More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2330 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_3025  Beta-ketoacyl synthase  39.84 
 
 
995 aa  679    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1612  Beta-ketoacyl synthase  50.07 
 
 
1424 aa  695    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.509341  hitchhiker  0.00723495 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1969  Beta-ketoacyl synthase  48.47 
 
 
2498 aa  645    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.88904  normal  0.0132465 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4834  Beta-ketoacyl synthase  48.68 
 
 
1646 aa  682    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560935  normal  0.0357231 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3096  Beta-ketoacyl synthase  39.94 
 
 
995 aa  681    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2330  Beta-ketoacyl synthase  100 
 
 
1000 aa  2069    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1831  Beta-ketoacyl synthase  48.13 
 
 
1574 aa  651    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3966  Beta-ketoacyl synthase  40.26 
 
 
3108 aa  646    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3821  beta-ketoacyl synthase  50.38 
 
 
1909 aa  674    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3964  Beta-ketoacyl synthase  39.84 
 
 
3089 aa  668    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2416  Beta-ketoacyl synthase  37.83 
 
 
1302 aa  680    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3963  Beta-ketoacyl synthase  46.6 
 
 
3090 aa  636    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3965  Beta-ketoacyl synthase  39.98 
 
 
4646 aa  677    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3962  Beta-ketoacyl synthase  46.48 
 
 
1582 aa  651    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0978  Beta-ketoacyl synthase  50.29 
 
 
1653 aa  664    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3967  Beta-ketoacyl synthase  46.92 
 
 
3093 aa  622  1e-177  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1978  beta-ketoacyl synthase  41.56 
 
 
926 aa  617  1e-175  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.690285  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3745  KR domain protein  47.84 
 
 
1520 aa  603  1.0000000000000001e-171  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1966  erythronolide synthase  39.34 
 
 
1911 aa  603  1.0000000000000001e-171  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0640418 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1781  Beta-ketoacyl synthase  45.57 
 
 
1408 aa  604  1.0000000000000001e-171  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2400  beta-ketoacyl synthase  44.65 
 
 
2150 aa  595  1e-168  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.586894  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3961  Beta-ketoacyl synthase  47.45 
 
 
3130 aa  592  1e-167  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7299  polyketide synthetase  45.78 
 
 
1466 aa  589  1e-167  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3732  beta-ketoacyl synthase  44.74 
 
 
1535 aa  587  1e-166  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0148321  normal  0.340666 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4755  Beta-ketoacyl synthase  44.46 
 
 
1560 aa  579  1e-164  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.173311  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2423  polyketide/non-ribosomal peptide synthetase  44.56 
 
 
1795 aa  579  1e-164  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.328938  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1010  KR domain-containing protein  44.39 
 
 
2604 aa  577  1.0000000000000001e-163  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1247  amino acid adenylation domain protein  45.08 
 
 
2684 aa  572  1e-161  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7000  Beta-ketoacyl synthase  43.56 
 
 
4647 aa  563  1.0000000000000001e-159  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0846  amino acid adenylation domain-containing protein  42.35 
 
 
2710 aa  560  1e-158  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0573  KR domain protein  43.57 
 
 
1833 aa  561  1e-158  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0836  beta-ketoacyl synthase  41.94 
 
 
2093 aa  551  1e-155  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1705  amino acid adenylation  42.45 
 
 
4186 aa  549  1e-154  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.254367 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4911  Beta-ketoacyl synthase  42.5 
 
 
1466 aa  545  1e-153  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.000703058  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2034  amino acid adenylation domain protein  42.79 
 
 
2176 aa  542  9.999999999999999e-153  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00320121 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3682  KR domain protein  42.97 
 
 
1497 aa  541  9.999999999999999e-153  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.631324  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1161  polyketide synthase  43.31 
 
 
1612 aa  536  1e-151  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0834  polyketide synthase  43.31 
 
 
1612 aa  536  1e-151  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.399353  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4055  Beta-ketoacyl synthase  43.95 
 
 
974 aa  535  1e-150  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.285495 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6901  amino acid adenylation domain protein  42.36 
 
 
2273 aa  530  1e-149  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1672  amino acid adenylation domain-containing protein  41.59 
 
 
3335 aa  531  1e-149  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0886652 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3761  amino acid adenylation domain protein  41.5 
 
 
2682 aa  527  1e-148  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.674004  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3184  amino acid adenylation domain protein  39.6 
 
 
2454 aa  525  1e-147  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2331  amino acid adenylation domain protein  53.27 
 
 
3235 aa  525  1e-147  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3390  beta-ketoacyl synthase  41.84 
 
 
1489 aa  520  1e-146  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0100261  normal  0.176956 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2580  amino acid adenylation domain-containing protein  40.82 
 
 
2679 aa  517  1.0000000000000001e-145  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3123  beta-ketoacyl synthase  41.74 
 
 
1470 aa  516  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2832  beta-ketoacyl synthase  41.6 
 
 
1472 aa  506  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.789961  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2861  beta-ketoacyl synthase  41.6 
 
 
1472 aa  507  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2876  beta-ketoacyl synthase  41.6 
 
 
1472 aa  506  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.119773 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12949  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsE  41.32 
 
 
1488 aa  508  9.999999999999999e-143  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.892857  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2106  hypothetical protein  42.08 
 
 
2316 aa  504  1e-141  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1860  Beta-ketoacyl synthase  38.57 
 
 
1416 aa  481  1e-134  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.699288  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1608  amino acid adenylation  39.91 
 
 
3194 aa  480  1e-134  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7309  polyketide synthase  38.81 
 
 
1486 aa  478  1e-133  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2882  Beta-ketoacyl synthase  39.24 
 
 
2462 aa  469  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.17345 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1336  Beta-ketoacyl synthase  40.72 
 
 
1465 aa  462  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2363  polyketide synthase  45.31 
 
 
1525 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3070  6-deoxyerythronolide-B synthase  46.73 
 
 
1208 aa  456  1.0000000000000001e-126  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1021  thiotemplate mechanism natural product synthetase  40.19 
 
 
3133 aa  452  1e-125  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0272  thiotemplate mechanism natural product synthetase  40.19 
 
 
4239 aa  452  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1709  non-ribosomal peptide synthase  40.19 
 
 
4265 aa  452  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0298  thiotemplate mechanism natural product synthetase  40.19 
 
 
3127 aa  452  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1795  syringomycin synthetase  40.03 
 
 
4265 aa  449  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.39 
 
 
1874 aa  446  1.0000000000000001e-124  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  38.59 
 
 
1656 aa  447  1.0000000000000001e-124  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.88 
 
 
2551 aa  437  1e-121  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  37.35 
 
 
1587 aa  439  1e-121  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0138  TubD protein  43.81 
 
 
1353 aa  437  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1647  polyketide synthase, type I  43.81 
 
 
1329 aa  437  1e-121  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.052108  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1235  JamP  43.61 
 
 
1370 aa  438  1e-121  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1566  polyketide synthase, type I  43.81 
 
 
1329 aa  437  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  37.46 
 
 
1337 aa  435  1e-120  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  36.1 
 
 
2551 aa  433  1e-120  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6994  Beta-ketoacyl synthase  43.44 
 
 
1276 aa  430  1e-119  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3193  Beta-ketoacyl synthase  31.62 
 
 
3099 aa  432  1e-119  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  36.84 
 
 
1087 aa  427  1e-118  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2654  beta-ketoacyl synthase  36.82 
 
 
2226 aa  429  1e-118  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.261151  normal  0.360138 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2600  yersiniabactin polyketide/non-ribosomal peptide synthetase  37.48 
 
 
3173 aa  424  1e-117  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2072  Beta-ketoacyl synthase  36.56 
 
 
2243 aa  426  1e-117  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2097  yersiniabactin synthetase, HMWP1 component  36.72 
 
 
3163 aa  425  1e-117  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1810  polyketide synthase protein  42.97 
 
 
2380 aa  419  1e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.362155  normal  0.526323 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2088  thiotemplate mechanism natural product synthetase  37.69 
 
 
2792 aa  420  1e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2429  thiotemplate mechanism natural product synthetase  43.05 
 
 
1160 aa  422  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.336894  hitchhiker  0.00172605 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  36.56 
 
 
3696 aa  422  1e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  39.06 
 
 
6889 aa  412  1e-113  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1446  thiotemplate mechanism natural product synthetase  36.66 
 
 
2839 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3022  Beta-ketoacyl synthase  37.76 
 
 
1559 aa  410  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3099  6-deoxyerythronolide-B synthase  37.61 
 
 
1559 aa  411  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.692721 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2168  thiotemplate mechanism natural product synthetase  36.66 
 
 
2839 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2383  condensation domain protein  44.14 
 
 
2006 aa  411  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1862  thiotemplate mechanism natural product synthetase  36.51 
 
 
2832 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00326522  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  36.61 
 
 
2762 aa  409  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  36.49 
 
 
1354 aa  407  1.0000000000000001e-112  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2971  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase., 6- deoxyerythronolide-B synthase  38.17 
 
 
3424 aa  407  1.0000000000000001e-112  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000594073 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0440  polyketide synthase  36.51 
 
 
2832 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0537  polyketide synthase  36.6 
 
 
2835 aa  409  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.725233  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  36.56 
 
 
1939 aa  404  1e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2887  Beta-ketoacyl synthase  30.16 
 
 
1208 aa  405  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  37.07 
 
 
3676 aa  405  1e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.180962 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>