More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2329 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_4219  non-ribosomal siderophore peptide synthetase  36.65 
 
 
3470 aa  858    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4220  non-ribosomal peptide synthetase  32.32 
 
 
2628 aa  768    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.663079 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4221  non-ribosomal peptide synthetase  34.17 
 
 
2174 aa  690    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.206011 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4243  peptide synthase  32.25 
 
 
4317 aa  862    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2095  amino acid adenylation domain-containing protein  33.79 
 
 
3395 aa  944    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.800691  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  40.05 
 
 
5953 aa  867    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  35.64 
 
 
6889 aa  917    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2402  nonribosomal peptide synthetase DhbF  34.51 
 
 
2385 aa  704    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.777196  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  32.62 
 
 
4336 aa  900    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2869  amino acid adenylation domain-containing protein  35.51 
 
 
5328 aa  937    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.127211 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2148  pyoverdine sidechain peptide synthetase II, D-Asp-L-Thr component  31.19 
 
 
2625 aa  741    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.307821  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2149  pyoverdine sidechain peptide synthetase III, L-Thr-L-Ser component  39.93 
 
 
2151 aa  860    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2150  pyoverdine sidechain peptide synthetase IV, D-Asp-L-Ser component  32.83 
 
 
2875 aa  790    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2830  non-ribosomal peptide synthetase SyfB  34.25 
 
 
5929 aa  712    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4518  non-ribosomal peptide synthetase, initiating component  36.7 
 
 
1753 aa  762    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4519  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  38.62 
 
 
3432 aa  835    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4699  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  39.9 
 
 
4531 aa  851    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2208  nonribosomal peptide synthetase DhbF  34.83 
 
 
2385 aa  718    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2147  nonribosomal peptide synthetase  35.23 
 
 
2385 aa  726    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.633458  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1715  multifunctional nonribosomal peptide synthetase (mycosubtilin synthetase)  31.98 
 
 
2543 aa  724    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1716  multifunctional nonribosomal peptide synthetase (mycosubtilin synthetase)  32.68 
 
 
3044 aa  771    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2131  nonribosomal peptide synthetase  35 
 
 
2385 aa  722    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1643  putative peptide synthetase  34.08 
 
 
3328 aa  679    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1087  putative non-ribosomal peptide synthase  30.39 
 
 
3235 aa  723    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2089  amino acid adenylation domain-containing protein  35.78 
 
 
2138 aa  697    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1792  amino acid adenylation  30.95 
 
 
3021 aa  726    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.277992 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1793  amino acid adenylation  35.03 
 
 
1370 aa  681    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0250793 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1945  peptide synthase  32.72 
 
 
4336 aa  898    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1088  hypothetical protein  29.99 
 
 
2187 aa  647    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1958  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  30.73 
 
 
2666 aa  708    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.815513 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1959  amino acid adenylation  40.51 
 
 
2154 aa  857    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.992857 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1960  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  32.43 
 
 
2883 aa  781    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.77716 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2577  amino acid adenylation  35.27 
 
 
5926 aa  728    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2608  amino acid adenylation  29.96 
 
 
9498 aa  752    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2614  amino acid adenylation  34.77 
 
 
5372 aa  697    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.797013 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2616  amino acid adenylation  31.84 
 
 
13537 aa  780    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  39.78 
 
 
6676 aa  872    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4417  amino acid adenylation domain-containing protein  34.9 
 
 
1104 aa  649    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.543215 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0002  amino acid adenylation  32.81 
 
 
2867 aa  814    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0171576 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0009  amino acid adenylation  31.72 
 
 
2791 aa  776    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0712365 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1610  amino acid adenylation  37.66 
 
 
1142 aa  746    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0752074 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1611  amino acid adenylation  37.11 
 
 
3308 aa  917    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0144172 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1613  non-ribosomal peptide synthase  36.98 
 
 
3498 aa  1096    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0181375 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4099  non-ribosomal peptide synthase  36.44 
 
 
2033 aa  999    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.908444 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4109  amino acid adenylation  35.68 
 
 
1786 aa  671    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.208816  normal  0.227369 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4801  hypothetical protein  30.32 
 
 
2167 aa  665    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6813  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase  37.42 
 
 
4383 aa  713    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1624  peptide synthase  32.27 
 
 
4317 aa  865    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6814  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  40.87 
 
 
8646 aa  868    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2663  nonribosomal peptide synthetase  29.61 
 
 
2979 aa  712    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0693  hypothetical protein  31.61 
 
 
6072 aa  772    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0694  hypothetical protein  35.06 
 
 
4572 aa  749    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0695  non-ribosomal peptide synthetase  38.57 
 
 
3291 aa  855    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.622014  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1845  peptide synthase  34.72 
 
 
5654 aa  881    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1846  peptide synthase  37.38 
 
 
4502 aa  1094    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1849  amino acid adenylation  33.61 
 
 
1383 aa  642    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2212  amino acid adenylation  34.68 
 
 
5422 aa  643    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2213  amino acid adenylation  37.41 
 
 
4882 aa  845    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2265  amino acid adenylation  31.3 
 
 
3002 aa  747    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.580207  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2266  amino acid adenylation  36.72 
 
 
1369 aa  720    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.654953  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3940  peptide synthase  33.58 
 
 
4332 aa  910    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.862701 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1675  amino acid adenylation domain-containing protein  37.25 
 
 
1129 aa  702    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2372  nonribosomal peptide synthetase DhbF  34.83 
 
 
2385 aa  718    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1829  amino acid adenylation  34.7 
 
 
4037 aa  881    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1830  amino acid adenylation  37.44 
 
 
1138 aa  717    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1832  amino acid adenylation  33.01 
 
 
1801 aa  662    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1956  non-ribosomal peptide synthetase, putative  30.47 
 
 
2967 aa  750    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1089  putative non-ribosomal peptide synthase  32.77 
 
 
5467 aa  787    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.993162 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2450  amino acid adenylation  30.07 
 
 
4290 aa  734    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2459  amino acid adenylation  34.07 
 
 
4489 aa  769    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.765153 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2460  amino acid adenylation  30.05 
 
 
2605 aa  681    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.441641  normal  0.494441 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2522  non-ribosomal peptide synthase  29.54 
 
 
2979 aa  708    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.207691  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2054  amino acid adenylation  31.62 
 
 
3102 aa  709    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1935  amino acid adenylation domain-containing protein  33.51 
 
 
3291 aa  857    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2214  syringomycin synthetase  38.82 
 
 
3348 aa  860    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3534  amino acid adenylation  28.94 
 
 
2457 aa  683    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2870  amino acid adenylation domain-containing protein  29.72 
 
 
3231 aa  746    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.812927 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2213  non-ribosomal peptide synthase  34.97 
 
 
4468 aa  751    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2090  amino acid adenylation domain-containing protein  30.76 
 
 
1568 aa  696    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  35.76 
 
 
3176 aa  975    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.173269 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6473  amino acid adenylation domain-containing protein  30.8 
 
 
3018 aa  669    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0194792 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  34.39 
 
 
4478 aa  714    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6812  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  37.11 
 
 
2370 aa  774    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33280  peptide synthase  32.64 
 
 
4342 aa  894    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.46218 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33610  peptide synthase  37.1 
 
 
5149 aa  1056    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.844682 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33630  PvdJ  32.83 
 
 
2189 aa  764    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.795242  normal  0.135203 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33650  pyoverdine synthetase D  36.44 
 
 
2448 aa  767    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.769726  normal  0.0679691 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2088  amino acid adenylation domain-containing protein  31.64 
 
 
2894 aa  702    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0546  amino acid adenylation domain-containing protein  31.94 
 
 
2151 aa  639    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1000  amino acid adenylation domain-containing protein  31.53 
 
 
2477 aa  654    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3730  amino acid adenylation domain-containing protein  31.06 
 
 
2651 aa  725    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.390082 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3731  amino acid adenylation domain-containing protein  35.69 
 
 
1130 aa  674    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0201667  normal  0.167868 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3733  amino acid adenylation domain-containing protein  34.38 
 
 
1779 aa  653    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.279948 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2093  amino acid adenylation domain-containing protein  32.4 
 
 
2410 aa  666    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2294  syringomycin synthetase  34.28 
 
 
6006 aa  695    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2097  amino acid adenylation domain-containing protein  32.8 
 
 
1992 aa  793    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.164393  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1941  putative peptide synthetase  34.08 
 
 
3352 aa  679    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2212  non-ribosomal peptide synthase  32.01 
 
 
6081 aa  791    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  37.19 
 
 
1833 aa  714    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2575  non-ribosomal peptide synthase  29.7 
 
 
2979 aa  704    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>