159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2337 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_0536  glycoside hydrolase family protein  72.73 
 
 
563 aa  855    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000215938  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2337  glycoside hydrolase family 5  100 
 
 
539 aa  1108    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0405  glycoside hydrolase family protein  44.88 
 
 
526 aa  467  9.999999999999999e-131  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000478388  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2872  glycoside hydrolase family protein  41.39 
 
 
566 aa  422  1e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1866  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase., Cellulase  46.98 
 
 
1414 aa  416  9.999999999999999e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0740  glycoside hydrolase family 5  42.73 
 
 
534 aa  417  9.999999999999999e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.209978  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2712  cellulase  46.94 
 
 
619 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2820  glycoside hydrolase family protein  44.87 
 
 
633 aa  394  1e-108  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000391085  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1897  glycoside hydrolase family 5  45.81 
 
 
597 aa  376  1e-103  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.754177  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3216  glycoside hydrolase family 5  46.05 
 
 
649 aa  374  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2684  glycoside hydrolase family protein  44.91 
 
 
658 aa  371  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.954713  normal  0.0577257 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0734  glycoside hydrolase family 5  46.53 
 
 
580 aa  366  1e-100  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0560838  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1163  cellulase  43.52 
 
 
468 aa  360  3e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2147  glycoside hydrolase family protein  41.02 
 
 
660 aa  341  2e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0614  glycoside hydrolase family protein  30.57 
 
 
562 aa  176  9.999999999999999e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0151906 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4214  glycoside hydrolase family 5  30.93 
 
 
608 aa  169  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.303504  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3505  chitinase, cellulase  32.92 
 
 
2305 aa  167  5e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0820772 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0159  Cellulase  30.48 
 
 
542 aa  163  8.000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3001  chitinase  31.42 
 
 
2310 aa  158  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426725  normal  0.0460481 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04151  major extracellular endoglucanase  29.78 
 
 
480 aa  129  1.0000000000000001e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2102  cellulase  29.97 
 
 
496 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.104361  normal  0.672639 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1953  cellulase  25.13 
 
 
614 aa  105  3e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.253499  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0731  glycoside hydrolase family 9  51.65 
 
 
725 aa  89  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1099  glycoside hydrolase family 5  22.87 
 
 
475 aa  79.7  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1113  glycoside hydrolase family protein  23.32 
 
 
440 aa  77.4  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1236  protein of unknown function DUF1680  50 
 
 
955 aa  76.3  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00269962  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1207  cellulosome protein dockerin type I  47.44 
 
 
873 aa  72.4  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1010  glycoside hydrolase family protein  23.16 
 
 
440 aa  72  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2243  Pectate lyase/Amb allergen  51.52 
 
 
462 aa  72  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0247929  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0734  glycoside hydrolase family 9  57.14 
 
 
737 aa  69.7  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3420  thiamine-monophosphate kinase  23.46 
 
 
725 aa  68.9  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0210167 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0032  glycoside hydrolase family protein  46.38 
 
 
590 aa  69.3  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00146021  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1230  Carbohydrate binding family 6  54.1 
 
 
541 aa  68.9  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000323294  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0269  glycoside hydrolase family protein  45.45 
 
 
477 aa  68.9  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.275199  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1234  Carbohydrate binding family 6  50.82 
 
 
536 aa  69.3  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.115461  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0412  glycoside hydrolase family protein  43.06 
 
 
895 aa  67.4  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000331233  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1239  Carbohydrate binding family 6  49.18 
 
 
1015 aa  67  0.0000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000298242  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1298  glycoside hydrolase family 8  37.5 
 
 
477 aa  66.6  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000471564  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2089  glycoside hydrolase family protein  42.86 
 
 
741 aa  66.6  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000609917  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0755  glycoside hydrolase family 9  39.02 
 
 
646 aa  66.6  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.549048  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0231  glycoside hydrolase family 9  44.71 
 
 
715 aa  66.2  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0413621  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0732  glycoside hydrolase family 9  32.5 
 
 
885 aa  66.6  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1240  Carbohydrate binding family 6  41.1 
 
 
780 aa  66.6  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000268081  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1238  Carbohydrate binding family 6  46.03 
 
 
1122 aa  65.5  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000137164  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2017  lipolytic protein G-D-S-L family  50 
 
 
303 aa  65.9  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0931  glycoside hydrolase family 10  34.91 
 
 
423 aa  64.7  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.514764  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1231  Carbohydrate binding family 6  47.69 
 
 
524 aa  64.7  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0177163  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1233  Carbohydrate binding family 6  44.26 
 
 
746 aa  64.7  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.555313  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0286  polysaccharide deacetylase  41.86 
 
 
308 aa  64.7  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.350747  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0861  glycoside hydrolase family 5  23.78 
 
 
642 aa  64.3  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.025002 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1655  cellulosome protein dockerin type I  47.69 
 
 
435 aa  64.3  0.000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000388378  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2162  lipolytic protein G-D-S-L family  48.53 
 
 
436 aa  63.9  0.000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0417  cellulosome protein dockerin type I  36.84 
 
 
848 aa  63.9  0.000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000135998  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0624  glycoside hydrolase family protein  44.78 
 
 
1601 aa  63.5  0.000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1472  carbohydrate-binding family 11 protein  34.31 
 
 
900 aa  63.5  0.000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.980604  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1237  Carbohydrate binding family 6  43.66 
 
 
604 aa  63.2  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0649618  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2037  extracellular endoglucanase precursor  23.27 
 
 
584 aa  63.2  0.00000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2949  pectinesterase  36.61 
 
 
567 aa  62  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.765546  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2590  glycoside hydrolase family protein  39.44 
 
 
639 aa  61.6  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.549614  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2811  glycoside hydrolase family protein  41.56 
 
 
591 aa  62  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04177  cellulase  22.48 
 
 
590 aa  62  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3012  carbohydrate-binding family 6 protein  40.85 
 
 
630 aa  61.2  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1249  glycoside hydrolase family 9  46.25 
 
 
686 aa  61.2  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000227885  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0737  glycoside hydrolase family 9  50 
 
 
526 aa  60.8  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000624089  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4225  glycoside hydrolase family 5  23.44 
 
 
632 aa  60.8  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.366342  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0750  glycoside hydrolase family 11  41.79 
 
 
298 aa  60.5  0.00000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000169346  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0752  glycoside hydrolase family 26  42.25 
 
 
577 aa  60.1  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000240761  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1060  cellulosome protein dockerin type I  46.97 
 
 
295 aa  60.1  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0413  glycoside hydrolase family protein  40.62 
 
 
1224 aa  59.3  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2760  glycoside hydrolase family protein  43.28 
 
 
961 aa  59.3  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.26535  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1648  glycoside hydrolase family 9  40.3 
 
 
949 aa  58.9  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.230883  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0379  protein of unknown function DUF291  50 
 
 
732 aa  59.3  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0649  cellulosome protein dockerin type I  38.55 
 
 
532 aa  59.3  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2530  Ricin B lectin  45.45 
 
 
412 aa  58.2  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00551776  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0729  glycoside hydrolase family 48  44.44 
 
 
722 aa  58.2  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000900741  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2392  glycoside hydrolase family 9  28.64 
 
 
874 aa  58.2  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00520307  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1958  rare lipoprotein A  21.89 
 
 
584 aa  58.2  0.0000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2179  Pectate lyase/Amb allergen  39.44 
 
 
922 aa  57.4  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0043  glycoside hydrolase family protein  36.36 
 
 
742 aa  57.4  0.0000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2812  glycoside hydrolase family protein  42.86 
 
 
611 aa  57  0.0000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.283645  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1550  glycoside hydrolase family 18  44.12 
 
 
482 aa  56.6  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0322184  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1400  glycosyl hydrolase 53  43.28 
 
 
415 aa  56.6  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.195161  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2395  lipolytic protein G-D-S-L family  46.15 
 
 
311 aa  56.6  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00016801  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2123  glycosyl hydrolase 53 domain protein  39.44 
 
 
425 aa  55.8  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.052262  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1101  Spore coat protein CotH  38.71 
 
 
621 aa  55.8  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1235  Carbohydrate binding family 6  46.97 
 
 
509 aa  55.8  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00440741  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1271  carbohydrate-binding family 6 protein  38.81 
 
 
679 aa  55.8  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2549  cellulosome enzyme, dockerin type I  41.18 
 
 
324 aa  56.2  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2950  Pectate lyase/Amb allergen  34.62 
 
 
554 aa  55.8  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.821566  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3132  cellulosome enzyme, dockerin type I  38.24 
 
 
411 aa  56.2  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0745  glycoside hydrolase family protein  44.44 
 
 
730 aa  55.5  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0840  glycoside hydrolase family 5  42.65 
 
 
584 aa  55.1  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0429  PKD domain containing protein  43.08 
 
 
861 aa  54.7  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0735  glycoside hydrolase family 9  47.27 
 
 
757 aa  54.7  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15204  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0433  glycoside hydrolase family protein  35.82 
 
 
789 aa  54.3  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1551  glycoside hydrolase family 26  38.89 
 
 
583 aa  54.3  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000398696  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1229  Carbohydrate binding family 6  42.42 
 
 
535 aa  54.3  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.166566  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0190  proteinase inhibitor I4, serpin  42.19 
 
 
600 aa  53.9  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.927493  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0274  glycoside hydrolase family protein  37.14 
 
 
563 aa  53.1  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00113767  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1890  cellulosome enzyme, dockerin type I  36.51 
 
 
710 aa  53.1  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>