporter related  64.66 
 
 		 234 aa  302  2.0000000000000002e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2178  ABC transporter related  62.23 
 
 		 233 aa  302  3.0000000000000004e-81  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01920  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  59.23 
 
 		 233 aa  291  4e-78  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1515  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  59.23 
 
 		 233 aa  289  3e-77  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1363  ABC transporter related  57.76 
 
 		 234 aa  285  4e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2453  ABC transporter related  58.87 
 
 		 234 aa  285  5e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000726379  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1114  ABC transporter related  57.51 
 
 		 233 aa  284  8e-76  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0132  ABC transporter, ATP-binding protein  57.51 
 
 		 233 aa  282  4.0000000000000003e-75  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0773  ABC transporter related  57.08 
 
 		 233 aa  277  9e-74  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.805493  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0745  ABC transporter, ATP-binding protein  58.37 
 
 		 233 aa  276  2e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.913109  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0728  ABC transporter, ATP-binding protein  58.37 
 
 		 233 aa  276  2e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1689  peptide ABC transporter ATPase  56.22 
 
 		 233 aa  276  2e-73  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1004  ABC transporter, ATP-binding protein  56.22 
 
 		 233 aa  275  6e-73  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00659829  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1205  peptide ABC transporter ATPase  54.94 
 
 		 233 aa  265  5e-70  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0563  ABC transporter related protein  54.08 
 
 		 233 aa  263  1e-69  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1212  ABC transporter related  52.81 
 
 		 251 aa  263  2e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00777209 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2747  ABC transporter-related protein  52 
 
 		 244 aa  256  2e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00686798  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2961  ABC transporter related  50.43 
 
 		 238 aa  256  2e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.109609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2084  ABC transporter related  50.65 
 
 		 239 aa  256  3e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2841  ABC transporter related  51.56 
 
 		 244 aa  254  7e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.321502  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2656  ABC transporter, ATPase subunit  51.56 
 
 		 248 aa  253  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.177844  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1421  ABC transporter related  50 
 
 		 244 aa  253  2.0000000000000002e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1081  peptide ABC transporter ATPase  51.5 
 
 		 236 aa  253  3e-66  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1918  ABC transporter related  50.22 
 
 		 236 aa  249  3e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0390  ABC transporter related  50.65 
 
 		 232 aa  248  8e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1479  ABC transporter related  50.22 
 
 		 240 aa  248  8e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1279  ABC transporter related  48.05 
 
 		 253 aa  246  2e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1479  ABC transporter-related protein  47.62 
 
 		 244 aa  246  3e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1715  ATPase  49.35 
 
 		 236 aa  246  3e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1583  ABC transporter ATPase  52.44 
 
 		 241 aa  244  9.999999999999999e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.929196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2281  ABC transporter related  48.9 
 
 		 235 aa  243  9.999999999999999e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.341913  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0076  ABC transporter ATP-binding protein  50.22 
 
 		 235 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.514919 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0302  ABC transporter related  53.1 
 
 		 250 aa  242  3e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1125  ATPase  49.35 
 
 		 245 aa  241  7e-63  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.237557 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2874  ABC transporter related  48.92 
 
 		 236 aa  240  1e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.675054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1509  ABC transporter related  48.48 
 
 		 248 aa  240  2e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2064  ABC transporter related protein  47.62 
 
 		 244 aa  237  1e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.325549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0062  ABC transporter, ATP-binding protein  45.69 
 
 		 234 aa  237  1e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.857763  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0216  hypothetical protein  48.67 
 
 		 236 aa  235  4e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4369  ABC transporter related  46.12 
 
 		 234 aa  235  5.0000000000000005e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1576  ABC transporter related  47.14 
 
 		 236 aa  235  5.0000000000000005e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4501  ABC transporter related  46.12 
 
 		 234 aa  235  5.0000000000000005e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.293779 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2206  ABC transporter related  47.19 
 
 		 251 aa  234  1.0000000000000001e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.661126  normal  0.0101904 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3583  ABC transporter related  47.56 
 
 		 241 aa  232  3e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5377  putative ABC transporter, ATP-binding protein  47.19 
 
 		 253 aa  232  4.0000000000000004e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.409003 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1942  ABC transporter related  46.26 
 
 		 254 aa  231  5e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.934009  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1145  ABC transporter related  45.89 
 
 		 236 aa  231  7.000000000000001e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1013  ABC transporter related  47.19 
 
 		 245 aa  229  3e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1056  ABC transporter related  47.37 
 
 		 240 aa  228  5e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2067  peptide ABC transporter ATP-binding protein  46.58 
 
 		 240 aa  227  1e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4676  Sigma 54 interacting domain protein  47.62 
 
 		 234 aa  226  2e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1693  ABC transporter related  48.48 
 
 		 232 aa  226  2e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0324  ABC transporter related protein  46.98 
 
 		 235 aa  226  2e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.985254 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6252  ABC transporter related  47.11 
 
 		 234 aa  225  4e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.946819  normal  0.438945 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5173  ABC transporter related  45.45 
 
 		 238 aa  225  5.0000000000000005e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4213  ABC transporter related  45.22 
 
 		 245 aa  225  6e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3436  putative ABC transporter, ATP-binding protein  45.49 
 
 		 245 aa  224  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165594  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4268  ABC transporter-related protein  45.89 
 
 		 238 aa  223  2e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1666  ABC transporter related protein  46.98 
 
 		 235 aa  217  1e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.029475  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0109  ABC transporter related  46.85 
 
 		 243 aa  214  8e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.112558  normal  0.0826339 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1583  ABC transporter related  41.99 
 
 		 232 aa  214  8e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  42.04 
 
 		 226 aa  210  1e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2302  ABC transporter related  44.44 
 
 		 243 aa  211  1e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.704098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0021  ABC transporter, ATP-binding protein  41.63 
 
 		 345 aa  208  6e-53  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01810  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  44.69 
 
 		 236 aa  207  2e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2210  ABC transporter related protein  45.22 
 
 		 234 aa  205  5e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00255017  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl019  glutamine ABC transporter  39.74 
 
 		 604 aa  204  9e-52  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2148  ABC transporter related  46.12 
 
 		 225 aa  203  2e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.357033  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3220  ABC transporter related  43.95 
 
 		 235 aa  201  5e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000135458  normal  0.0828287 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0819  ABC transporter related  45.95 
 
 		 231 aa  200  1.9999999999999998e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000974524 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03250  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  41.99 
 
 		 233 aa  199  3e-50  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.684387  normal  0.338705 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  44.7 
 
 		 228 aa  199  3.9999999999999996e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0669  ABC transporter related  43.3 
 
 		 242 aa  197  7.999999999999999e-50  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  45.37 
 
 		 246 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0440126  decreased coverage  0.00217746 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  46.36 
 
 		 234 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  46.36 
 
 		 234 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2301  ABC transporter related protein  41.05 
 
 		 264 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00393831  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  43.44 
 
 		 230 aa  196  3e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5611  ABC transporter related  42.27 
 
 		 220 aa  196  3e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1576  ABC transporter related  45.41 
 
 		 223 aa  195  4.0000000000000005e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2017  ABC transporter related  42.67 
 
 		 234 aa  194  8.000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000531605 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0369  ABC transporter related  45.13 
 
 		 234 aa  194  8.000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.548641  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1084  ABC transporter related  45.13 
 
 		 234 aa  194  1e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0539  ABC transporter related protein  41.59 
 
 		 227 aa  194  1e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0632704  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0478  ABC transporter related protein  43.84 
 
 		 220 aa  194  1e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  44.34 
 
 		 230 aa  193  2e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1543  ABC transporter related  44.69 
 
 		 234 aa  193  2e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.686883  normal  0.0297617 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1678  ABC transporter related  42.49 
 
 		 235 aa  192  4e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184707  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0633  ABC transporter, ATPase subunit  45.45 
 
 		 252 aa  192  4e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0652413  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1377  ABC transporter related  44.14 
 
 		 232 aa  192  4e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.757456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0133  ABC Transporter  39.15 
 
 		 300 aa  192  5e-48  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1757  ABC transporter ATP-binding protein  44.8 
 
 		 235 aa  191  6e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.245254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0253  ABC transporter related  42.15 
 
 		 229 aa  191  6e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.588254 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2966  ABC transporter-like protein  44.7 
 
 		 234 aa  191  8e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  41.82 
 
 		 239 aa  191  8e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2350  ABC transporter related protein  43.64 
 
 		 220 aa  190  1e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.575927  normal  0.731614 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  43.38 
 
 		 235 aa  190  1e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0814  ABC transporter related  44.8 
 
 		 231 aa  189  2e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2167  ABC transporter related protein  42.99 
 
 		 222 aa  190  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>