176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2243 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_2243  Pectate lyase/Amb allergen  100 
 
 		 462 aa  943    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0247929  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2179  Pectate lyase/Amb allergen  57.68 
 
 		 922 aa  500  1e-140  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0431  Pectate lyase/Amb allergen  51.34 
 
 		 527 aa  301  1e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.471187  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3448  Pectate lyase-like  37.17 
 
 		 594 aa  224  2e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.372442  hitchhiker  0.00149155 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0943  ribosomal protein S5  37.57 
 
 		 1316 aa  192  1e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000215001 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0942  ribosomal protein L18  36.32 
 
 		 769 aa  191  2.9999999999999997e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000113865  hitchhiker  0.00163221 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2168  pectate lyase  34.27 
 
 		 512 aa  173  5.999999999999999e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.108445  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2941  Pectate lyase/Amb allergen  32.84 
 
 		 501 aa  159  8e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.12002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0430  Pectate lyase/Amb allergen  39.02 
 
 		 335 aa  157  5.0000000000000005e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.202776  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3958  Pectate lyase/Amb allergen  34.74 
 
 		 365 aa  156  7e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0511  Pectate lyase/Amb allergen  33.52 
 
 		 365 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000797817  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07646  Pectate lyasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AVN4]  44.08 
 
 		 327 aa  140  6e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.91565  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00741  Pectate lyase Precursor (EC 4.2.2.2) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00645]  35.62 
 
 		 326 aa  130  5.0000000000000004e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1848  Pectate lyase/Amb allergen  33.33 
 
 		 317 aa  125  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.233654  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2950  Pectate lyase/Amb allergen  29.64 
 
 		 554 aa  123  6e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.821566  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2436  Pectate lyase/Amb allergen  35.37 
 
 		 327 aa  123  7e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00169439  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1089  Pectate lyase/Amb allergen  34.04 
 
 		 385 aa  122  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0435  Pectate lyase/Amb allergen  31.25 
 
 		 375 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.017738  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0352  Pectate lyase/Amb allergen  36.93 
 
 		 375 aa  121  3e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3858  Pectate lyase/Amb allergen  29.59 
 
 		 374 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0353  Pectate lyase/Amb allergen  28.93 
 
 		 376 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6915  Pectate lyase-like protein  33.73 
 
 		 482 aa  116  8.999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3860  Pectate lyase/Amb allergen  27.67 
 
 		 374 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0270  Pectate lyase/Amb allergen  30.11 
 
 		 375 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.372341  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0496  Pectinesterase  30.12 
 
 		 686 aa  114  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00164542 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4035  Pectate lyase/Amb allergen  27.82 
 
 		 374 aa  114  5e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.634971  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4036  Pectate lyase/Amb allergen  28.37 
 
 		 374 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3859  Pectate lyase/Amb allergen  28.37 
 
 		 374 aa  111  3e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1231  Pectate lyase/Amb allergen  28.65 
 
 		 919 aa  111  3e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.218309  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4037  Pectate lyase/Amb allergen  26.63 
 
 		 374 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0271  Pectate lyase/Amb allergen  27.64 
 
 		 375 aa  108  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.919871  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1612  Pectate lyase/Amb allergen  34.09 
 
 		 1409 aa  108  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5013  Pectate lyase/Amb allergen  31.3 
 
 		 427 aa  99  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1493  pectate lyase  31.67 
 
 		 435 aa  99  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6139  Pectate lyase  25.62 
 
 		 380 aa  99  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4964  Pectinesterase  28.18 
 
 		 794 aa  98.2  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467463  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1090  Pectate lyase/Amb allergen  29.39 
 
 		 405 aa  96.3  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2764  Pectate lyase/Amb allergen  29.55 
 
 		 402 aa  95.9  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.429805  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2763  Pectate lyase/Amb allergen  29.15 
 
 		 397 aa  95.1  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.329046  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1843  Pectate lyase/Amb allergen  28.85 
 
 		 730 aa  92.4  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.5236  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1162  pectate lyase  27.79 
 
 		 991 aa  92.8  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2863  Pectate lyase/Amb allergen  27.19 
 
 		 522 aa  92.8  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.707547  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4199  Ricin B lectin  26.46 
 
 		 474 aa  91.7  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876848  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02650  pectate lyase  28.96 
 
 		 346 aa  91.7  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.256465  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3461  cellulose-binding family II protein  30.38 
 
 		 486 aa  91.3  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2566  Pectate lyase/Amb allergen  29.7 
 
 		 368 aa  90.9  5e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0537  Pectate lyase/Amb allergen  27.07 
 
 		 351 aa  87.8  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1236  protein of unknown function DUF1680  59.7 
 
 		 955 aa  86.3  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00269962  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0153  pectate lyase/Amb allergen  31.84 
 
 		 449 aa  84.7  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1087  pectate lyase/Amb allergen  29.52 
 
 		 436 aa  84  0.000000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0821757  hitchhiker  0.00617992 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1178  Pectate lyase/Amb allergen  28.57 
 
 		 498 aa  80.9  0.00000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000219225 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0495  Pectate lyase/Amb allergen  30.99 
 
 		 427 aa  78.2  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.016328 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3434  Pectate lyase/Amb allergen  30 
 
 		 504 aa  77  0.0000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.405383 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0132  Pectate lyase/Amb allergen  24.93 
 
 		 505 aa  72.8  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.54059 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2337  glycoside hydrolase family 5  51.52 
 
 		 539 aa  72.4  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3821  Pectate lyase/Amb allergen  26.92 
 
 		 456 aa  71.6  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1091  Pectate lyase/Amb allergen  25.78 
 
 		 392 aa  69.3  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1298  glycoside hydrolase family 8  48.05 
 
 		 477 aa  68.6  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000471564  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1240  Carbohydrate binding family 6  42.86 
 
 		 780 aa  68.6  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000268081  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1371  Pectate lyase/Amb allergen  28.84 
 
 		 314 aa  68.9  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00120054  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1230  Carbohydrate binding family 6  42.86 
 
 		 541 aa  67.8  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000323294  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1234  Carbohydrate binding family 6  44.29 
 
 		 536 aa  65.9  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.115461  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1777  Pectate lyase/Amb allergen  27.76 
 
 		 314 aa  65.9  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0286  polysaccharide deacetylase  52.24 
 
 		 308 aa  65.9  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.350747  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2017  lipolytic protein G-D-S-L family  49.23 
 
 		 303 aa  65.1  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0731  glycoside hydrolase family 9  44.29 
 
 		 725 aa  65.1  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1060  cellulosome protein dockerin type I  50.75 
 
 		 295 aa  64.7  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1239  Carbohydrate binding family 6  44.62 
 
 		 1015 aa  63.2  0.000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000298242  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0536  glycoside hydrolase family protein  40.96 
 
 		 563 aa  62.8  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000215938  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2162  lipolytic protein G-D-S-L family  42.86 
 
 		 436 aa  61.6  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1648  glycoside hydrolase family 9  46.03 
 
 		 949 aa  61.6  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.230883  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2395  lipolytic protein G-D-S-L family  46.15 
 
 		 311 aa  61.2  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00016801  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1231  Carbohydrate binding family 6  46.38 
 
 		 524 aa  60.8  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0177163  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0729  glycoside hydrolase family 48  52.73 
 
 		 722 aa  60.5  0.00000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000900741  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0412  glycoside hydrolase family protein  40.28 
 
 		 895 aa  60.1  0.00000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000331233  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2089  glycoside hydrolase family protein  41.18 
 
 		 741 aa  59.3  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000609917  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1101  Spore coat protein CotH  39.47 
 
 		 621 aa  59.7  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0649  cellulosome protein dockerin type I  45.45 
 
 		 532 aa  59.7  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0734  glycoside hydrolase family 9  51.79 
 
 		 737 aa  59.7  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1207  cellulosome protein dockerin type I  42.47 
 
 		 873 aa  58.5  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1809  cellulosome protein dockerin type I  44.78 
 
 		 316 aa  58.9  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.320363  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1099  glycoside hydrolase family 5  45.33 
 
 		 475 aa  58.5  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0931  glycoside hydrolase family 10  38.89 
 
 		 423 aa  58.5  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.514764  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1655  cellulosome protein dockerin type I  44.78 
 
 		 435 aa  57.8  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000388378  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0735  glycoside hydrolase family 9  46.55 
 
 		 757 aa  57.8  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15204  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0269  glycoside hydrolase family protein  40.98 
 
 		 477 aa  57.4  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.275199  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04882  pectin lyase (Eurofung)  25.69 
 
 		 464 aa  57  0.0000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.485233 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0732  glycoside hydrolase family 9  45.16 
 
 		 885 aa  57  0.0000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1237  Carbohydrate binding family 6  38.81 
 
 		 604 aa  56.6  0.0000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0649618  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0840  glycoside hydrolase family 5  50.88 
 
 		 584 aa  56.6  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1400  glycosyl hydrolase 53  38.61 
 
 		 415 aa  55.8  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.195161  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2811  glycoside hydrolase family protein  36.17 
 
 		 591 aa  56.2  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0417  cellulosome protein dockerin type I  41.79 
 
 		 848 aa  56.2  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000135998  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1233  Carbohydrate binding family 6  41.27 
 
 		 746 aa  56.6  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.555313  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1238  Carbohydrate binding family 6  40.32 
 
 		 1122 aa  55.8  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000137164  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2530  Ricin B lectin  47.62 
 
 		 412 aa  55.5  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00551776  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0379  protein of unknown function DUF291  42.25 
 
 		 732 aa  55.5  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3839  type III helper protein HopAK1  23.99 
 
 		 543 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0211  glycoside hydrolase family protein  30.56 
 
 		 334 aa  53.9  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00263756  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1229  Carbohydrate binding family 6  40.58 
 
 		 535 aa  54.3  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.166566  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>