More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2319 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_2319  glycoside hydrolase family 10  100 
 
 
1495 aa  3043    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2320  glycoside hydrolase family 10  61.34 
 
 
1050 aa  1064    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0293  hypothetical protein  46.12 
 
 
1260 aa  377  1e-102  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00245165  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2489  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  37.87 
 
 
1661 aa  329  2.0000000000000001e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2108  endo-1,4-beta-xylanase  33.11 
 
 
806 aa  308  4.0000000000000004e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1252  Endo-1,4-beta-xylanase  32.34 
 
 
1019 aa  304  7.000000000000001e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.104467 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1549  endo-1,4-beta-xylanase  30.27 
 
 
1020 aa  295  4e-78  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0176143  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0863  endo-1,4-beta-xylanase  30.36 
 
 
1059 aa  293  1e-77  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0885  endo-1,4-beta-xylanase  30.36 
 
 
1059 aa  293  1e-77  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.389282  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0231  endo-1,4-beta-xylanase  29.89 
 
 
1041 aa  278  6e-73  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.540515  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1101  endo-1,4-beta-xylanase  27.44 
 
 
1018 aa  275  4.0000000000000004e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.520079  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3862  endo-1,4-beta-xylanase  39.66 
 
 
2457 aa  263  1e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1715  Endo-1,4-beta-xylanase  28.57 
 
 
1037 aa  250  1e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000895355  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1068  Endo-1,4-beta-xylanase  27.86 
 
 
912 aa  215  4.9999999999999996e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0377061  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2683  Endo-1,4-beta-xylanase  31.27 
 
 
1331 aa  214  1e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0183  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  31.18 
 
 
697 aa  213  3e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0638  Endo-1,4-beta-xylanase  29.2 
 
 
1780 aa  213  3e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.806584 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0905  glycoside hydrolase family 10  28.92 
 
 
690 aa  210  2e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.506442  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1648  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  31.03 
 
 
1146 aa  209  3e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.479186  hitchhiker  0.00101634 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1838  glycoside hydrolase family protein  30.61 
 
 
619 aa  207  1e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.561717  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0639  Endo-1,4-beta-xylanase  29.79 
 
 
1215 aa  199  3e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.164422 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0618  Endo-1,4-beta-xylanase  27.59 
 
 
689 aa  199  5.000000000000001e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.687614  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0624  endo-1,4-beta-xylanase  29.57 
 
 
756 aa  198  5.000000000000001e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000271039  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2710  Endo-1,4-beta-xylanase  32.13 
 
 
331 aa  185  5.0000000000000004e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1857  glycoside hydrolase family 48  33.69 
 
 
1478 aa  181  8e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00499056  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1647  Endo-1,4-beta-xylanase  33.15 
 
 
323 aa  180  2e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.394588  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3010  endo-1,4-beta-xylanase  30.08 
 
 
321 aa  178  6e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.800055  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05340  endo-1,4-beta-xylanase (glycosyl hydrolase family 10)  36.01 
 
 
457 aa  177  9e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.536878  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0185  Endo-1,4-beta-xylanase  31.46 
 
 
337 aa  176  2.9999999999999996e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0351  Endo-1,4-beta-xylanase  30.08 
 
 
366 aa  175  6.999999999999999e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0809  glycoside hydrolase family 10  28.54 
 
 
627 aa  175  6.999999999999999e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3495  S-layer domain protein  27.43 
 
 
935 aa  174  7.999999999999999e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0139036  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2695  Endo-1,4-beta-xylanase  30.55 
 
 
407 aa  173  3e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2441  Endo-1,4-beta-xylanase  35.12 
 
 
474 aa  172  5e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.637326  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2487  Endo-1,4-beta-xylanase  33.33 
 
 
815 aa  171  1e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.538992 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  35.42 
 
 
497 aa  168  9e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3214  Endo-1,4-beta-xylanase  33.83 
 
 
457 aa  167  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.176757  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0245  glycoside hydrolase family 10  34.32 
 
 
1001 aa  166  3e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1996  endo-1,4-beta-xylanase  30.26 
 
 
369 aa  165  5.0000000000000005e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1963  glycoside hydrolase family protein  32.2 
 
 
837 aa  162  5e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.658538  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0796  Endo-1,4-beta-xylanase  30.03 
 
 
359 aa  162  5e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000650557  normal  0.101178 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0733  glycoside hydrolase family 10  32.19 
 
 
488 aa  159  3e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0159525  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2657  endo-1,4-beta-xylanase  30.16 
 
 
423 aa  157  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.650838  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2328  Endo-1,4-beta-xylanase  29.92 
 
 
338 aa  156  2.9999999999999998e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57061  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0993  Carbohydrate-binding family 9  41.25 
 
 
2286 aa  155  5.9999999999999996e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.938361  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0732  glycoside hydrolase family 10  32.31 
 
 
503 aa  152  5e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.180847  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0287  Endo-1,4-beta-xylanase  31.45 
 
 
333 aa  152  6e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000028358  normal  0.661075 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  34.73 
 
 
495 aa  152  7e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3558  glycoside hydrolase family 10  33.63 
 
 
820 aa  151  8e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1404  Endo-1,4-beta-xylanase  27.61 
 
 
370 aa  151  8e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.478962  normal  0.374178 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2633  endo-1,4-beta-xylanase  29.01 
 
 
374 aa  151  1.0000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112994  normal  0.315981 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0180  glycoside hydrolase family protein  31.56 
 
 
678 aa  151  1.0000000000000001e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.297284  normal  0.254971 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2447  glycoside hydrolase family 10  30.95 
 
 
477 aa  151  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2684  Endo-1,4-beta-xylanase  27.03 
 
 
1242 aa  150  2.0000000000000003e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2024  glycoside hydrolase family 10  33.84 
 
 
756 aa  150  2.0000000000000003e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0912  glycoside hydrolase family protein  27.24 
 
 
1077 aa  149  3e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3024  glycoside hydrolase family 62  32.93 
 
 
829 aa  149  4.0000000000000006e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  30.97 
 
 
474 aa  149  4.0000000000000006e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0933  Beta-1 4-xylanase-like protein  32.85 
 
 
543 aa  149  6e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258206  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0854  endo-1,4-beta-xylanase  33.23 
 
 
347 aa  148  9e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2923  xylanase  31.79 
 
 
491 aa  147  1e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2586  Endo-1,4-beta-xylanase  33.13 
 
 
454 aa  147  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4732  Endo-1,4-beta-xylanase  31.85 
 
 
451 aa  147  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0396836  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0877  endo-1,4-beta-xylanase  32.93 
 
 
347 aa  147  2e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.113866  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1594  5'-nucleotidase/2' 3'-cyclic phosphodiesterase and related esterases-like protein  41.44 
 
 
733 aa  147  2e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1479  Endo-1,4-beta-xylanase  30.9 
 
 
371 aa  145  5e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3531  Endo-1,4-beta-xylanase  34.53 
 
 
472 aa  143  1.9999999999999998e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  40 
 
 
6885 aa  144  1.9999999999999998e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2327  Endo-1,4-beta-xylanase  32.24 
 
 
370 aa  142  3.9999999999999997e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.146279  hitchhiker  0.0000050608 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2218  Endo-1,4-beta-xylanase  26.91 
 
 
373 aa  142  6e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000248753  decreased coverage  0.00000085459 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3866  endo-1,4-beta-xylanase  30.23 
 
 
463 aa  141  7.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0285247  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2227  endo-1,4-beta-xylanase  29.73 
 
 
382 aa  137  9.999999999999999e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.470132  normal  0.0116576 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  29.28 
 
 
490 aa  136  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  28.57 
 
 
778 aa  137  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4240  Endo-1,4-beta-xylanase  27.37 
 
 
324 aa  135  6.999999999999999e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.340306  normal  0.631707 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0931  glycoside hydrolase family 10  29.47 
 
 
423 aa  135  7.999999999999999e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.514764  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1112  Endo-1,4-beta-xylanase  30.03 
 
 
328 aa  135  7.999999999999999e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1510  endo-1,4-beta-xylanase  29.75 
 
 
520 aa  135  9e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000764264  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2934  endo-1,4-beta-xylanase  30.62 
 
 
619 aa  133  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000972759  normal  0.881694 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0372  endo-1,4-beta-xylanase  30.03 
 
 
389 aa  132  7.000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4414  glycoside hydrolase family 10  28.78 
 
 
487 aa  131  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0188  hypothetical protein  34.67 
 
 
756 aa  131  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5072  Endo-1,4-beta-xylanase  30.88 
 
 
451 aa  130  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0643  Carbohydrate-binding family 9  37.63 
 
 
215 aa  129  6e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000132287  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  30 
 
 
628 aa  126  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3099  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.5 
 
 
1016 aa  125  8e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01818  Endo-1,4-beta-xylanase C Precursor (Xylanase C)(EC 3.2.1.8)(1,4-beta-D-xylan xylanohydrolase C)(34 kDa xylanase)(Xylanase X34) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00177]  31.03 
 
 
309 aa  124  9.999999999999999e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.780963  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1307  cellulosome anchoring protein, cohesin region  31.49 
 
 
631 aa  124  9.999999999999999e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6584  Endo-1,4-beta-xylanase  29.85 
 
 
375 aa  119  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0793463  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2590  glycoside hydrolase family protein  23.73 
 
 
639 aa  118  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.549614  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3463  Carbohydrate-binding family 9  39.89 
 
 
691 aa  117  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0207696  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2454  fibronectin, type III  35.68 
 
 
1042 aa  116  3e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1459  Ig-like, group 2  25.78 
 
 
932 aa  116  3e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03450  beta-1,4-xylanase  28.13 
 
 
383 aa  113  2.0000000000000002e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  35.29 
 
 
1821 aa  113  3e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2079  endo-1,4-beta-xylanase  28.09 
 
 
364 aa  112  4.0000000000000004e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1477  Endo-1,4-beta-xylanase  28.79 
 
 
317 aa  112  4.0000000000000004e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2791  xylanase  26.52 
 
 
399 aa  112  6e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1781  alpha amylase, catalytic region  26.47 
 
 
1847 aa  112  6e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_35732  Glycoside hydrolase, family 10 Endo-1,4-beta-xylanase precursor (Xylanase) Exoglucanase/xylanase precursor  30.32 
 
 
321 aa  112  8.000000000000001e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>