More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2277 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_2277  peptidase T-like protein  100 
 
 
370 aa  750    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00122308  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2046  peptidase T-like protein  50.82 
 
 
375 aa  353  2e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2283  peptidase T-like protein  48.65 
 
 
372 aa  345  8e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00606916  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06810  peptidase T-like protein  46.49 
 
 
377 aa  344  1e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1895  peptidase T-like protein  45.11 
 
 
368 aa  342  5e-93  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0323  peptidase T-like protein  49.46 
 
 
374 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1092  peptidase T-like protein  49.19 
 
 
377 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00341854  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2199  peptidase T-like protein  46.38 
 
 
389 aa  333  2e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2841  peptidase T-like protein  44.86 
 
 
372 aa  325  9e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2778  peptidase T-like protein  46.32 
 
 
372 aa  325  9e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1605  peptidase T-like protein  45.63 
 
 
368 aa  323  3e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0298  peptidase T-like protein  44.14 
 
 
368 aa  321  9.999999999999999e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000204223  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4257  peptidase, M20/M25/M40 family  44.32 
 
 
372 aa  320  3e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0980324  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4052  peptidase T  44.59 
 
 
372 aa  320  3e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3891  peptidase T  44.59 
 
 
372 aa  320  3e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3898  peptidase T  44.59 
 
 
372 aa  320  3e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4278  peptidase, M20/M25/M40 family  44.59 
 
 
372 aa  320  3e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0679847  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4368  peptidase T  44.59 
 
 
372 aa  320  3e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.92014  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4167  peptidase, M20/M25/M40 family  44.59 
 
 
372 aa  320  3e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4216  peptidase T  44.32 
 
 
372 aa  318  7.999999999999999e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00206895  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0978  peptidase, M20/M25/M40 family  44.32 
 
 
372 aa  318  7.999999999999999e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3985  peptidase T-like protein  44.32 
 
 
372 aa  317  2e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0027  peptidase T-like protein  46.47 
 
 
372 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0595  tripeptidase  42.39 
 
 
375 aa  310  2.9999999999999997e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1072  peptidase T-like protein  44.8 
 
 
374 aa  308  1.0000000000000001e-82  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.945662  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1602  peptidase T-like protein  42.36 
 
 
377 aa  300  2e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.438346  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1570  peptidase T-like protein  42.36 
 
 
377 aa  300  2e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0959  M20A family peptidase  44.84 
 
 
368 aa  297  2e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3656  tripeptidase T  45.2 
 
 
368 aa  294  2e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0101  peptidase  42.55 
 
 
391 aa  292  5e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3276  peptidase T-like protein  43.75 
 
 
381 aa  288  8e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02174  tripeptidase T  43.58 
 
 
368 aa  288  1e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2471  peptidase T  43.01 
 
 
378 aa  285  8e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00972327  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003656  peptidase M20A family  43.58 
 
 
368 aa  284  2.0000000000000002e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1348  peptidase T-like protein  39.51 
 
 
365 aa  283  4.0000000000000003e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.868823  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2568  peptidase T-like protein  38.9 
 
 
376 aa  282  7.000000000000001e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00779474  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3813  peptidase T-like protein  43.14 
 
 
360 aa  277  2e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.119165  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0918  peptidase M20  38.79 
 
 
383 aa  272  9e-72  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000400462  unclonable  4.70833e-19 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3034  peptidase T-like protein  39.45 
 
 
374 aa  270  2e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000138199  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2216  peptidase T-like protein  40.43 
 
 
379 aa  266  5e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000147363  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3485  peptidase T-like protein  43.02 
 
 
368 aa  265  5.999999999999999e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000911364  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0957  peptidase T-like protein  34.7 
 
 
370 aa  219  7.999999999999999e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000302106  hitchhiker  0.000000131493 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3087  peptidase dimerization domain protein  31.62 
 
 
387 aa  173  5e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1507  peptidase M20  29.74 
 
 
402 aa  160  4e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5236  peptidase M20  28.61 
 
 
403 aa  147  3e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3698  putative peptidase  26.46 
 
 
401 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.704745  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01133  hypothetical protein  26.1 
 
 
408 aa  116  5e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.684564  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01125  peptidase T  26.1 
 
 
408 aa  116  5e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.671932  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1247  peptidase T  26.1 
 
 
408 aa  116  5e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2476  peptidase T  26.1 
 
 
408 aa  116  5e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1998  peptidase T  25.85 
 
 
422 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.668207 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1290  peptidase T  25.85 
 
 
409 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1568  peptidase T  25.85 
 
 
422 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000893895 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1305  peptidase T  25.85 
 
 
408 aa  112  8.000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2520  peptidase T  25.61 
 
 
408 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00630559  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1096  peptidase T  28.69 
 
 
410 aa  111  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1640  peptidase T  26.38 
 
 
422 aa  110  3e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0399  peptidase T  27.38 
 
 
409 aa  107  3e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.168902  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2009  peptidase T  26.25 
 
 
409 aa  107  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0459341 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1306  peptidase T  26.34 
 
 
409 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.841149  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3800  peptidase T  26.86 
 
 
422 aa  103  4e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1957  peptidase T  26.34 
 
 
409 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.355866  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2069  peptidase T  24.76 
 
 
423 aa  103  5e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2139  peptidase T  26.1 
 
 
409 aa  103  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.359418  normal  0.0575573 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1328  peptidase T  26.34 
 
 
409 aa  102  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.245439 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1344  peptidase T  26.34 
 
 
409 aa  102  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.595235 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1712  peptidase T  24.76 
 
 
411 aa  100  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1863  peptidase T  25.12 
 
 
410 aa  100  4e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.264839  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2858  peptidase T  24.76 
 
 
411 aa  100  6e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1605  peptidase T  24.76 
 
 
411 aa  99.8  7e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.888107  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6480  peptidase T  25.6 
 
 
414 aa  99  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.800823  normal  0.627167 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2574  peptidase T  24.45 
 
 
411 aa  97.8  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2148  peptidase T  25.3 
 
 
410 aa  95.9  9e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.32908  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1936  peptidase T  23.76 
 
 
423 aa  95.9  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1595  peptidase T  23.97 
 
 
410 aa  94  4e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.782792  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05384  peptidase T  26.57 
 
 
413 aa  93.2  7e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0925  peptidase T  26.23 
 
 
401 aa  91.3  3e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000393366  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000506  tripeptide aminopeptidase  26.46 
 
 
412 aa  91.3  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3250  peptidase T  25 
 
 
409 aa  90.5  4e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124767  normal  0.62095 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0029  peptidase T  25.36 
 
 
406 aa  89.7  8e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1115  peptidase T  26.06 
 
 
418 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0029  peptidase T  25.6 
 
 
406 aa  89  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08441  peptidase T  24.16 
 
 
415 aa  89  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2425  peptidase T  23.04 
 
 
420 aa  88.6  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.91324  normal  0.989219 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0166  peptidase T  23.99 
 
 
414 aa  86.7  7e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4149  peptidase T  25.36 
 
 
410 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.652019  normal  0.399065 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2943  peptidase T  24.4 
 
 
407 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2411  peptidase T  23.87 
 
 
410 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.825579  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1922  peptidase T  25.79 
 
 
411 aa  85.1  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0529  peptidase T  24.15 
 
 
408 aa  84.3  0.000000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00086333  normal  0.062594 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0800  peptidase T  26.46 
 
 
407 aa  83.6  0.000000000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4565  peptidase T  24.21 
 
 
418 aa  82.8  0.000000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.36314 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4006  peptidase T  25.54 
 
 
409 aa  82.8  0.000000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000311965 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3512  peptidase T  22.93 
 
 
410 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.822323  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0895  peptidase M20  24.16 
 
 
372 aa  82.4  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.111399  normal  0.0352819 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2030  peptidase M42 family protein  35.77 
 
 
439 aa  82  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0155  peptidase T  23.73 
 
 
420 aa  82  0.00000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1456  peptidase T  22.44 
 
 
410 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000103305 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4406  peptidase T  25.55 
 
 
414 aa  81.3  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.554315  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001112  acetylornithine deacetylase  26.89 
 
 
374 aa  80.9  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>